Affine Alignment
 
Alignment between CCDC9 (top ENST00000221922.11 531aa) and CCDC9 (bottom ENST00000221922.11 531aa) score 54283

001 MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MAATLDLKSKEEKDAELDKRIEALRRKNEALIRRYQEIEEDRKKAELEGVAVTAPRKGRS 060

061 VEKENVAVESEKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQP 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VEKENVAVESEKNLGPSRRSPGTPRPPGASKGGRTPPQQGGRAGMGRASRSWEGSPGEQP 120

121 RGGGAGGRGRRGRGRGSPHLSGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERN 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 RGGGAGGRGRRGRGRGSPHLSGAGDTSISDRKSKEWEERRRQNIEKMNEEMEKIAEYERN 180

181 QREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESERDRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQ 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 QREGVLEPNPVRNFLDDPRRRSGPLEESERDRREESRRHGRNWGGPDFERVRCGLEHERQ 240

241 GRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQRHRKPTGQWRREWDAEKTDG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 GRRAGLGSAGDMTLSMTGRERSEYLRWKQEREKIDQERLQRHRKPTGQWRREWDAEKTDG 300

301 MFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSSRPQAKAAPRA 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 MFKDGPVPAHEPSHRYDDQAWARPPKPPTFGEFLSQHKAEASSRRRRKSSRPQAKAAPRA 360

361 YSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEE 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 YSDHDDRWETKEGAASPAPETPQPTSPETSPKETPMQPPEIPAPAHRPPEDEGEENEGEE 420

421 DEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEP 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 DEEWEDISEDEEEEEIEVEEGDEEEPAQDHQAPEAAPTGIPCSEQAHGVPFSPEEPLLEP 480

481 QAPGTPSSPFSPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV 531
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 QAPGTPSSPFSPPSGHQPVSDWGEEVELNSPRTTHLAGALSPGEAWPFESV 531