Affine Alignment
 
Alignment between NPC1 (top ENST00000269228.10 1278aa) and NPC1 (bottom ENST00000269228.10 1278aa) score 128725

0001 MTARGLALGLLLLLLCPAQVFSQSCVWYGECGIAYGDKRYNCEYSGPPKPLPKDGYDLVQ 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MTARGLALGLLLLLLCPAQVFSQSCVWYGECGIAYGDKRYNCEYSGPPKPLPKDGYDLVQ 0060

0061 ELCPGFFFGNVSLCCDVRQLQTLKDNLQLPLQFLSRCPSCFYNLLNLFCELTCSPRQSQF 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 ELCPGFFFGNVSLCCDVRQLQTLKDNLQLPLQFLSRCPSCFYNLLNLFCELTCSPRQSQF 0120

0121 LNVTATEDYVDPVTNQTKTNVKELQYYVGQSFANAMYNACRDVEAPSSNDKALGLLCGKD 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 LNVTATEDYVDPVTNQTKTNVKELQYYVGQSFANAMYNACRDVEAPSSNDKALGLLCGKD 0180

0181 ADACNATNWIEYMFNKDNGQAPFTITPVFSDFPVHGMEPMNNATKGCDESVDEVTAPCSC 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 ADACNATNWIEYMFNKDNGQAPFTITPVFSDFPVHGMEPMNNATKGCDESVDEVTAPCSC 0240

0241 QDCSIVCGPKPQPPPPPAPWTILGLDAMYVIMWITYMAFLLVFFGAFFAVWCYRKRYFVS 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 QDCSIVCGPKPQPPPPPAPWTILGLDAMYVIMWITYMAFLLVFFGAFFAVWCYRKRYFVS 0300

0301 EYTPIDSNIAFSVNASDKGEASCCDPVSAAFEGCLRRLFTRWGSFCVRNPGCVIFFSLVF 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 EYTPIDSNIAFSVNASDKGEASCCDPVSAAFEGCLRRLFTRWGSFCVRNPGCVIFFSLVF 0360

0361 ITACSSGLVFVRVTTNPVDLWSAPSSQARLEKEYFDQHFGPFFRTEQLIIRAPLTDKHIY 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 ITACSSGLVFVRVTTNPVDLWSAPSSQARLEKEYFDQHFGPFFRTEQLIIRAPLTDKHIY 0420

0421 QPYPSGADVPFGPPLDIQILHQVLDLQIAIENITASYDNETVTLQDICLAPLSPYNTNCT 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 QPYPSGADVPFGPPLDIQILHQVLDLQIAIENITASYDNETVTLQDICLAPLSPYNTNCT 0480

0481 ILSVLNYFQNSHSVLDHKKGDDFFVYADYHTHFLYCVRAPASLNDTSLLHDPCLGTFGGP 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 ILSVLNYFQNSHSVLDHKKGDDFFVYADYHTHFLYCVRAPASLNDTSLLHDPCLGTFGGP 0540

0541 VFPWLVLGGYDDQNYNNATALVITFPVNNYYNDTEKLQRAQAWEKEFINFVKNYKNPNLT 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 VFPWLVLGGYDDQNYNNATALVITFPVNNYYNDTEKLQRAQAWEKEFINFVKNYKNPNLT 0600

0601 ISFTAERSIEDELNRESDSDVFTVVISYAIMFLYISLALGHMKSCRRLLVDSKVSLGIAG 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 ISFTAERSIEDELNRESDSDVFTVVISYAIMFLYISLALGHMKSCRRLLVDSKVSLGIAG 0660

0661 ILIVLSSVACSLGVFSYIGLPLTLIVIEVIPFLVLAVGVDNIFILVQAYQRDERLQGETL 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 ILIVLSSVACSLGVFSYIGLPLTLIVIEVIPFLVLAVGVDNIFILVQAYQRDERLQGETL 0720

0721 DQQLGRVLGEVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSVMPAVHTFSLFAGLAVFIDFLLQITCFV 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 DQQLGRVLGEVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSVMPAVHTFSLFAGLAVFIDFLLQITCFV 0780

0781 SLLGLDIKRQEKNRLDIFCCVRGAEDGTSVQASESCLFRFFKNSYSPLLLKDWMRPIVIA 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 SLLGLDIKRQEKNRLDIFCCVRGAEDGTSVQASESCLFRFFKNSYSPLLLKDWMRPIVIA 0840

0841 IFVGVLSFSIAVLNKVDIGLDQSLSMPDDSYMVDYFKSISQYLHAGPPVYFVLEEGHDYT 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 IFVGVLSFSIAVLNKVDIGLDQSLSMPDDSYMVDYFKSISQYLHAGPPVYFVLEEGHDYT 0900

0901 SSKGQNMVCGGMGCNNDSLVQQIFNAAQLDNYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVD 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 SSKGQNMVCGGMGCNNDSLVQQIFNAAQLDNYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVD 0960

0961 NITDQFCNASVVDPACVRCRPLTPEGKQRPQGGDFMRFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYS 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 NITDQFCNASVVDPACVRCRPLTPEGKQRPQGGDFMRFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYS 1020

1021 SAVNILLGHGTRVGATYFMTYHTVLQTSADFIDALKKARLIASNVTETMGINGSAYRVFP 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 SAVNILLGHGTRVGATYFMTYHTVLQTSADFIDALKKARLIASNVTETMGINGSAYRVFP 1080

1081 YSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTMVLLGCELWSAVIMCATIAMVLVNMFG 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 YSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTMVLLGCELWSAVIMCATIAMVLVNMFG 1140

1141 VMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSMKGSRVERAEEALAHMGSSVFS 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 VMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSMKGSRVERAEEALAHMGSSVFS 1200

1201 GITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGATHGLIFLPVLLSYIGPSVNKAKS 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 GITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGATHGLIFLPVLLSYIGPSVNKAKS 1260

1261 CATEERYKGTERERLLNF 1278
     ||||||||||||||||||
1261 CATEERYKGTERERLLNF 1278