Affine Alignment
 
Alignment between KCNH3 (top ENST00000257981.7 1083aa) and KCNH3 (bottom ENST00000257981.7 1083aa) score 108376

0001 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV 0060
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0001 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV 0060

0061 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK 0120
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0121 GEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETGGGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSGH 0180
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0181 LQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAV 0240
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0241 TVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICL 0300
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0301 HYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVL 0360
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0361 TLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGG 0420
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0421 NSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKI 0480
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0481 FSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLE 0540
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0481 FSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLE 0540

0541 YFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALRP 0600
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0601 AFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANA 0660
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0661 DVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLSG 0720
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0721 DNTLMSTLEEKETDGEQGPTVSPAPADEPSSPLLSPGCTSSSSAAKLLSPRRTAPRPRLG 0780
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0781 GRGRPGRAGALKAEAGPSAPPRALEGLRLPPMPWNVPPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPKFS 0840
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0841 FRVGQSGPECSSSPSPGPESGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTELSEQVLQMREGLQ 0900
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0901 SLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTGASSYCLQPPAGSVLSGT 0960
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0961 WPHPRPGPPPLMAPWPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPP 1020
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1021 SEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGCHGSGTVQWTQEEG 1080
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1021 SEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGCHGSGTVQWTQEEG 1080

1081 TGV 1083
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1081 TGV 1083