Affine Alignment
 
Alignment between HOXD9 (top ENST00000249499.8 352aa) and HOXD9 (bottom ENST00000249499.8 352aa) score 35625

001 MLGGSAGRLKMSSSGTLSNYYVDSLIGHEGDEVFAARFGPPGPGAQGRPAGVADGPAATA 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MLGGSAGRLKMSSSGTLSNYYVDSLIGHEGDEVFAARFGPPGPGAQGRPAGVADGPAATA 060

061 AEFASCSFAPRSAVFSASWSAVPSQPPAAAAMSGLYHPYVPPPPLAASASEPGRYVRSWM 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AEFASCSFAPRSAVFSASWSAVPSQPPAAAAMSGLYHPYVPPPPLAASASEPGRYVRSWM 120

121 EPLPGFPGGAGGGGGGGGGGPGRGPSPGPSGPANGRHYGIKPETRAAPAPATAASTTSSS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 EPLPGFPGGAGGGGGGGGGGPGRGPSPGPSGPANGRHYGIKPETRAAPAPATAASTTSSS 180

181 STSLSSSSKRTECSVARESQGSSGPEFSCNSFLQEKAAAATGGTGPGAGIGAATGTGGSS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 STSLSSSSKRTECSVARESQGSSGPEFSCNSFLQEKAAAATGGTGPGAGIGAATGTGGSS 240

241 EPSACSDHPIPGCSLKEEEKQHSQPQQQQLDPNNPAANWIHARSTRKKRCPYTKYQTLEL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 EPSACSDHPIPGCSLKEEEKQHSQPQQQQLDPNNPAANWIHARSTRKKRCPYTKYQTLEL 300

301 EKEFLFNMYLTRDRRYEVARILNLTERQVKIWFQNRRMKMKKMSKEKCPKGD 352
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EKEFLFNMYLTRDRRYEVARILNLTERQVKIWFQNRRMKMKKMSKEKCPKGD 352