Affine Alignment
 
Alignment between CHRNA5 (top ENST00000299565.9 468aa) and CHRNA5 (bottom ENST00000299565.9 468aa) score 46664

001 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MAARGSGPRALRLLLLVQLVAGRCGLAGAAGGAQRGLSEPSSIAKHEDSLLKDLFQDYER 060

061 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 WVRPVEHLNDKIKIKFGLAISQLVDVDEKNQLMTTNVWLKQEWIDVKLRWNPDDYGGIKV 120

121 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 IRVPSDSVWTPDIVLFDNADGRFEGTSTKTVIRYNGTVTWTPPANYKSSCTIDVTFFPFD 180

181 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LQNCSMKFGSWTYDGSQVDIILEDQDVDKRDFFDNGEWEIVSATGSKGNRTDSCCWYPYV 240

241 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 TYSFVIKRLPLFYTLFLIIPCIGLSFLTVLVFYLPSNEGEKICLCTSVLVSLTVFLLVIE 300

301 EIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EIIPSSSKVIPLIGEYLVFTMIFVTLSIMVTVFAINIHHRSSSTHNAMAPLVRKIFLHTL 360

361 PKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDW 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 PKLLCMRSHVDRYFTQKEETESGSGPKSSRNTLEAALDSIRYITRHIMKENDVREVVEDW 420

421 KFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK 468
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 KFIAQVLDRMFLWTFLFVSIVGSLGLFVPVIYKWANILIPVHIGNANK 468