Affine Alignment
 
Alignment between USP43 (top ENST00000285199.12 1123aa) and USP43 (bottom ENST00000285199.12 1123aa) score 112556

0001 MDLGPGDAAGGGPLAPRPRRRRSLRRLFSRFLLALGSRSRPGDSPPRPQPGHCDGDGEGG 0060
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0001 MDLGPGDAAGGGPLAPRPRRRRSLRRLFSRFLLALGSRSRPGDSPPRPQPGHCDGDGEGG 0060

0061 FACAPGPVPAAPGSPGEERPPGPQPQLQLPAGDGARPPGAQGLKNHGNTCFMNAVVQCLS 0120
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0061 FACAPGPVPAAPGSPGEERPPGPQPQLQLPAGDGARPPGAQGLKNHGNTCFMNAVVQCLS 0120

0121 NTDLLAEFLALGRYRAAPGRAEVTEQLAALVRALWTREYTPQLSAEFKNAVSKYGSQFQG 0180
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0121 NTDLLAEFLALGRYRAAPGRAEVTEQLAALVRALWTREYTPQLSAEFKNAVSKYGSQFQG 0180

0181 NSQHDALEFLLWLLDRVHEDLEGSSRGPVSEKLPPEATKTSENCLSPSAQLPLGQSFVQS 0240
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0181 NSQHDALEFLLWLLDRVHEDLEGSSRGPVSEKLPPEATKTSENCLSPSAQLPLGQSFVQS 0240

0241 HFQAQYRSSLTCPHCLKQSNTFDPFLCVSLPIPLRQTRFLSVTLVFPSKSQRFLRVGLAV 0300
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0301 PILSTVAALRKMVAEEGGVPADEVILVELYPSGFQRSFFDEEDLNTIAEGDNVYAFQVPP 0360
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0301 PILSTVAALRKMVAEEGGVPADEVILVELYPSGFQRSFFDEEDLNTIAEGDNVYAFQVPP 0360

0361 SPSQGTLSAHPLGLSASPRLAAREGQRFSLSLHSESKVLILFCNLVGSGQQASRFGPPFL 0420
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0421 IREDRAVSWAQLQQSILSKVRHLMKSEAPVQNLGSLFSIRVVGLSVACSYLSPKDSRPLC 0480
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0421 IREDRAVSWAQLQQSILSKVRHLMKSEAPVQNLGSLFSIRVVGLSVACSYLSPKDSRPLC 0480

0481 HWAVDRVLHLRRPGGPPHVKLAVEWDSSVKERLFGSLQEERAQDADSVWQQQQAHQQHSC 0540
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0541 TLDECFQFYTKEEQLAQDDAWKCPHCQVLQQGMVKLSLWTLPDILIIHLKRFCQVGERRN 0600
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0601 KLSTLVKFPLSGLNMAPHVAQRSTSPEAGLGPWPSWKQPDCLPTSYPLDFLYDLYAVCNH 0660
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0661 HGNLQGGHYTAYCRNSLDGQWYSYDDSTVEPLREDEVNTRGAYILFYQKRNSIPPWSASS 0720
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0721 SMRGSTSSSLSDHWLLRLGSHAGSTRGSLLSWSSAPCPSLPQVPDSPIFTNSLCNQEKGG 0780
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0781 LEPRRLVRGVKGRSISMKAPTTSRAKQGPFKTMPLRWSFGSKEKPPGASVELVEYLESRR 0840
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0841 RPRSTSQSIVSLLTGTAGEDEKSASPRSNVALPANSEDGGRAIERGPAGVPCPSAQPNHC 0900
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0841 RPRSTSQSIVSLLTGTAGEDEKSASPRSNVALPANSEDGGRAIERGPAGVPCPSAQPNHC 0900

0901 LAPGNSDGPNTARKLKENAGQDIKLPRKFDLPLTVMPSVEHEKPARPEGQKAMNWKESFQ 0960
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0901 LAPGNSDGPNTARKLKENAGQDIKLPRKFDLPLTVMPSVEHEKPARPEGQKAMNWKESFQ 0960

0961 MGSKSSPPSPYMGFSGNSKDSRRGTSELDRPLQGTLTLLRSVFRKKENRRNERAEVSPQV 1020
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0961 MGSKSSPPSPYMGFSGNSKDSRRGTSELDRPLQGTLTLLRSVFRKKENRRNERAEVSPQV 1020

1021 PPVSLVSGGLSPAMDGQAPGSPPALRIPEGLARGLGSRLERDVWSAPSSLRLPRKASRAP 1080
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1021 PPVSLVSGGLSPAMDGQAPGSPPALRIPEGLARGLGSRLERDVWSAPSSLRLPRKASRAP 1080

1081 RGSALGMSQRTVPGEQASYGTFQRVKYHTLSLGRKKTLPESSF 1123
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1081 RGSALGMSQRTVPGEQASYGTFQRVKYHTLSLGRKKTLPESSF 1123