Affine Alignment
  
Alignment between HLA-DOA (top ENST00000229829.7_7 250aa) and HLA-DOA (bottom ENST00000229829.7_7 250aa) score 25004

001 MALRAGLVLGFHTLMTLLSPQEAGATKADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDEEQLFSV 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MALRAGLVLGFHTLMTLLSPQEAGATKADHMGSYGPAFYQSYGASGQFTHEFDEEQLFSV 060

061 DLKKSEAVWRLPEFGDFARFDPQGGLAGIAAIKAHLDILVERSNRSRAINVPPRVTVLPK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 DLKKSEAVWRLPEFGDFARFDPQGGLAGIAAIKAHLDILVERSNRSRAINVPPRVTVLPK 120

121 SRVELGQPNILICIVDNIFPPVINITWLRNGQTVTEGVAQTSFYSQPDHLFRKFHYLPFV 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 SRVELGQPNILICIVDNIFPPVINITWLRNGQTVTEGVAQTSFYSQPDHLFRKFHYLPFV 180

181 PSAEDVYDCQVEHWGLDAPLLRHWELQVPIPPPDAMETLVCALGLAIGLVGFLVGTVLII 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 PSAEDVYDCQVEHWGLDAPLLRHWELQVPIPPPDAMETLVCALGLAIGLVGFLVGTVLII 240

241 MGTYVSSVPR 250
    ||||||||||
241 MGTYVSSVPR 250