UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fhod-1C46H11.110chrI 5,063,543C. elegans FHOD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02181 Formin Homology 2 Domain contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR014768 (GTPase-binding/formin homology 3), IPR003104 (Actin-binding FH2 and DRF autoregulatory), IPR005398 (Tubby, N-terminal), IPR016024 (Armadillo-type fold)
2D2089.2D2089.2n/achrII 10,660,588contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
3F12A10.4F12A10.4n/achrII 5,489,365F12A10.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F12A10.4 has no clear orthologs in other organisms.
4C06H2.2C06H2.2n/achrV 11,126,240contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
5T08B2.11T08B2.11n/achrI 6,222,182contains similarity to Homo sapiens Transcription initiation factor TFIID subunit 3; ENSEMBL:ENSP00000340271
6B0524.1B0524.1n/achrIII 1,908,251contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G; ENSEMBL:ENSP00000260970
7R06B10.1R06B10.1n/achrIII 969,326contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
8ech-1C29F3.1n/achrV 15,359,193ech-1 encodes an enoyl-CoA hydratase; loss of ech-1 activity via RNAi results in reduced body fat, consistent with ECH-1's predicted role in fatty acid metabolism; expression of ech-1 mRNA is positively regulated by the NHR-49 nuclear receptor.
9ugt-51C03A7.11n/achrV 5,176,130C. elegans UGT-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
10ZC116.3ZC116.3n/achrV 12,620,623ZC116.3 is orthologous to the human gene CUBILIN (CUBN; OMIM:602997), which when mutated leads to hereditary megaloblastic anaemia 1 (OMIM:261100).
11K09F6.3K09F6.3n/achrII 2,258,704contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
12F55F8.7F55F8.7n/achrI 5,660,175contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
13W03A5.5W03A5.5n/achrIII 5,439,347
14Y68A4B.3Y68A4B.3n/achrV 17,241,853contains similarity to Ehrlichia canis 28 kDa outer membrane protein (Fragment).; TR:Q9R3J3
15srh-284C47A10.3n/achrV 17,768,552C. elegans SRH-284 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16wht-5F19B6.4n/achrIV 12,338,972C. elegans WHT-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
17F49E11.2F49E11.2n/achrIV 13,037,470contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18F59C6.3F59C6.3n/achrI 10,524,961contains similarity to Rhizobium meliloti Hypothetical membrane protein SMb20625.; TR:Q92TI1
19C35D10.8C35D10.8n/achrIII 4,855,662
20B0478.3B0478.3n/achrIV 6,964,202contains similarity to Interpro domains IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR016090 (Phospholipase A2), IPR001211 (Phospholipase A2, eukaryotic)
21F10G7.6F10G7.6n/achrII 4,692,543contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
22prx-11C47B2.8n/achrI 12,971,925C. elegans PRX-11 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Peroxisomal membrane protein 11C; ENSEMBL:ENSP00000221480
23F18A1.1F18A1.1n/achrII 7,687,417
24aman-3F48C1.1n/achrI 5,327,364aman-3 encodes a Co(II)-activated alpha-mannosidase II, orthologous to human MAN2C1; AMAN-3 is predicted to remove mannose residues from the N-linked oligosaccharides of glycoproteins; AMAN-3 contains three predicted N-glycosylation sites; AMAN-3 is biochemically active in vitro, with a pH optimum of 6.5; AMAN-3 requires either Co(II) or Mn(II) for activity, preferring the former ion; since aman-2(tm1078) mutants almost completely lack paucimannosidic glycans, the function of AMAN-3 in vivo is unclear.
25W01C9.4W01C9.4n/achrII 8,546,188contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
26Y41E3.8Y41E3.8n/achrIV 15,028,708contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1; ENSEMBL:ENSP00000226796
27Y25C1A.13Y25C1A.13n/achrII 3,110,294contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domains IPR014748 (Crontonase, C-terminal), IPR001753 (Crotonase, core)
28C09G1.4C09G1.4n/achrX 15,992,503contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
29C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
30C10C5.1C10C5.1n/achrIV 9,362,924contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG8486-PA;; FLYBASE:CG8486
31F22D6.9F22D6.9n/achrI 7,100,795contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
32ZK1053.2ZK1053.2n/achrI 13,233,396contains similarity to Saccharomyces cerevisiae anchorage subunit of a-agglutinin; SGD:YNR044W
33C33C12.4C33C12.4n/achrII 2,165,992
34atg-2M03A8.2n/achrX 6,813,114atg-2 encodes a large (2,275-residue) protein orthologous to the autophagic budding yeast protein Atg2p, and to human ATG2A and ATG2B; ATG-2 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, body wall muscles, and neurons, as well as adult reproductive system; ATG-2 has no obvious phenotype in mass RNAi assays.
35R03C1.1R03C1.1n/achrII 14,908,902contains similarity to Homo sapiens Mucin-5AC precursor (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000351148
36tag-335C42C1.5n/achrIV 12,277,039C. elegans TAG-335 protein; contains similarity to Pfam domains PF00132 (Bacterial transferase hexapeptide (three repeats)) (4), PF00483 (Nucleotidyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR001451 (Bacterial transferase hexapeptide repeat), IPR005835 (Nucleotidyl transferase), IPR011004 (Trimeric LpxA-like)
37srbc-44ZC455.9n/achrV 12,787,889C. elegans SRBC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
38ugt-52F56B3.7n/achrIV 781,452C. elegans UGT-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
39cul-1D2045.6n/achrIII 10,473,304cul-1 encodes a cullin, orthologous to Cdc53/Cul1 in S. cerevisiae and CUL-1 in humans (OMIM:603134), that is required both maternally and zygotically for developmentally programmed transitions from the G1 phase of the cell cycle to the GO phase or the apoptotic pathway, and that is probably also required for normally slow G1-to-S phase progression; CUL-1 physically interacts with eight Skp1-related proteins (SKR-1, -2, -3, -4, -7, -8, -9, and -10).
40H34I24.2H34I24.2n/achrIII 2,843,610contains similarity to Homo sapiens Mucin-7 precursor; ENSEMBL:ENSP00000302021
41srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42glo-4F07C3.4n/achrV 9,238,868glo-4 encodes a guanine nucleotide exchange factor (GEF) that is similar to Drosophila Claret and human RP3; throughout development, glo-4 activity is required for biogenesis of the lysosome-related gut granules; based upon phenotypic similarity, glo-4 is likely to encode a GEF for the GLO-1 Rab-like GTPase; in regulating gut granule formation, glo-4 acts downstream of apb-3, which encodes the AP-3 complex beta subunit.
43F25H2.4F25H2.4n/achrI 10,552,463contains similarity to Pfam domain PF03665 Uncharacterised protein family (UPF0172) contains similarity to Interpro domain IPR005366 (Protein of unknown function UPF0172)
44srh-78DC2.2n/achrV 218,314C. elegans SRH-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45R01E6.5R01E6.5n/achrX 13,537,467contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
46col-177F59F3.2n/achrX 11,000,722C. elegans COL-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
47haf-8Y57G11C.1n/achrIV 14,696,948The haf-8 gene encodes a homolog of human CHM, which when mutated leads to choroideraemia (OMIM:303100).
48Y38H8A.4Y38H8A.4n/achrIV 13,471,382contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49T28D9.11T28D9.11n/achrII 6,491,500
50F41H10.2F41H10.2n/achrIV 5,381,978