Affine Alignment
 
Alignment between VPS11 (top ENST00000621676.5_4 939aa) and VPS11 (bottom ENST00000621676.5_4 939aa) score 94202

001 MAAYLQWRRFVFFDKELVKEPLSNDGAAPGATPASGSAASKFLCLPPGITVCDSGRGSLV 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MAAYLQWRRFVFFDKELVKEPLSNDGAAPGATPASGSAASKFLCLPPGITVCDSGRGSLV 060

061 FGDMEGQIWFLPRYSLQASKPTNYGXHTCTNXSSTIFWHLLEKMKRASTPVKIWNLEKRD 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 FGDMEGQIWFLPRYSLQASKPTNYGXHTCTNXSSTIFWHLLEKMKRASTPVKIWNLEKRD 120

121 GGNPLCTRIFPAIPGTEPTVVSCLTVHENLNFMAIGFTDGSVTLNKGDITRDRHSKTQIL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 GGNPLCTRIFPAIPGTEPTVVSCLTVHENLNFMAIGFTDGSVTLNKGDITRDRHSKTQIL 180

181 HKGNYPVTGLAFRQAGKTTHLFVVTTENVQSYIVSGKDYPRVELDTHGCGLRCSALSDPS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 HKGNYPVTGLAFRQAGKTTHLFVVTTENVQSYIVSGKDYPRVELDTHGCGLRCSALSDPS 240

241 QDLQFIVAGDECVYLYQPDERGPCFAFEGHKLIAHWFRGYLIIVSRDRKVSPKSEFTSRD 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 QDLQFIVAGDECVYLYQPDERGPCFAFEGHKLIAHWFRGYLIIVSRDRKVSPKSEFTSRD 300

301 SQSSDKQILNIYDLCNKFIAYSTVFEDVVDVLAEWGSLYVLTRDGRVHALQEKDTQTKLE 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 SQSSDKQILNIYDLCNKFIAYSTVFEDVVDVLAEWGSLYVLTRDGRVHALQEKDTQTKLE 360

361 MLFKKNLFEMAINLAKSQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYSKGNHDGAVQQYIRTIGKLEPSY 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 MLFKKNLFEMAINLAKSQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYSKGNHDGAVQQYIRTIGKLEPSY 420

421 VIRKFLDAQRIHNLTAYLQTLHRQSLANADHTTLLLNCYTKLKDSSKLEEFIKKKSESEV 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 VIRKFLDAQRIHNLTAYLQTLHRQSLANADHTTLLLNCYTKLKDSSKLEEFIKKKSESEV 480

481 HFDVETAIKVLRQAGYYSHALYLAENHAHHEWYLKIQLEDIKNYQEALRYIGKLPFEQAE 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 HFDVETAIKVLRQAGYYSHALYLAENHAHHEWYLKIQLEDIKNYQEALRYIGKLPFEQAE 540

541 SNMKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGRSDREAPGCRANSEEFIPIFANNPR 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 SNMKRYGKILMHHIPEQTTQLLKGLCTDYRPSLEGRSDREAPGCRANSEEFIPIFANNPR 600

601 ELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWAHEKDPQVKEKLHAEAISLLKSGRFCDV 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 ELKAFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELRLQNWAHEKDPQVKEKLHAEAISLLKSGRFCDV 660

661 FDKALVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHEQYRQVISVCERHGEQDPSLWEQ 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 FDKALVLCQMHDFQDGVLYLYEQGKLFQQIMHYHMQHEQYRQVISVCERHGEQDPSLWEQ 720

721 ALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSVIRDYLVQKLQKQ 780
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 ALSYFARKEEDCKEYVAAVLKHIENKNLMPPLLVVQTLAHNSTATLSVIRDYLVQKLQKQ 780

781 SQQIAQDELRVRRYREETTRIRQEIQELKASPKIFQKTKCSICNSALELPSVHFLCGHSF 840
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
781 SQQIAQDELRVRRYREETTRIRQEIQELKASPKIFQKTKCSICNSALELPSVHFLCGHSF 840

841 HQHCFESYSESDADCPTCLPENRKVMDMIRAQEQKRDLHDQFQHQLKCSNDSFSVIADYF 900
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
841 HQHCFESYSESDADCPTCLPENRKVMDMIRAQEQKRDLHDQFQHQLKCSNDSFSVIADYF 900

901 GRGVFNKLTLLTDPPTARLTSSLEAGLQRDLLMHSRRGT 939
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901 GRGVFNKLTLLTDPPTARLTSSLEAGLQRDLLMHSRRGT 939