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1PHO2YDL106C529n/achrIV 271,061Homeobox transcription factor  regulatory targets include genes involved in phosphate metabolism  binds cooperatively with Pho4p to the PHO5 promoter  phosphorylation of Pho2p facilitates interaction with Pho4p
2PHO4YFR034C529n/achrVI 225,489Basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor of the myc-family  activates transcription cooperatively with Pho2p in response to phosphate limitation  binding to 'CACGTG' motif is regulated by chromatin restriction, competitive binding of Cbf1p to the same DNA binding motif and cooperation with Pho2p,  function is regulated by phosphorylation at multiple sites and by phosphate availability
3YOR302WYOR302W529n/achrXV 882,803CPA1 uORF, Arginine attenuator peptide, regulates translation of the CPA1 mRNA
4MUC1YIR019C529n/achrIX 391,623GPI-anchored cell surface glycoprotein (flocculin) required for pseudohyphal formation, invasive growth, flocculation, and biofilms  transcriptionally regulated by the MAPK pathway (via Ste12p and Tec1p) and the cAMP pathway (via Flo8p)
5SWI1YPL016W529n/achrXVI 522,986Subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex, which regulates transcription by remodeling chromosomes  required for transcription of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2  can form the prion [SWI+]
6SFL1YOR140W529n/achrXV 588,131Transcriptional repressor and activator  involved in repression of flocculation-related genes, and activation of stress responsive genes  negatively regulated by cAMP-dependent protein kinase A subunit Tpk2p
7SPO11YHL022C529n/achrVIII 63,559Meiosis-specific protein that initiates meiotic recombination by catalyzing the formation of double-strand breaks in DNA via a transesterification reaction  required for homologous chromosome pairing and synaptonemal complex formation
8SPO13YHR014W529n/achrVIII 132,484Meiosis-specific protein, involved in maintaining sister chromatid cohesion during meiosis I as well as promoting proper attachment of kinetochores to the spindle during meiosis I and meiosis II
9RER1YCL001W529n/achrIII 112,199Protein involved in retention of membrane proteins, including Sec12p, in the ER  localized to Golgi  functions as a retrieval receptor in returning membrane proteins to the ER
10YCL073CYCL073C529n/achrIII 7,402Proton:glutathione antiporter localized to the vacuolar and plasma membranes  imports glutathione from the vacuole and exports it through the plasma membrane  has a role in resistance to oxidative stress and modulation of the PKA pathway
11RIF1YBR275C529n/achrII 754,231Protein that binds to the Rap1p C-terminus and acts synergistically with Rif2p to help control telomere length and establish telomeric silencing  deletion results in telomere elongation
12HXT3YDR345C529n/achrIV 1,163,808Low affinity glucose transporter of the major facilitator superfamily, expression is induced in low or high glucose conditions
13NIP100YPL174C529n/achrXVI 221,470Large subunit of the dynactin complex, which is involved in partitioning the mitotic spindle between mother and daughter cells  putative ortholog of mammalian p150(glued)
14MSN2YMR037C529n/achrXIII 345,460Transcriptional activator related to Msn4p  activated in stress conditions, which results in translocation from the cytoplasm to the nucleus  binds DNA at stress response elements of responsive genes, inducing gene expression
15GIP1YBR045C529n/achrII 329,132Meiosis-specific regulatory subunit of the Glc7p protein phosphatase, regulates spore wall formation and septin organization, required for expression of some late meiotic genes and for normal localization of Glc7p
16RCK1YGL158W529n/achrVII 207,802Protein kinase involved in the response to oxidative stress  identified as suppressor of S. pombe cell cycle checkpoint mutations
17ARN1YHL040C529n/achrVIII 20,029Transporter, member of the ARN family of transporters that specifically recognize siderophore-iron chelates  responsible for uptake of iron bound to ferrirubin, ferrirhodin, and related siderophores
18RTT107YHR154W529n/achrVIII 404,572Protein implicated in Mms22-dependent DNA repair during S phase  involved in recruiting the SMC5/6 complex to double-strand breaks  DNA damage induces phosphorylation by Mec1p at one or more SQ/TQ motifs  interacts with Mms22p and Slx4p  has four BRCT domains  has a role in regulation of Ty1 transposition
19GDH3YAL062W529n/achrI 32,253NADP(+)-dependent glutamate dehydrogenase, synthesizes glutamate from ammonia and alpha-ketoglutarate  rate of alpha-ketoglutarate utilization differs from Gdh1p  expression regulated by nitrogen and carbon sources
20OAF1YAL051W529n/achrI 50,135Oleate-activated transcription factor, acts alone and as a heterodimer with Pip2p  activates genes involved in beta-oxidation of fatty acids and peroxisome organization and biogenesis
21YER130CYER130C529n/achrV 421,780Protein of unknown function  transcription is regulated by Haa1p, Sok2p and Zap1p transcriptional activators  the C. Albicans homolog (MNL1) plays a role in adaptation to stress
22YTA6YPL074W529n/achrXVI 416,895Putative ATPase of the CDC48/PAS1/SEC18 (AAA) family, localized to the cortex of mother cells but not to daughter cells
23HAC1YFL031W529n/achrVI 75,663Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor (ATF/CREB1 homolog) that regulates the unfolded protein response, via UPRE binding, and membrane biogenesis  ER stress-induced splicing pathway facilitates efficient Hac1p synthesis
24SHR5YOL110W529n/achrXV 109,532Subunit of a palmitoyltransferase, composed of Shr5p and Erf2p, that adds a palmitoyl lipid moiety to heterolipidated substrates such as Ras1p and Ras2p through a thioester linkage  palmitoylation is required for Ras2p membrane localization
25ZAP1YJL056C529n/achrX 331,752Zinc-regulated transcription factor  binds to zinc-responsive promoters to induce transcription of certain genes in presence of zinc, represses other genes in low zinc  regulates its own transcription  contains seven zinc-finger domains
26ASK10YGR097W529n/achrVII 680,415Component of RNA polymerase II holoenzyme, phosphorylated in response to oxidative stress  has a role in destruction of Ssn8p  proposed to function in activation of the glycerol channel Fps1p  paralogous to Rgc1p
27PSP2YML017W529n/achrXIII 237,659Asn rich cytoplasmic protein that contains RGG motifs  high-copy suppressor of group II intron-splicing defects of a mutation in MRS2 and of a conditional mutation in POL1 (DNA polymerase alpha)  possible role in mitochondrial mRNA splicing
28SOK2YMR016C529n/achrXIII 304,414Nuclear protein that plays a regulatory role in the cyclic AMP (cAMP)-dependent protein kinase (PKA) signal transduction pathway  negatively regulates pseudohyphal differentiation  homologous to several transcription factors
29THO2YNL139C529n/achrXIV 363,320Subunit of the THO complex, which is required for efficient transcription elongation and involved in transcriptional elongation-associated recombination  required for LacZ RNA expression from certain plasmids
30BIO4YNR057C529n/achrXIV 733,712Dethiobiotin synthetase, catalyzes the third step in the biotin biosynthesis pathway  BIO4 is in a cluster of 3 genes (BIO3, BIO4, and BIO5) that mediate biotin synthesis  expression appears to be repressed at low iron levels
31ATG2YNL242W529n/achrXIV 193,713Peripheral membrane protein required for vesicle formation during autophagy, pexophagy, and the cytoplasm-to-vaucole targeting (Cvt) pathway  involved in Atg9p cycling between the phagophore assembly site and mitochondria
32ULP1YPL020C529n/achrXVI 513,245Protease that specifically cleaves Smt3p protein conjugates  required for cell cycle progression  associates with nucleoporins and may interact with septin rings during telophase  sequestered to the nucleolus under stress conditions
33IRC15YPL017C529n/achrXVI 519,483Microtubule associated protein  regulates microtubule dynamics  required for accurate meiotic chromosome segregation  null mutant displays large budded cells due to delayed mitotic progression, increased levels of spontaneous Rad52 foci
34UME1YPL139C529n/achrXVI 290,360Negative regulator of meiosis, required for repression of a subset of meiotic genes during vegetative growth, binding of histone deacetylase Rpd3p required for activity, contains a NEE box and a WD repeat motif  homologous with Wtm1p, Wtm2p
35ECM5YMR176W529n/achrXIII 613,857Non-essential protein of unknown function, contains ATP/GTP-binding site motif A  null mutant exhibits cellular volume up to four times greater than wild-type, also large drooping buds with elongated necks
36WAR1YML076C529n/achrXIII 113,930Homodimeric Zn2Cys6 zinc finger transcription factor  binds to a weak acid response element to induce transcription of PDR12 and FUN34, encoding an acid transporter and a putative ammonia transporter, respectively
37SCC2YDR180W529n/achrIV 823,535Subunit of cohesin loading factor (Scc2p-Scc4p), a complex required for loading of cohesin complexes onto chromosomes  involved in establishing sister chromatid cohesion during DSB repair via histone H2AX  evolutionarily-conserved adherin
38CDA2YLR308W529n/achrXII 748,406Chitin deacetylase, together with Cda1p involved in the biosynthesis ascospore wall component, chitosan  required for proper rigidity of the ascospore wall
39YOR378WYOR378W529n/achrXV 1,050,284Putative paralog of ATR1, but not required for boron tolerance  member of the DHA2 family of drug:H+ antiporters  YOR378W is not an essential gene
40YDL109CYDL109C5290chrIV 266,229Putative lipase  involved in lipid metabolism  YDL109C is not an essential gene
41RLM1YPL089C529n/achrXVI 380,135MADS-box transcription factor, component of the protein kinase C-mediated MAP kinase pathway involved in the maintenance of cell integrity  phosphorylated and activated by the MAP-kinase Slt2p
42DNF3YMR162C529n/achrXIII 581,436Aminophospholipid translocase (flippase) that maintains membrane lipid asymmetry in post-Golgi secretory vesicles  localizes to the trans-Golgi network  likely involved in protein transport  type 4 P-type ATPase
43YKL044WYKL044W529n/achrXI 356,482Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, based on available experimental and comparative sequence data