UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D2005.1D2005.10chrI 7,785,055contains similarity to Pfam domain PF02137 Adenosine-deaminase (editase) domain contains similarity to Interpro domain IPR002466 (Adenosine deaminase/editase)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3M03A8.3M03A8.3n/achrX 6,802,151n/a
4F07A5.3F07A5.3n/achrI 7,355,830contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
5gpb-2F52A8.2n/achrI 7,319,690gpb-2 encodes an ortholog of Gbeta(5), that is dispensable for viability, but required for normal egg-laying, locomotion, and pharyngeal pumping; GBP-2 may regulate the interaction between the GOA-1 and EGL-30 signaling pathways based on genetic analysis; gpb-2 is expressed throughout development in the nervous system and in muscle, and expression is dependent upon expression of both EAT-16 and EGL-10.
6F47G4.2F47G4.2n/achrI 14,080,352contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
7sedl-1W05H7.3n/achrX 1,439,758C. elegans SEDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04628 Sedlin, N-terminal conserved region contains similarity to Interpro domains IPR011012 (Longin-like), IPR006722 (Sedlin)
8W05H7.1W05H7.1n/achrX 1,451,500contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC283767; ENSEMBL:ENSP00000347269
9F17A2.4F17A2.4n/achrX 12,311,694contains similarity to Naja philippinensis;Naja samarensis;Naja sputatrix Short neurotoxin 1 (NTX I).; SW:NXS1_NAJPH
10T05G5.1T05G5.1n/achrIII 9,741,123contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like)
11F36G3.2F36G3.2n/achrX 9,793,271contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
12D1025.1D1025.1n/achrX 14,521,627contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q9ULU4 Protein kinase C binding protein 1; ENSEMBL:ENSP00000262975
13M04F3.4M04F3.4n/achrI 4,772,433contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
14F53B1.6F53B1.6n/achrX 2,116,438contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR001279 (Beta-lactamase-like)
15amx-1R13G10.2n/achrIII 3,824,311C. elegans AMX-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01593 (Flavin containing amine oxidoreductase) , PF01266 (FAD dependent oxidoreductase) contains similarity to Interpro domains IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR001613 (Flavin-containing amine oxidase), IPR000960 (Flavin-containing monooxygenase FMO), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR007526 (SWIRM)
16D2021.8D2021.8n/achrX 8,552,722contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
17srg-10T04A8.1n/achrIII 4,678,679C. elegans SRG-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
18C36B7.6C36B7.6n/achrX 7,098,999contains similarity to Pfam domain PF05602 Cleft lip and palate transmembrane protein 1 (CLPTM1) contains similarity to Interpro domain IPR008429 (Cleft lip and palate transmembrane 1)
19F16G10.9F16G10.9n/achrII 2,385,448contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
20K07E3.2K07E3.2n/achrX 8,105,875
21fbxa-216Y47H9C.10n/achrI 11,902,379C. elegans FBXA-216 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
22rnp-7K04G7.10n/achrIII 7,160,025C. elegans RNP-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
23eif-3.GF22B5.2n/achrII 8,443,436eif-3.G encodes a homolog of eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 4 that affects embryonic viability, fertility, and growth.
24F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
25glit-1F55D10.3n/achrX 4,713,649C. elegans GLIT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
26C06G1.5C06G1.5n/achrX 16,640,570contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
27sulp-3F41D9.5n/achrX 8,405,893sulp-3 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-3 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-3::GFP transcriptional fusion is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
28F47B3.3F47B3.3n/achrI 3,964,844contains similarity to Pfam domain PF01284 Membrane-associating domain contains similarity to Interpro domain IPR008253 (Marvel)
29rer-1F46C5.8n/achrII 8,811,744C. elegans RER-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF03248 Rer1 family contains similarity to Interpro domain IPR004932 (Retrieval of early ER protein Rer1)
30C34C12.6C34C12.6n/achrIII 3,483,701contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
31inx-4F26D11.10n/achrV 7,963,664C. elegans INX-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00876 Innexin contains similarity to Interpro domain IPR000990 (Innexin)
32C30G12.1C30G12.1n/achrII 7,300,470contains similarity to Pfam domain PF06394 Pepsin inhibitor-3-like repeated domain contains similarity to Interpro domain IPR010480 (Proteinase inhibitor I33, aspin)
33ZC250.3ZC250.3n/achrV 5,796,478contains similarity to Pfam domain PF04142 Nucleotide-sugar transporter contains similarity to Interpro domains IPR004689 (UDP-galactose transporter), IPR007271 (Nucleotide-sugar transporter)
34BE10.2BE10.2n/achrIII 12,795,671contains similarity to Homo sapiens Transmembrane protein 195; ENSEMBL:ENSP00000341662
35F54D7.2F54D7.2n/achrI 4,807,641contains similarity to Pfam domain PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR014472 (Choline/ethanolaminephosphotransferase), IPR000462 (CDP-alcohol phosphatidyltransferase)
36T10B5.3T10B5.3n/achrV 1,866,374contains similarity to Pfam domain PF08162 NUC189 domain contains similarity to Interpro domain IPR012979 (Protein of unknown function NUC189, C-terminal)
37F42H10.3F42H10.3n/achrIII 8,486,094contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00880 (Nebulin repeat) (2), PF00412 (LIM domain) contains similarity to Interpro domains IPR000900 (Nebulin 35 residue motif), IPR013998 (Nebulin), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR011511 (Variant SH3), IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
38K04G2.9K04G2.9n/achrI 8,056,298contains similarity to Pfam domain PF01284 Membrane-associating domain contains similarity to Interpro domain IPR008253 (Marvel)
39tor-1Y37A1B.12n/achrIV 13,985,958C. elegans TOR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF06309 Torsin contains similarity to Interpro domains IPR017378 (Torsin, subgroup), IPR001270 (Chaperonin clpA/B), IPR000641 (CbxX/CfqX), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR010448 (Torsin)
40R03E9.2R03E9.2n/achrX 6,731,598contains similarity to Interpro domain IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
41C34C12.8C34C12.8n/achrIII 3,460,983contains similarity to Pfam domain PF01025 GrpE contains similarity to Interpro domains IPR009012 (GrpE nucleotide exchange factor, head), IPR013805 (GrpE nucleotide exchange factor, coiled-coil), IPR000740 (GrpE nucleotide exchange factor)
42K02G10.5K02G10.5n/achrX 4,689,524contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) contains similarity to Interpro domains IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
44tag-289F14F3.3n/achrX 10,523,120C. elegans TAG-289 protein; contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
45dep-1F44G4.8n/achrII 9,012,700dep-1 encodes a class III receptor protein tyrosine phosphatase (R-PTP) orthologous to human R-PTPs such as PTPRJ/Dep-1 (mutated in epithelial cancers; OMIM:600925); DEP-1 is required, redundantly with LIP-1 and LET-60, and downstream of LIN-12, to promote secondary over primary vulval fate in the P5.p and P7.p lineages; DEP-1 is expressed in P5.p and P7.p lineages, and dep-1 acts cell-autonomously in these lineages; DEP-1 colocalizes with LET-23 in punctae, and binds LET-23 in vitro; DEP-1, with LIP-1, is also required for normal duct cell and excretory pore development; dep-1 mutations are wild-type in isolation, but have vulval phenotypes with added mutations in lin-15, lip-1, or let-60; DEP-1 laterally inhibits secondary vulval fates in parallel with LIN-12/Notch signalling; in primary (P5.p) vulval cells, LET-60/RAS-activated SUR-2 inhibits dep-1 and lin-12 expression; since RNAi of 125 out of 165 predicted C. elegans protein phosphatase genes fails to enhance lip-1 mutations, the LIP-1/DEP-1 interaction is likely to be highly specific.
46C05G5.2C05G5.2n/achrX 14,748,776contains similarity to Xenopus laevis Nucleolar phosphoprotein.; TR:Q91803
47C44C1.2C44C1.2n/achrX 959,222contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
48gpb-1F13D12.7n/achrII 11,745,729gpb-1 encodes a heterotrimeric G protein beta subunit that is required during embryonic development for the proper orientation of the mitotic spindle during early cell divisions and thus affects the orientation of early cell division axes, and is also required for larval viability, negatively regulates locomotion and egg-laying, and may affect germline development and osmotic balance; expressed in early embryos with highest expression at cell membranes and colocalizes with asters just before and during early cell divisions (this localization is dependent upon G alpha subunits); adults display high levels of expression in neurons with lower expression in the somatic gonad, vulva, and hypodermal seam cells and expression is also detected in the intestine, pharynx, body wall muscles and in the germline.
49clec-53T03F1.10n/achrI 3,872,447C. elegans CLEC-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR002352 (Eosinophil major basic protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50C14B9.3C14B9.3n/achrIII 8,109,908