UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C28H8.7C28H8.74e-160chrIII 5,886,352contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
2C31A11.5C31A11.5n/achrV 16,304,427contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
3F08D12.2F08D12.2n/achrII 2,782,368contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
4R08C7.5R08C7.5n/achrIV 4,431,281contains similarity to Pfam domain PF03941 Inner centromere protein, ARK binding region contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR005635 (Inner centromere protein, ARK binding region)
5dyb-1F47G6.1n/achrI 1,486,779The dyb-1 gene encodes a homolog of mammalian alpha-dystrobrevin (DTNA; OMIM:601239), mutation of which can lead to left ventricular noncompaction with congenital heart defects.
6F40F9.8F40F9.8n/achrV 9,734,765contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
7T03D8.2T03D8.2n/achrV 20,833,812contains similarity to Pfam domain PF00164 Ribosomal protein S12 contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR006032 (Ribosomal protein S12/S23), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR005679 (Ribosomal protein S12, bacterial-type)
8C31B8.7C31B8.7n/achrV 2,901,878contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
9C56G2.3C56G2.3n/achrIII 6,347,461contains similarity to Pfam domain PF01746 tRNA (Guanine-1)-methyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR016009 (tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase), IPR007356 (tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, eukaryotic)
10srbc-34Y113G7B.9n/achrV 20,202,676C. elegans SRBC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11C39D10.6C39D10.6n/achrX 7,896,965
12cdd-1C47D2.2n/achrX 8,209,904cdd-1 encodes a cytidine deaminase that contains a zinc-binding region; expressed in the intestine.
13fbxb-107F29A7.2n/achrII 2,760,240C. elegans FBXB-107 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
14hum-7F56A6.2n/achrI 596,704hum-7 encodes a class IX unconventional myosin heavy chain that contains a myosin motor domain in the head region and zinc-finger and rhoGAP (rho GTPase activating protein) domains in the tail region; HUM-7 is required during embryogenesis for cytokinesis and normal cytoplasmic rearrangements, and by homology, may function in organization of the actin cytoskeleton; the precise expression and localization patterns of HUM-7 are not yet known.
15C49F8.2C49F8.2n/achrX 13,374,194contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
16K09E4.2K09E4.2n/achrII 14,130,163contains similarity to Pfam domain PF05208 ALG3 protein contains similarity to Interpro domains IPR007873 (ALG3), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site)
17rpm-1C01B7.6n/achrV 8,812,661rpm-1 encodes an E3 ubiquitin ligase that contains an N-terminal RCC1 (regulator of chromosome condensation)-like guanine nucleotide exchange factor (GEF) domain and that is orthologous to Drosophila highwire and murine Phr1; RPM-1 functions autonomously within several different types of neurons to regulate presynaptic differentiation; in regulating axon termination, RPM-1 acts through the GLO-4 guanine nucleotide exchange factor that positively regulates vesicular trafficking through GLO-1/Rab; in regulating synaptogenesis, RPM-1 functions as part of an SCF-like ubiquitin ligase complex that negatively regulates signaling through the DLK-1 MAP kinase cascade; RPM-1 is expressed in most, if not all, neurons from the comma stage of embryogenesis through adulthood; RPM-1 expression is also seen in the pharynx, coelomocytes, and distal tip cells; in neurons, RPM-1 localizes to presynaptic terminals.
18T22D1.12T22D1.12n/achrIV 6,930,087contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19jph-1T22C1.7n/achrI 7,948,882jph-1 encodes a junctophilin, a protein that belongs to a transmembrane family of proteins implicated in the formation of the junctional membrane complex that forms between the plasma membrane and the endoplasmic reticulum in excitable cells; this complex facilitates cross-talk between the cell surface and intracellular ionic channels; RNA interference of jph-1 results in a locomotion defect suggesting impaired body-wall muscle function; a jph-1 promoter-gfp fusion reporter is expressed in all muscle cells and certain neurons of the nerve ring.
20C06A5.10C06A5.10n/achrI 5,982,746
21C08G5.5C08G5.5n/achrII 756,602contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
22srz-60C04C3.1n/achrIV 3,429,627C. elegans SRZ-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23Y45F10A.3Y45F10A.3n/achrIV 13,511,278contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1
24T12E12.6T12E12.6n/achrIV 5,570,564contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
25clec-191F38C2.6n/achrIV 16,280,134C. elegans CLEC-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26F28H7.7F28H7.7n/achrV 10,752,577contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
27F58H7.2F58H7.2n/achrIV 942,839contains similarity to Pfam domain PF01425 Amidase contains similarity to Interpro domains IPR000120 (Amidase signature enzyme), IPR015830 (Amidase, fungi type)
28unc-41C27H6.1n/achrV 9,971,233unc-41 encodes an ortholog of Drosophila STONED A (STNA) required for normal locomotion; a beta-strand in the mu-adaptin-like domain of UNC-41 binds the C2A domain of SNT-1, and this binding is required for SNT-1 endocytosis, punctate localization of UNC-41 in neurons, and transgenic rescue of unc-41(e268) animals; UNC-41 is also required for normal secretion of EGL-17 from P6.p cells, and for embryonic viability; UNC-41 is expressed in the larval and adult nervous system; UNC-41, like other stonins, is an adaptin, and by orthology with stonins is predicted to be a protein adaptor that helps sort SNT-1 endocytotically.
29C44B12.3C44B12.3n/achrIV 1,105,091
30Y43E12A.2Y43E12A.2n/achrIV 10,983,505contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
31cdh-10C45G7.5n/achrIV 2,449,940cdh-10 encodes a member of the cadherin superfamily.
32F13E6.4F13E6.4n/achrX 10,693,437contains similarity to Pfam domain PF00397 WW domain contains similarity to Interpro domains IPR002349 (WW), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
33C54E4.1C54E4.1n/achrIV 2,176,591
34T23F1.3T23F1.3n/achrV 15,456,730contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35F54E4.3F54E4.3n/achrX 14,634,171contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV230 hypothetical protein.; TR:Q9YVL2
36K08B12.3K08B12.3n/achrV 6,236,378contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR006355 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, hypothetical 2), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
37gpa-2F38E1.5n/achrV 8,372,499gpa-2 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that is involved in dauer formation and chemotaxis to water-soluble odorants; it is expressed in the phasmid neurons PHA and PHB, three pharyngeal neurons, one interneuron, three pairs of head neurons, and the anal sphincter muscle.
38nas-25F46C5.3n/achrII 8,827,065nas-25 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-25::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx and pharyngeal-intestinal valve.
39gsk-3Y18D10A.5n/achrI 12,821,999C. elegans GSK-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40tag-278C02F12.7n/achrX 3,686,384C. elegans TAG-278 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
41R10E4.3R10E4.3n/achrIII 4,286,638contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YIL149C
42F29B9.10F29B9.10n/achrIV 4,659,258contains similarity to Interpro domain IPR001911 (Ribosomal protein S21)
43abt-4Y39D8C.1n/achrV 327,261abt-4 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-4 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-4 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; abt-4 promoter-gfp fusion proteins are widely expressed in larvae and adults, with expression seen in the pharynx, the pharyngeal-intestinal valve, the intestine, renal gland cells, hypodermis, various neurons, and unidentified cells in the head and tail.
44Y116A8C.23Y116A8C.23n/achrIV 17,054,490contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
45F25F6.1F25F6.1n/achrX 4,445,262
46F31B12.2F31B12.2n/achrX 10,822,704contains similarity to Mus musculus Splicing factor, arginine/serine-rich 12 (Serine-arginine-richssplicing regulatory protein 86) (SRrp86).; SW:SFRC_MOUSE
47cyp-33D1K05D4.4n/achrV 16,174,796C. elegans CYP-33D1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR008071 (Cytochrome P450, E-class, group I, CYP2J-like), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
48K07G5.4K07G5.4n/achrI 7,167,846contains similarity to Interpro domain IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
49T28D6.7T28D6.7n/achrIII 11,345,403contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
50F39E9.1F39E9.1n/achrII 3,318,116contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)