Affine Alignment
 
Alignment between FOXQ1 (top ENST00000296839.5 403aa) and FOXQ1 (bottom ENST00000296839.5 403aa) score 40489

001 MKLEVFVPRAAHGDKQGSDLEGAGGSDAPSPLSAAGDDSLGSDGDCAANSPAAGGGARDT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MKLEVFVPRAAHGDKQGSDLEGAGGSDAPSPLSAAGDDSLGSDGDCAANSPAAGGGARDT 060

061 QGDGEQSAGGGPGAEEAIPAAAAAAVVAEGAEAGAAGPGAGGAGSGEGARSKPYTRRPKP 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 QGDGEQSAGGGPGAEEAIPAAAAAAVVAEGAEAGAAGPGAGGAGSGEGARSKPYTRRPKP 120

121 PYSYIALIAMAIRDSAGGRLTLAEINEYLMGKFPFFRGSYTGWRNSVRHNLSLNDCFVKV 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 PYSYIALIAMAIRDSAGGRLTLAEINEYLMGKFPFFRGSYTGWRNSVRHNLSLNDCFVKV 180

181 LRDPSRPWGKDNYWMLNPNSEYTFADGVFRRRRKRLSHRAPVPAPGLRPEEAPGLPAAPP 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LRDPSRPWGKDNYWMLNPNSEYTFADGVFRRRRKRLSHRAPVPAPGLRPEEAPGLPAAPP 240

241 PAPAAPASPRMRSPARQEERASPAGKFSSSFAIDSILRKPFRSRRLRDTAPGTTLQWGAA 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 PAPAAPASPRMRSPARQEERASPAGKFSSSFAIDSILRKPFRSRRLRDTAPGTTLQWGAA 300

301 PCPPLPAFPALLPAAPCRALLPLCAYGAGEPARLGAREAEVPPTAPPLLLAPLPAAAPAK 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 PCPPLPAFPALLPAAPCRALLPLCAYGAGEPARLGAREAEVPPTAPPLLLAPLPAAAPAK 360

361 PLRGPAAGGAHLYCPLRLPAALQAASVRRPGPHLPYPVETLLA 403
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 PLRGPAAGGAHLYCPLRLPAALQAASVRRPGPHLPYPVETLLA 403