UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1MSH6n/a
n/a
n/a
n/a
0chr2 48,022,188Component of the post-replicative DNA mismatch repair system  (MMR). Heterodimerizes with MSH2 to form MutS alpha, which binds to DNA  mismatches thereby initiating DNA repair. When bound, MutS alpha bends  the DNA helix and shields approximately 20 base pairs, and recognizes  single base mismatches and dinucleotide insertion-deletion loops (IDL)  in the DNA. After mismatch binding, forms a ternary complex with the  MutL alpha heterodimer, which is thought to be responsible for  directing the downstream MMR events, including strand discrimination,  excision, and resynthesis. ATP binding and hydrolysis play a pivotal  role in mismatch repair functions. The ATPase activity associated with  MutS alpha regulates binding similar to a molecular switch: mismatched  DNA provokes ADP-->ATP exchange, resulting in a discernible  conformational transition that converts MutS alpha into a sliding clamp  capable of hydrolysis-independent diffusion along the DNA backbone.  This transition is crucial for mismatch repair. MutS alpha may also  play a role in DNA homologous recombination repair. Recruited on  chromatin in G1 and early S phase via its PWWP domain that specifically  binds trimethylated 'Lys-36' of histone H3 (H3K36me3): early  recruitment to chromatin to be replicated allowing a quick  identification of mismatch repair to initiate the DNA mismatch repair  reaction. (from UniProt P52701)