Affine Alignment
 
Alignment between mcm-2 (top Y17G7B.5a 881aa) and mcm-2 (bottom Y17G7B.5a 881aa) score 86051

001 MADRANNDDDVDRQPLPIADDADDDVDGIDEMFNNEDEDPEDEEGENLFGDDMERDYREQ 060
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001 MADRANNDDDVDRQPLPIADDADDDVDGIDEMFNNEDEDPEDEEGENLFGDDMERDYREQ 060

061 PELDQYSESGMDDASDVGSLSVSARRAAEREMAQRDQLLDDDALMYEDGDSEEVDTRRRG 120
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061 PELDQYSESGMDDASDVGSLSVSARRAAEREMAQRDQLLDDDALMYEDGDSEEVDTRRRG 120

121 RGRRGRGDAADDDSVPMEEEDIPVDILENIRGRTIRDHVSDEAVAKEIERRFKNFLRSFH 180
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121 RGRRGRGDAADDDSVPMEEEDIPVDILENIRGRTIRDHVSDEAVAKEIERRFKNFLRSFH 180

181 EPGNKQTKYIQMIKSMAADNRESLEVSFTDLSDDNGEQNISYFLPEAPNEMLAIMDRAAT 240
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181 EPGNKQTKYIQMIKSMAADNRESLEVSFTDLSDDNGEQNISYFLPEAPNEMLAIMDRAAT 240

241 EVVMNMYPFYSRVCNEIKVRISQLPVEEDIRMLRQVHLNMLIRTAGVVTIASGILPQLAV 300
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241 EVVMNMYPFYSRVCNEIKVRISQLPVEEDIRMLRQVHLNMLIRTAGVVTIASGILPQLAV 300

301 VKYDCVACGYLLGPFVQQNDEEVRPTICPSCQGKGPFELNVENTVYHNYQRITMQESPNK 360
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301 VKYDCVACGYLLGPFVQQNDEEVRPTICPSCQGKGPFELNVENTVYHNYQRITMQESPNK 360

361 VAAGRLPRSKDVILLGDLCDSCKPGDEIEVTGVYTNNFDGSLNYKQGFPVFNTLIHANHI 420
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361 VAAGRLPRSKDVILLGDLCDSCKPGDEIEVTGVYTNNFDGSLNYKQGFPVFNTLIHANHI 420

421 TNKDKMASDQLTDEDIKAIRELSQDPNISQRVFSSIAPSIYGHDDVKRAIALALFRGEAK 480
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421 TNKDKMASDQLTDEDIKAIRELSQDPNISQRVFSSIAPSIYGHDDVKRAIALALFRGEAK 480

481 NPGAKHRLRGDINVLLCGDPGTAKSQFLRYAAHIAPRSVLTTGQGASAVGLTAYVQRHPV 540
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481 NPGAKHRLRGDINVLLCGDPGTAKSQFLRYAAHIAPRSVLTTGQGASAVGLTAYVQRHPV 540

541 TREWTLEAGAMVLADKGVCLIDEFDKMSDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLHARCT 600
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541 TREWTLEAGAMVLADKGVCLIDEFDKMSDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLHARCT 600

601 VIAASNPIGGRYNPTRTFAENVDLTEPILSRFDVLCVIRDSVDSVEDERLAKFVVGNHRT 660
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601 VIAASNPIGGRYNPTRTFAENVDLTEPILSRFDVLCVIRDSVDSVEDERLAKFVVGNHRT 660

661 HHPDAKKIVKEGDELEEDQMDERTGVRLIPQDLLRKYIIYAREKCHPTLPEQHSEKFSNI 720
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661 HHPDAKKIVKEGDELEEDQMDERTGVRLIPQDLLRKYIIYAREKCHPTLPEQHSEKFSNI 720

721 FAQMRKESMATGSVAITVRHVESMIRLSEAHAKLHLRSYVNDEDCAAAIRVMLESFVNTQ 780
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721 FAQMRKESMATGSVAITVRHVESMIRLSEAHAKLHLRSYVNDEDCAAAIRVMLESFVNTQ 780

781 KASIMRMMKKTFSRHLTENRSANELLLFILKQLIRQQMHYATARAAAGTILQSVTIPESE 840
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781 KASIMRMMKKTFSRHLTENRSANELLLFILKQLIRQQMHYATARAAAGTILQSVTIPESE 840

841 FIEKAQQLRIENVKPFYTSEIFASNNFLYDPSKKTIVQEIF 881
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841 FIEKAQQLRIENVKPFYTSEIFASNNFLYDPSKKTIVQEIF 881