UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1T04G9.6T04G9.60chrX 783,076contains similarity to Interpro domain IPR001759 (Pentaxin)
2srt-36F47D2.5n/achrV 4,267,330C. elegans SRT-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
3C23H4.4C23H4.4n/achrX 12,231,444contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR000062 (Thymidylate kinase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
4str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5srh-241F37B4.6n/achrV 2,868,696C. elegans SRH-241 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
6T02G6.4T02G6.4n/achrI 11,811,897contains similarity to Buchnera aphidicola RpoD protein (EC 2.7.7.6).; TR:Q89AY7
7K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
8bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
9F56F3.3F56F3.3n/achrIII 4,458,938contains similarity to Drosophila dasycnemia Wingless (Fragment).; TR:O46305
10sru-35C33D9.4n/achrIV 8,789,328C. elegans SRU-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
11C49A1.1C49A1.1n/achrI 14,214,978contains similarity to Homo sapiens Plasminogen-related protein B precursor; ENSEMBL:ENSP00000245705
12clec-39T25E12.7n/achrV 16,740,408C. elegans CLEC-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
13F14D2.6F14D2.6n/achrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
14W09D10.4W09D10.4n/achrIII 10,713,760contains similarity to Pfam domain PF07228 Stage II sporulation protein E (SpoIIE) contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR010822 (Sporulation stage II, protein E C-terminal)
15F36D4.6F36D4.6n/achrV 9,427,160
16C17A2.7C17A2.7n/achrII 3,842,652contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domains IPR004101 (Mur ligase, C-terminal), IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
18F49D11.7F49D11.7n/achrI 10,923,733
19W02D9.9W02D9.9n/achrI 12,557,310contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter).; TR:Q8AAL0
20srsx-38T26E4.14n/achrV 15,806,689C. elegans SRSX-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21C25D7.9C25D7.9n/achrV 15,065,202
22tbx-38C24H11.3n/achrIII 11,785,014tbx-38 encodes a T box transcription factor; during embryonic development, tbx-38 functions redundantly with tbx-37 to effect Notch-mediated pharyngeal mesoderm induction in descendants of the ABa blastomere; in addition, tbx-38 and tbx-37 are required for proper cell fate specification of other ABa descendants, such as those that give rise to hypodermal tissue; TBX-38 expression appears to be limited to the 8 ABa descendents at the 24-cell stage of embryogenesis, with expression diminishing markedly during the next cell cycle; negative regulation of TBX-38 expression in ABp descendants depends upon Notch signaling, while negative regulation of expression in EMS descendents is likely controlled, in part, by ref-1 and unc-37, which encode bHLH and Groucho-like proteins, respectively.
23M70.5M70.5n/achrIV 2,270,286contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001258 (NHL repeat)
24gnrr-3ZC374.1n/achrX 10,050,904C. elegans GNRR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25C29G2.6C29G2.6n/achrV 2,584,386
26scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
27W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
28ZK402.2ZK402.2n/achrX 1,403,926contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
29C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
30hlh-4T05G5.2n/achrIII 9,738,064C. elegans HLH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015660 (Achaete-scute transcription factor related), IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
31lgc-32T19D7.1n/achrX 674,438C. elegans LGC-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
32F29A7.4F29A7.4n/achrII 2,750,080contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C2orf32; ENSEMBL:ENSP00000263655
33C13C4.6C13C4.6n/achrV 12,123,359contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
34ric-19C32E8.7n/achrI 3,779,897The ric-19 gene encodes an evolutionarily conserved cytosolic protein involved in neuroendocrine secretion via association with secretory vesicles.
35srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
36skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
37sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38nhr-221T24A6.8n/achrV 3,534,117C. elegans NHR-221 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
39Y37D8A.22Y37D8A.22n/achrIII 12,937,773contains similarity to Danio rerio Transmembrane protein 49.; SW:Q6NYY9
40srt-12E03D2.4n/achrV 4,241,727C. elegans SRT-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
41Y38H6A.3Y38H6A.3n/achrV 20,342,053contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
42clec-240F49H6.1n/achrV 17,011,082C. elegans CLEC-240 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43fbxb-13C08F1.3n/achrII 1,789,688This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
44srt-6R13D7.10n/achrV 7,408,161C. elegans SRT-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
45K08E3.2K08E3.2n/achrIII 13,747,959contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
46clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
47cyp-13B2K06G5.2n/achrX 14,227,001C. elegans CYP-13B2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
48K09H11.4K09H11.4n/achrV 5,724,796contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
49F22E5.2F22E5.2n/achrII 2,665,821
50str-57T06C12.2n/achrV 15,871,734C. elegans STR-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)