Affine Alignment
 
Alignment between JAG1 (top ENST00000254958.10 1218aa) and JAG1 (bottom ENST00000254958.10 1218aa) score 134178

0001 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MRSPRTRGRSGRPLSLLLALLCALRAKVCGASGQFELEILSMQNVNGELQNGNCCGGARN 0060

0061 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 PGDRKCTRDECDTYFKVCLKEYQSRVTAGGPCSFGSGSTPVIGGNTFNLKASRGNDRNRI 0120

0121 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 VLPFSFAWPRSYTLLVEAWDSSNDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFE 0180

0181 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 YQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRPRDDFFGHYACDQNGNKTCMEGWMGPECNRAICRQGCSP 0240

0241 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 KHGSCKLPGDCRCQYGWQGLYCDKCIPHPGCVHGICNEPWQCLCETNWGGQLCDKDLNYC 0300

0301 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 GTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDPCHNRGSCKETSLGFEC 0360

0361 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 ECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCPPQWTGKTCQLDANECEAKP 0420

0421 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 CVNAKSCKNLIASYYCDCLPGWMGQNCDININDCLGQCQNDASCRDLVNGYRCICPPGYA 0480

0481 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 GDHCERDIDECASNPCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQC 0540

0541 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 YNRASDYFCKCPEDYEGKNCSHLKDHCRTTPCEVIDSCTVAMASNDTPEGVRYISSNVCG 0600

0601 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 PHGKCKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWE 0660

0661 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 GAYCETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTC 0720

0721 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 YDEGDAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTCVVNGESFTCVCKEGWEGPICA 0780

0781 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 QNTNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN 0840

0841 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 GYRCVCPPGHSGAKCQEVSGRPCITMGSVIPDGAKWDDDCNTCQCLNGRIACSKVWCGPR 0900

0901 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 PCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSSLQPVKTKCTSDSYYQDNCAN 0960

0961 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 ITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSIYIACEPSPSANNEIHVAISAED 1020

1021 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 IRDDGNPIKEITDKIIDLVSKRDGNSSLIAAVAEVRVQRRPLKNRTDFLVPLLSSVLTVA 1080

1081 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 WICCLVTAFYWCLRKRRKPGSHTHSASEDNTTNNVREQLNQIKNPIEKHGANTVPIKDYE 1140

1141 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 NKNSKMSKIRTHNSEVEEDDMDKHQQKARFAKQPAYTLVDREEKPPNGTPTKHPNWTNKQ 1200

1201 DNRDLESAQSLNRMEYIV 1218
     ||||||||||||||||||
1201 DNRDLESAQSLNRMEYIV 1218