Affine Alignment
 
Alignment between APOA4 (top ENST00000357780.5_7 396aa) and APOA4 (bottom ENST00000357780.5_7 396aa) score 37449

001 MFLKAVVLTLALVAVAGARAEVSADQVATVMWDYFSQLSNNAKEAVEHLQKSELTQQLNA 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MFLKAVVLTLALVAVAGARAEVSADQVATVMWDYFSQLSNNAKEAVEHLQKSELTQQLNA 060

061 LFQDKLGEVNTYAGDLQKKLVPFATELHERLAKDSEKLKEEIGKELEELRARLLPHANEV 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 LFQDKLGEVNTYAGDLQKKLVPFATELHERLAKDSEKLKEEIGKELEELRARLLPHANEV 120

121 SQKIGDNLRELQQRLEPYADQLRTQVSTQAEQLRRQLTPYAQRMERVLRENADSLQASLR 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 SQKIGDNLRELQQRLEPYADQLRTQVSTQAEQLRRQLTPYAQRMERVLRENADSLQASLR 180

181 PHADELKAKIDQNVEELKGRLTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEG 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 PHADELKAKIDQNVEELKGRLTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEG 240

241 LTFQMKKNAEELKARISASAEELRQRLAPLAEDVRGNLRGNTEGLQKSLAELGGHLDQQV 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 LTFQMKKNAEELKARISASAEELRQRLAPLAEDVRGNLRGNTEGLQKSLAELGGHLDQQV 300

301 EEFRRRVEPYGENFNKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDKVNSFFSTFKE 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EEFRRRVEPYGENFNKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDKVNSFFSTFKE 360

361 KESQDKTLSLPELEQQQEQQQEQQQEQVQMLAPLES 396
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 KESQDKTLSLPELEQQQEQQQEQQQEQVQMLAPLES 396