UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1K08D8.6K08D8.60chrIV 12,888,793contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3), IPR003366 (CUB-like region)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3D2085.3D2085.3n/achrII 8,663,227D2085.3 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:9947) (EIF2B5; OMIM:603945), which when mutated leads to disease.
4gst-36R07B1.4n/achrX 9,862,249C. elegans GST-36 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR003083 (S-crystallin), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
5daf-36C12D8.5n/achrV 10,224,591daf-36 encodes a protein homologous to the catalytic subunit of Rieske-like oxygenases; DAF-36 functions in a hormone biosynthetic pathway producing a ligand for the DAF-12 nuclear receptor that regulates the developmental decision between reproductive growth and dauer formation; a daf-36::gfp reporter fusion is expressed in the intestine, the head mesodermal cell, two unidentified head neurons (not XXXR/L) and, in dauers, the lateral seam cells; DAF-36 localizes to the cytoplasm in the intestine and to a cytosolic meshwork in dauer seam cells.
6T19D12.1T19D12.1n/achrII 6,670,282contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is Sgs1-PA;; FLYBASE:CG3047
7T08B1.1T08B1.1n/achrV 1,984,861contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR000817 (Prion protein), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8lec-9C16H3.2n/achrX 17,600,900lec-9 encodes a predicted lectin that affects embryonic viability.
9dap-3C14A4.2n/achrII 10,581,748dap-3 is an ortholog of mammalian death-associated protein 3 (DAP3), a mitochondrial ribosomal protein that promotes apoptosis.
10C26B9.5C26B9.5n/achrX 5,330,863contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
11C18E9.5C18E9.5n/achrII 8,970,895contains similarity to Turkey herpesvirus LORF11.; TR:Q9IBS2
12C08H9.2C08H9.2n/achrII 9,888,735contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
13dnj-11F38A5.13n/achrIV 6,587,011This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
14T02G5.4T02G5.4n/achrII 7,083,184contains similarity to Pfam domains PF02803 (Thiolase, C-terminal domain) , PF00108 (Thiolase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR002155 (Thiolase), IPR016039 (Thiolase-like)
15clec-262ZC15.2n/achrV 20,309,111C. elegans CLEC-262 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
16T25D3.2T25D3.2n/achrII 155,462contains similarity to Mus musculus 39S ribosomal protein L28, mitochondrial precursor (L28mt) (MRP-L28).; SW:Q9D1B9
17ile-1K07A1.8n/achrI 9,610,665ile-1 is orthologous to the human gene human ERGIC-53, which when mutated leads to deficiency of coagulation factors V/VIII (OMIM:227300).
18ucr-1F56D2.1n/achrIII 5,593,099C. elegans UCR-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
19R02D3.1R02D3.1n/achrIV 248,522The R02D3.1 gene encodes an ortholog of the human gene ALPHA-AMINOADIPATE SEMIALDEHYDE SYNTHASE (AASS; OMIM:605113), which when mutated leads to hyperlysinemia (OMIM:238700).
20F01G4.3F01G4.3n/achrIV 11,138,937contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF08148 (DSHCT (NUC185) domain) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR016438 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR012961 (DSH, C-terminal), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
21F01F1.9F01F1.9n/achrIII 5,862,653contains similarity to Pfam domain PF02127 Aminopeptidase I zinc metalloprotease (M18) contains similarity to Interpro domain IPR001948 (Peptidase M18, aminopeptidase I)
22ZK829.4ZK829.4n/achrIV 11,954,203ZK829.4 is orthologous to the human gene GLYCINE DECARBOXYLASE PRECURSOR (GLUD1; OMIM:238300), which when mutated leads to disease.
23R13F6.10R13F6.10n/achrIII 6,867,259contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
24F27D4.1F27D4.1n/achrI 7,703,501The F27D4.1 gene encodes an ortholog of the human gene ELECTRON-TRANSFER-FLAVOPROTEIN, ALPHA POLYPEPTIDE (ETFA), which when mutated leads to glutaricaciduria type IIA (OMIM:231680).
25F23B12.5F23B12.5n/achrV 14,446,285F23B12.5 is orthologous to the human gene DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE (DLD; OMIM:109720), which when mutated leads to lactic acidosis due to lipoamide dehydrogenase deficiency; F23B12.5 protein is predicted to be mitochondrial.
26R12E2.11R12E2.11n/achrI 4,173,045contains similarity to Pfam domain PF00156 Phosphoribosyl transferase domain contains similarity to Interpro domains IPR004467 (Orotate phosphoribosyl transferase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase), IPR002375 (Purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase, conserved site)
27T04A8.5T04A8.5n/achrIII 4,690,700contains similarity to Pfam domains PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF00156 (Phosphoribosyl transferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR005854 (Amidophosphoribosyl transferase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase), IPR002375 (Purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase, conserved site)
28eat-3D2013.5n/achrII 9,327,192The eat-3 gene encodes a mitochondrial dynamin-related protein, closely related to bacterial dynamin-like proteins, that is orthologous to human OPA1 (OMIM:203740, mutated in autosomal dominant optic atrophy); EAT-3 is localized to the mitochondrial matrix and may play a role in regulating inner mitochondrial membrane morphology; EAT-3 is expressed in body wall muscle, intestine, and neurons, all tissues with high metabolic rates.
29gst-13T26C5.1n/achrII 9,231,840C. elegans GST-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
30pgk-1T03F1.3n/achrI 3,868,329T03F1.3 is orthologous to the human gene PHOSPHOGLYCERETE KINASE 1 (PGK1; OMIM:311800), which when mutated leads to hemolytic anemia and neurologic disturbances.
31K04A8.10K04A8.10n/achrV 6,569,901contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
32K04A8.1K04A8.1n/achrV 6,567,604contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
33W09C5.7W09C5.7n/achrI 13,656,083contains similarity to Pfam domain PF02383 SacI homology domain contains similarity to Interpro domain IPR002013 (Synaptojanin, N-terminal)
34spt-5K08E4.1n/achrIV 12,053,606C. elegans SPT-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF03439 (Supt5 repeat) (2), PF00467 (KOW motif) contains similarity to Interpro domains IPR005100 (Supt5 repeat), IPR008991 (Translation protein SH3-like), IPR003257 (Transcription antitermination protein, NusG, archaea), IPR005824 (KOW), IPR017071 (Transcription elongation factor Spt5), IPR006645 (Transcription antitermination protein, NusG, N-terminal)
35B0334.5B0334.5n/achrII 11,498,118contains similarity to Interpro domain IPR008949 (Terpenoid synthase)
36K10C2.4K10C2.4n/achrX 6,447,827K10C2.4 encodes a putative fumarylacetoacetate hydrolase, orthologous to human FAH (OMIM:276700, mutated in type I tyrosinemia), that is required for tyrosine metabolism, resistance to oxidative and protein-folding stresses, and more generally for normally rapid growth, normal locomotion, fertility, and viability; K10C2.4 is expressed in hypodermis and intestine; the intestines of K10C2.4(RNAi) animals atrophy rapidly, and show an abnormally active oxidative stress response (seen via gst-4::GFP) and ER stress response (seen via hsp-4::GFP); while RNAi against enzymes upstream of K10C2.4 suppresses the K10C2.4(RNAi) phenotype, excess dietary tyrosine or homogentisic acid enhances it, and exogenous succinylacetone (SA) mimics it, consistent with the hypothesis that blocked SA metabolism is toxic in K10C2.4(RNAi) animals.
37clec-166F38A1.5n/achrIV 1,250,233C. elegans CLEC-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38ugt-16ZC443.6n/achrV 12,826,207C. elegans UGT-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
39C29F7.2C29F7.2n/achrX 13,417,071contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
40H19N07.1H19N07.1n/achrV 11,111,736contains similarity to Pfam domains PF03143 (Elongation factor Tu C-terminal domain) , PF03144 (Elongation factor Tu domain 2) , PF00009 (Elongation factor Tu GTP binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding), IPR004160 (Translation elongation factor EFTu/EF1A, C-terminal), IPR004161 (Translation elongation factor EFTu/EF1A, domain 2), IPR009001 (Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal)
41pqn-47F59B10.1n/achrII 10,499,684pqn-47 encodes a protein with a glutamine/asparagine-rich domain, homologous to human C11orf9 and Drosophila CG3328, that is required for locomotion, vulval development, full body size, cuticular integrity, and general health in mass RNAi assays; pqn-47(cxP5915) homozygotes are sluggish.
42nhr-81C47F8.8n/achrI 12,328,787C. elegans NHR-81 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43gstk-1ZK1320.1n/achrII 9,657,127C. elegans GSTK-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01323 DSBA-like thioredoxin domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR001853 (DSBA oxidoreductase), IPR014440 (HCCA isomerase/glutathione S-transferase kappa)
44F37C12.7F37C12.7n/achrIII 7,169,344contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
45K06A4.5K06A4.5n/achrV 9,506,309contains similarity to Pfam domain PF06052 3-hydroxyanthranilic acid dioxygenase contains similarity to Interpro domains IPR011051 (Cupin, RmlC-type), IPR016700 (3-hydroxyanthranilate 3, 4-dioxygenase, metazoan), IPR010329 (3-hydroxyanthranilic acid dioxygenase)
46alh-9F01F1.6n/achrIII 5,858,031C. elegans ALH-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00171 Aldehyde dehydrogenase family contains similarity to Interpro domains IPR016163 (Aldehyde dehydrogenase, C-terminal), IPR016162 (Aldehyde dehydrogenase, N-terminal), IPR016161 (Aldehyde/histidinol dehydrogenase), IPR015590 (Aldehyde dehydrogenase), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
47irs-1R11A8.6n/achrIV 10,370,700irs-1 encodes a predicted cytoplasmic isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS), an aminoacyl-tRNA synthetase that catalyzes the attachment of isoleucine to its cognate tRNA and is thus required for protein biosynthesis; loss of irs-1 activity via RNA-mediated interference (RNAi) results in sterility, embryonic lethality, and slower rates of growth, indicating that IRS-1 is essential for development.
48tufm-2C43E11.4n/achrI 4,248,543C. elegans TUFM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF03143 (Elongation factor Tu C-terminal domain) , PF03144 (Elongation factor Tu domain 2) , PF00009 (Elongation factor Tu GTP binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR004160 (Translation elongation factor EFTu/EF1A, C-terminal), IPR004161 (Translation elongation factor EFTu/EF1A, domain 2), IPR009001 (Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal)
49dpyd-1C25F6.3n/achrX 5,470,240The C25F6.3 gene encodes an ortholog of the human gene DIHYDROPYRIMIDINE DEHYDROGENASE (DPYD), which when mutated leads to thymine-uraciluria (OMIM:274270).
50hsp-1F26D10.3n/achrIV 17,280,029hsp-1 encodes hsp70A, a member of the heat shock family of proteins; hsp70A is closely related to the Drosophila heat inducible hsp70s and the S. cerevisiae SSA hsp70 subfamily; the hsp-1 gene is normally expressed throughout development and upon heat-shock the hsp-1 mRNA is enhanced 2-6 fold; down-regulation of hsp-1 via RNA interference results in a small reduction in the life-span of an age-1 mutant indicating that hsp-1 may play some role in regulating longevity.