Affine Alignment
 
Alignment between CPA3 (top ENST00000296046.4 417aa) and CPA3 (bottom ENST00000296046.4 417aa) score 42332

001 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPGATHHV 060

061 AANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYN 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHSYAKYN 120

121 NWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFTDCGIHAREW 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 NWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKIGEKNERRKAIFTDCGIHAREW 180

181 VSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKN 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 VSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNRMWRKNRSKN 240

241 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 QNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIRSHLNEIKVY 300

301 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 ITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPIESTIYPISG 360

361 SSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS 417
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 SSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKYILKHTS 417