Affine Alignment
 
Alignment between COPA (top ENST00000241704.8_8 1224aa) and COPA (bottom ENST00000241704.8_8 1224aa) score 123139

0001 MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFH 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MLTKFETKSARVKGLSFHPKRPWILTSLHNGVIQLWDYRMCTLIDKFDEHDGPVRGIDFH 0060

0061 KQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVW 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 KQQPLFVSGGDDYKIKVWNYKLRRCLFTLLGHLDYIRTTFFHHEYPWILSASDDQTIRVW 0120

0121 NWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPTEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESD 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 NWQSRTCVCVLTGHNHYVMCAQFHPTEDLVVSASLDQTVRVWDISGLRKKNLSPGAVESD 0180

0181 VRGITGVDLFGTTDAVVKHVLEGHDRGVNWAAFHPTMPLIVSGADDRQVKIWRMNESKAW 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 VRGITGVDLFGTTDAVVKHVLEGHDRGVNWAAFHPTMPLIVSGADDRQVKIWRMNESKAW 0240

0241 EVDTCRGHYNNVSCAVFHPRQELILSNSEDKSIRVWDMSKRTGVQTFRRDHDRFWVLAAH 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 EVDTCRGHYNNVSCAVFHPRQELILSNSEDKSIRVWDMSKRTGVQTFRRDHDRFWVLAAH 0300

0301 PNLNLFAAGHDGGMIVFKLERERPAYAVHGNMLHYVKDRFLRQLDFNSSKDVAVMQLRSG 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 PNLNLFAAGHDGGMIVFKLERERPAYAVHGNMLHYVKDRFLRQLDFNSSKDVAVMQLRSG 0360

0361 SKFPVFNMSYNPAENAVLLCTRASNLENSTYDLYTIPKDADSQNPDAPEGKRSSGLTAVW 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 SKFPVFNMSYNPAENAVLLCTRASNLENSTYDLYTIPKDADSQNPDAPEGKRSSGLTAVW 0420

0421 VARNRFAVLDRMHSLLIKNLKNEITKKVQVPNCDEIFYAGTGNLLLRDADSITLFDVQQK 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 VARNRFAVLDRMHSLLIKNLKNEITKKVQVPNCDEIFYAGTGNLLLRDADSITLFDVQQK 0480

0481 RTLASVKISKVKYVIWSADMSHVALLAKHAIVICNRKLDALCNIHENIRVKSGAWDESGV 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 RTLASVKISKVKYVIWSADMSHVALLAKHAIVICNRKLDALCNIHENIRVKSGAWDESGV 0540

0541 FIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFK 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 FIYTTSNHIKYAVTTGDHGIIRTLDLPIYVTRVKGNNVYCLDRECRPRVLTIDPTEFKFK 0600

0601 LALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEI 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 LALINRKYDEVLHMVRNAKLVGQSIIAYLQKKGYPEVALHFVKDEKTRFSLALECGNIEI 0660

0661 ALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMM 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 ALEAAKALDDKNCWEKLGEVALLQGNHQIVEMCYQRTKNFDKLSFLYLITGNLEKLRKMM 0720

0721 KIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDP 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 KIAEIRKDMSGHYQNALYLGDVSERVRILKNCGQKSLAYLTAATHGLDEEAESLKETFDP 0780

0781 EKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGTIASKGKGGALAADIDIDTV 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 EKETIPDIDPNAKLLQPPAPIMPLDTNWPLLTVSKGFFEGTIASKGKGGALAADIDIDTV 0840

0841 GTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLELPPELDISPGAAG 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 GTEGWGEDAELQLDEDGFVEATEGLGDDALGKGQEEGGGWDVEEDLELPPELDISPGAAG 0900

0901 GAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVIQFGPYKQLFL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 GAEDGFFVPPTKGTSPTQIWCNNSQLPVDHILAGSFETAMRLLHDQVGVIQFGPYKQLFL 0960

0961 QTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKDAGLKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVG 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 QTYARGRTTYQALPCLPSMYGYPNRNWKDAGLKNGVPAVGLKLNDLIQRLQLCYQLTTVG 1020

1021 KFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSVETERKKLPKETLEQ 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 KFEEAVEKFRSILLSVPLLVVDNKQEIAEAQQLITICREYIVGLSVETERKKLPKETLEQ 1080

1081 QKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQ 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 QKRICEMAAYFTHSNLQPVHMILVLRTALNLFFKLKNFKTAATFARRLLELGPKPEVAQQ 1140

1141 TRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFKGQI 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 TRKILSACEKNPTDAYQLNYDMHNPFDICAASYRPIYRGKPVEKCPLSGACYSPEFKGQI 1200

1201 CRVTTVTEIGKDVIGLRISPLQFR 1224
     ||||||||||||||||||||||||
1201 CRVTTVTEIGKDVIGLRISPLQFR 1224