Affine Alignment
 
Alignment between SEMA3F (top ENST00000002829.8 785aa) and SEMA3F (bottom ENST00000002829.8 785aa) score 80389

001 MLVAGLLLWASLLTGAWPSFPTQDHLPATPRVRLSFKELKATGTAHFFNFLLNTTDYRIL 060
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001 MLVAGLLLWASLLTGAWPSFPTQDHLPATPRVRLSFKELKATGTAHFFNFLLNTTDYRIL 060

061 LKDEDHDRMYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASPQRIEECVLSGKDVNGECGNFVR 120
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061 LKDEDHDRMYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASPQRIEECVLSGKDVNGECGNFVR 120

121 LIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQATPWTQTQAVRGRGSRATDGALRPMPTA 180
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121 LIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQATPWTQTQAVRGRGSRATDGALRPMPTA 180

181 PRQDYIFYLEPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQ 240
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181 PRQDYIFYLEPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQ 240

241 TAMRTDQYNSRWLNDPSFIHAELIPDSAERNDDKLYFFFRERSAEAPQSPAVYARIGRIC 300
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241 TAMRTDQYNSRWLNDPSFIHAELIPDSAERNDDKLYFFFRERSAEAPQSPAVYARIGRIC 300

301 LNDDGGHCCLVNKWSTFLKARLVCSVPGEDGIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVFT 360
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301 LNDDGGHCCLVNKWSTFLKARLVCSVPGEDGIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVFT 360

361 SSGSVFRGSAVCVYSMADIRMVFNGPFAHKEGPNYQWMPFSGKMPYPRPGTCPGGTFTPS 420
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361 SSGSVFRGSAVCVYSMADIRMVFNGPFAHKEGPNYQWMPFSGKMPYPRPGTCPGGTFTPS 420

421 MKSTKDYPDEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYEV 480
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421 MKSTKDYPDEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYEV 480

481 LFLGTDRGTVQKVIVLPKDDQELEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVGV 540
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481 LFLGTDRGTVQKVIVLPKDDQELEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVGV 540

541 THLSLHRCQAYGAACADCCLARDPYCAWDGQACSRYTASSKRRSRRQDVRHGNPIRQCRG 600
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541 THLSLHRCQAYGAACADCCLARDPYCAWDGQACSRYTASSKRRSRRQDVRHGNPIRQCRG 600

601 FNSNANKNAVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTE 660
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601 FNSNANKNAVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTE 660

661 QGLLLRALQLSDRGLYSCTATENNFKHVVTRVQLHVLGRDAVHAALFPPLSMSAPPPPGA 720
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661 QGLLLRALQLSDRGLYSCTATENNFKHVVTRVQLHVLGRDAVHAALFPPLSMSAPPPPGA 720

721 GPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQGYWRHVPPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRH 780
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721 GPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQGYWRHVPPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRH 780

781 HPPDT 785
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781 HPPDT 785