Affine Alignment
 
Alignment between CDH23 (top ENST00000224721.12 3354aa) and CDH23 (bottom ENST00000224721.12 3354aa) score 327294

0001 MGRHVATSCHVAWLLVLISGCWGQVNRLPFFTNHFFDTYLLISEDTPVGSSVTQLLAQDM 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MGRHVATSCHVAWLLVLISGCWGQVNRLPFFTNHFFDTYLLISEDTPVGSSVTQLLAQDM 0060

0061 DNDPLVFGVSGEEASRFFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQGVITRKVNI 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 DNDPLVFGVSGEEASRFFAVEPDTGVVWLRQPLDRETKSEFTVEFSVSDHQGVITRKVNI 0120

0121 QVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQPPSQFFAI 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 QVGDVNDNAPTFHNQPYSVRIPENTPVGTPIFIVNATDPDLGAGGSVLYSFQPPSQFFAI 0180

0181 DSARGIVTVIRELDYETTQAYQLTVNATDQDKTRPLSTLANLAIIITDVQDMDPIFINLP 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 DSARGIVTVIRELDYETTQAYQLTVNATDQDKTRPLSTLANLAIIITDVQDMDPIFINLP 0240

0241 YSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFALDYISGVLTLNGLLD 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 YSTNIYEHSPPGTTVRIITAIDQDKGRPRGIGYTIVSGNTNSIFALDYISGVLTLNGLLD 0300

0301 RENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNAPEFNSSEYSVAITEL 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 RENPLYSHGFILTVKGTELNDDRTPSDATVTTTFNILVIDINDNAPEFNSSEYSVAITEL 0360

0361 AQVGFALPLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFIISPTSVQGKADIRIRVAIPLD 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 AQVGFALPLFIQVVDKDENLGLNSMFEVYLVGNNSHHFIISPTSVQGKADIRIRVAIPLD 0420

0421 YETVDRYDFDLFANESVPDHVGYAKVKITLINENDNRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVL 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 YETVDRYDFDLFANESVPDHVGYAKVKITLINENDNRPIFSQPLYNISLYENVTVGTSVL 0480

0481 TVLATDNDAGTFGEVSYFFSDDPDRFSLDKDTGLIMLIARLDYELIQRFTLTIIARDGGG 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 TVLATDNDAGTFGEVSYFFSDDPDRFSLDKDTGLIMLIARLDYELIQRFTLTIIARDGGG 0540

0541 EETTGRVRINVLDVNDNVPTFQKDAYVGALRENEPSVTQLVRLRATDEDSPPNNQITYSI 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 EETTGRVRINVLDVNDNVPTFQKDAYVGALRENEPSVTQLVRLRATDEDSPPNNQITYSI 0600

0601 VSASAFGSYFDISLYEGYGVISVSRPLDYEQISNGLIYLTVMAMDAGNPPLNSTVPVTIE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 VSASAFGSYFDISLYEGYGVISVSRPLDYEQISNGLIYLTVMAMDAGNPPLNSTVPVTIE 0660

0661 VFDENDNPPTFSKPAYFVSVVENIMAGATVLFLNATDLDRSREYGQESIIYSLEGSTQFR 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 VFDENDNPPTFSKPAYFVSVVENIMAGATVLFLNATDLDRSREYGQESIIYSLEGSTQFR 0720

0721 INARSGEITTTSLLDRETKSEYILIVRAVDGGVGHNQKTGIATVNITLLDINDNHPTWKD 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 INARSGEITTTSLLDRETKSEYILIVRAVDGGVGHNQKTGIATVNITLLDINDNHPTWKD 0780

0781 APYYINLVEMTPPDSDVTTVVAVDPDLGENGTLVYSIQPPNKFYSLNSTTGKIRTTHAML 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 APYYINLVEMTPPDSDVTTVVAVDPDLGENGTLVYSIQPPNKFYSLNSTTGKIRTTHAML 0840

0841 DRENPDPHEAELMRKIVVSVTDCGRPPLKATSSATVFVNLLDLNDNDPTFQNLPFVAEVL 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 DRENPDPHEAELMRKIVVSVTDCGRPPLKATSSATVFVNLLDLNDNDPTFQNLPFVAEVL 0900

0901 EGIPAGVSIYQVVAIDLDEGLNGLVSYRMPVGMPRMDFLINSSSGVVVTTTELDRERIAE 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 EGIPAGVSIYQVVAIDLDEGLNGLVSYRMPVGMPRMDFLINSSSGVVVTTTELDRERIAE 0960

0961 YQLRVVASDAGTPTKSSTSTLTIHVLDVNDETPTFFPAVYNVSVSEDVPREFRVVWLNCT 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 YQLRVVASDAGTPTKSSTSTLTIHVLDVNDETPTFFPAVYNVSVSEDVPREFRVVWLNCT 1020

1021 DNDVGLNAELSYFITGGNVDGKFSVGYRDAVVRTVVGLDRETTAAYMLILEAIDNGPVGK 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 DNDVGLNAELSYFITGGNVDGKFSVGYRDAVVRTVVGLDRETTAAYMLILEAIDNGPVGK 1080

1081 RHTGTATVFVTVLDVNDNRPIFLQSSYEASVPEDIPEGHSILQLKATDADEGEFGRVWYR 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 RHTGTATVFVTVLDVNDNRPIFLQSSYEASVPEDIPEGHSILQLKATDADEGEFGRVWYR 1140

1141 ILHGNHGNNFRIHVSNGLLMRGPRPLDRERNSSHVLIVEAYNHDLGPMRSSVRVIVYVED 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 ILHGNHGNNFRIHVSNGLLMRGPRPLDRERNSSHVLIVEAYNHDLGPMRSSVRVIVYVED 1200

1201 INDEAPVFTQQQYSRLGLRETAGIGTSVIVVQATDRDSGDGGLVNYRILSGAEGKFEIDE 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 INDEAPVFTQQQYSRLGLRETAGIGTSVIVVQATDRDSGDGGLVNYRILSGAEGKFEIDE 1260

1261 STGLIITVNYLDYETKTSYMMNVSATDQAPPFNQGFCSVYITLLNELDEAVQFSNASYEA 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 STGLIITVNYLDYETKTSYMMNVSATDQAPPFNQGFCSVYITLLNELDEAVQFSNASYEA 1320

1321 AILENLALGTEIVRVQAYSIDNLNQITYRFNAYTSTQAKALFKIDAITGVITVQGLVDRE 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 AILENLALGTEIVRVQAYSIDNLNQITYRFNAYTSTQAKALFKIDAITGVITVQGLVDRE 1380

1381 KGDFYTLTVVADDGGPKVDSTVKVYITVLDENDNSPRFDFTSDSAVSIPEDCPVGQRVAT 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 KGDFYTLTVVADDGGPKVDSTVKVYITVLDENDNSPRFDFTSDSAVSIPEDCPVGQRVAT 1440

1441 VKAWDPDAGSNGQVVFSLASGNIAGAFEIVTTNDSIGEVFVARPLDREELDHYILQVVAS 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 VKAWDPDAGSNGQVVFSLASGNIAGAFEIVTTNDSIGEVFVARPLDREELDHYILQVVAS 1500

1501 DRGTPPRKKDHILQVTILDINDNPPVIESPFGYNVSVNENVGGGTAVVQVRATDRDIGIN 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 DRGTPPRKKDHILQVTILDINDNPPVIESPFGYNVSVNENVGGGTAVVQVRATDRDIGIN 1560

1561 SVLSYYITEGNKDMAFRMDRISGEIATRPAPPDRERQSFYHLVATVEDEGTPTLSATTHV 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 SVLSYYITEGNKDMAFRMDRISGEIATRPAPPDRERQSFYHLVATVEDEGTPTLSATTHV 1620

1621 YVTIVDENDNAPMFQQPHYEVLLDEGPDTLNTSLITIQALDLDEGPNGTVTYAIVAGNIV 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 YVTIVDENDNAPMFQQPHYEVLLDEGPDTLNTSLITIQALDLDEGPNGTVTYAIVAGNIV 1680

1681 NTFRIDRHMGVITAAKELDYEISHGRYTLIVTATDQCPILSHRLTSTTTVLVNVNDINDN 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 NTFRIDRHMGVITAAKELDYEISHGRYTLIVTATDQCPILSHRLTSTTTVLVNVNDINDN 1740

1741 VPTFPRDYEGPFEVTEGQPGPRVWTFLAHDRDSGPNGQVEYSIMDGDPLGEFVISPVEGV 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 VPTFPRDYEGPFEVTEGQPGPRVWTFLAHDRDSGPNGQVEYSIMDGDPLGEFVISPVEGV 1800

1801 LRVRKDVELDRETIAFYNLTICARDRGMPPLSSTMLVGIRVLDINDNDPVLLNLPMNITI 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 LRVRKDVELDRETIAFYNLTICARDRGMPPLSSTMLVGIRVLDINDNDPVLLNLPMNITI 1860

1861 SENSPVSSFVAHVLASDADSGCNARLTFNITAGNRERAFFINATTGIVTVNRPLDRERIP 1920
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 SENSPVSSFVAHVLASDADSGCNARLTFNITAGNRERAFFINATTGIVTVNRPLDRERIP 1920

1921 EYKLTISVKDNPENPRIARRDYDLLLIFLSDENDNHPLFTKSTYQAEVMENSPAGTPLTV 1980
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1921 EYKLTISVKDNPENPRIARRDYDLLLIFLSDENDNHPLFTKSTYQAEVMENSPAGTPLTV 1980

1981 LNGPILALDADQDIYAVVTYQLLGAQSGLFDINSSTGVVTVRSGVIIDREAFSPPILELL 2040
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1981 LNGPILALDADQDIYAVVTYQLLGAQSGLFDINSSTGVVTVRSGVIIDREAFSPPILELL 2040

2041 LLAEDIGLLNSTAHLLITILDDNDNRPTFSPATLTVHLLENCPPGFSVLQVTATDEDSGL 2100
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2041 LLAEDIGLLNSTAHLLITILDDNDNRPTFSPATLTVHLLENCPPGFSVLQVTATDEDSGL 2100

2101 NGELVYRIEAGAQDRFLIHLVTGVIRVGNATIDREEQESYRLTVVATDRGTVPLSGTAIV 2160
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101 NGELVYRIEAGAQDRFLIHLVTGVIRVGNATIDREEQESYRLTVVATDRGTVPLSGTAIV 2160

2161 TILIDDINDSRPEFLNPIQTVSVLESAEPGTVIANITAIDHDLNPKLEYHIVGIVAKDDT 2220
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2161 TILIDDINDSRPEFLNPIQTVSVLESAEPGTVIANITAIDHDLNPKLEYHIVGIVAKDDT 2220

2221 DRLVPNQEDAFAVNINTGSVMVKSPMNRELVATYEVTLSVIDNASDLPERSVSVPNAKLT 2280
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2221 DRLVPNQEDAFAVNINTGSVMVKSPMNRELVATYEVTLSVIDNASDLPERSVSVPNAKLT 2280

2281 VNVLDVNDNTPQFKPFGITYYMERILEGATPGTTLIAVAAVDPDKGLNGLVTYTLLDLVP 2340
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2281 VNVLDVNDNTPQFKPFGITYYMERILEGATPGTTLIAVAAVDPDKGLNGLVTYTLLDLVP 2340

2341 PGYVQLEDSSAGKVIANRTVDYEEVHWLNFTVRASDNGSPPRAAEIPVYLEIVDINDNNP 2400
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2341 PGYVQLEDSSAGKVIANRTVDYEEVHWLNFTVRASDNGSPPRAAEIPVYLEIVDINDNNP 2400

2401 IFDQPSYQEAVFEDVPVGTIILTVTATDADSGNFALIEYSLGDGESKFAINPTTGDIYVL 2460
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2401 IFDQPSYQEAVFEDVPVGTIILTVTATDADSGNFALIEYSLGDGESKFAINPTTGDIYVL 2460

2461 SSLDREKKDHYILTALAKDNPGDVASNRRENSVQVVIQVLDVNDCRPQFSKPQFSTSVYE 2520
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2461 SSLDREKKDHYILTALAKDNPGDVASNRRENSVQVVIQVLDVNDCRPQFSKPQFSTSVYE 2520

2521 NEPAGTSVITMMATDQDEGPNGELTYSLEGPGVEAFHVDMDSGLVTTQRPLQSYEKFSLT 2580
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2521 NEPAGTSVITMMATDQDEGPNGELTYSLEGPGVEAFHVDMDSGLVTTQRPLQSYEKFSLT 2580

2581 VVATDGGEPPLWGTTMLLVEVIDVNDNRPVFVRPPNGTILHIREEIPLRSNVYEVYATDK 2640
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2581 VVATDGGEPPLWGTTMLLVEVIDVNDNRPVFVRPPNGTILHIREEIPLRSNVYEVYATDK 2640

2641 DEGLNGAVRYSFLKTAGNRDWEFFIIDPISGLIQTAQRLDRESQAVYSLILVASDLGQPV 2700
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2641 DEGLNGAVRYSFLKTAGNRDWEFFIIDPISGLIQTAQRLDRESQAVYSLILVASDLGQPV 2700

2701 PYETMQPLQVALEDIDDNEPLFVRPPKGSPQYQLLTVPEHSPRGTLVGNVTGAVDADEGP 2760
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2701 PYETMQPLQVALEDIDDNEPLFVRPPKGSPQYQLLTVPEHSPRGTLVGNVTGAVDADEGP 2760

2761 NAIVYYFIAAGNEEKNFHLQPDGCLLVLRDLDREREAIFSFIVKASSNRSWTPPRGPSPT 2820
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2761 NAIVYYFIAAGNEEKNFHLQPDGCLLVLRDLDREREAIFSFIVKASSNRSWTPPRGPSPT 2820

2821 LDLVADLTLQEVRVVLEDINDQPPRFTKAEYTAGVATDAKVGSELIQVLALDADIGNNSL 2880
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2821 LDLVADLTLQEVRVVLEDINDQPPRFTKAEYTAGVATDAKVGSELIQVLALDADIGNNSL 2880

2881 VFYSILAIHYFRALANDSEDVGQVFTMGSMDGILRTFDLFMAYSPGYFVVDIVARDLAGH 2940
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2881 VFYSILAIHYFRALANDSEDVGQVFTMGSMDGILRTFDLFMAYSPGYFVVDIVARDLAGH 2940

2941 NDTAIIGIYILRDDQRVKIVINEIPDRVRGFEEEFIHLLSNITGAIVNTDNVQFHVDKKG 3000
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2941 NDTAIIGIYILRDDQRVKIVINEIPDRVRGFEEEFIHLLSNITGAIVNTDNVQFHVDKKG 3000

3001 RVNFAQTELLIHVVNRDTNRILDVDRVIQMIDENKEQLRNLFRNYNVLDVQPAISVRLPD 3060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3001 RVNFAQTELLIHVVNRDTNRILDVDRVIQMIDENKEQLRNLFRNYNVLDVQPAISVRLPD 3060

3061 DMSALQMAIIVLAILLFLAAMLFVLMNWYYRTVHKRKLKAIVAGSAGNRGFIDIMDMPNT 3120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3061 DMSALQMAIIVLAILLFLAAMLFVLMNWYYRTVHKRKLKAIVAGSAGNRGFIDIMDMPNT 3120

3121 NKYSFDGANPVWLDPFCRNLELAAQAEHEDDLPENLSEIADLWNSPTRTHGTFGREPAAV 3180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3121 NKYSFDGANPVWLDPFCRNLELAAQAEHEDDLPENLSEIADLWNSPTRTHGTFGREPAAV 3180

3181 KPDDDRYLRAAIQEYDNIAKLGQIIREGPIKGSLLKVVLEDYLRLKKLFAQRMVQKASSC 3240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3181 KPDDDRYLRAAIQEYDNIAKLGQIIREGPIKGSLLKVVLEDYLRLKKLFAQRMVQKASSC 3240

3241 HSSISELIQTELDEEPGDHSPGQGSLRFRHKPPVELKGPDGIHVVHGSTGTLLATDLNSL 3300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3241 HSSISELIQTELDEEPGDHSPGQGSLRFRHKPPVELKGPDGIHVVHGSTGTLLATDLNSL 3300

3301 PEEDQKGLGRSLETLTAAEATAFERNARTESAKSTPLHKLRDVIMETPLEITEL 3354
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3301 PEEDQKGLGRSLETLTAAEATAFERNARTESAKSTPLHKLRDVIMETPLEITEL 3354