Affine Alignment
 
Alignment between ABCA3 (top ENST00000301732.10 1704aa) and ABCA3 (bottom ENST00000301732.10 1704aa) score 167618

0001 MAVLRQLALLLWKNYTLQKRKVLVTVLELFLPLLFSGILIWLRLKIQSENVPNATIYPGQ 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MAVLRQLALLLWKNYTLQKRKVLVTVLELFLPLLFSGILIWLRLKIQSENVPNATIYPGQ 0060

0061 SIQELPLFFTFPPPGDTWELAYIPSHSDAAKTVTETVRRALVINMRVRGFPSEKDFEDYI 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SIQELPLFFTFPPPGDTWELAYIPSHSDAAKTVTETVRRALVINMRVRGFPSEKDFEDYI 0120

0121 RYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRFSYTRRNYMWTQTGSFFLKETEGWH 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 RYDNCSSSVLAAVVFEHPFNHSKEPLPLAVKYHLRFSYTRRNYMWTQTGSFFLKETEGWH 0180

0181 TTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTV 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 TTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLFQRLTV 0240

0241 TIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLS 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 TIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLLLLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYMRMMGLS 0300

0301 SWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFAISTISF 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 SWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFAISTISF 0360

0361 SFMVSTFFSKANMAAAFGGFLYFFTYIPYFFVAPRYNWMTLSQKLCSCLLSNVAMAMGAQ 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 SFMVSTFFSKANMAAAFGGFLYFFTYIPYFFVAPRYNWMTLSQKLCSCLLSNVAMAMGAQ 0420

0421 LIGKFEAKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGV 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 LIGKFEAKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYMEAVFPGQFGV 0480

0481 PQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFR 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 PQPWYFFIMPSYWCGKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPEDLVAGIKIKHLSKVFR 0540

0541 VGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQD 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 VGNKDRAAVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPTSGRAYISGYEISQD 0600

0601 MVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNS 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 MVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEEVKQMLHIIGLEDKWNS 0660

0661 RSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTT 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 RSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIWDLLQRQKSDRTIVLTT 0720

0721 HFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQLVHHH 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 HFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVKEPHCNPEDISQLVHHH 0780

0781 VPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVG 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 VPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIASFGASITTMEEVFLRVG 0840

0841 KLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAVKLNTG 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 KLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDGIGALIEEERTAVKLNTG 0900

0901 LALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 LALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLAINYSSELFDDPMLRLTL 0960

0961 GEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVEGGGFN 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 GEYGRTVVPFSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREVLGDLEEFLIFRASVEGGGFN 1020

1021 ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCGPHASIVVSNFPQP 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 ERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNLLFKLLCGPHASIVVSNFPQP 1080

1081 RSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVAS 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 RSALQAAKDQFNEGRKGFDIALNLLFAMAFLASTFSILAVSERAVQAKHVQFVSGVHVAS 1140

1141 FWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMN 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 FWLSALLWDLISFLIPSLLLLVVFKAFDVRAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMN 1200

1201 FFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMA 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 FFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATFLMVTIMRIPAVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMA 1260

1261 VSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLIL 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 VSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCKKYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLIL 1320

1321 LFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTP 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 LFLIETNLLQRLRGILCALRRRRTLTELYTRMPVLPEDQDVADERTRILAPSPDSLLHTP 1380

1381 LIIKELSKVYEQRVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDA 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 LIIKELSKVYEQRVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDA 1440

1441 FVGGHRISSDVGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLR 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 FVGGHRISSDVGKVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLR 1500

1501 GLLLEPHANKLVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARA 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 GLLLEPHANKLVRTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTVARA 1560

1561 RESGKAIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQ 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 RESGKAIIITSHSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQ 1620

1621 QEALEEFKAFVDLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLSWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSV 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 QEALEEFKAFVDLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLSWAKVFGILEKAKEKYGVDDYSV 1680

1681 SQISLEQVFLSFAHLQPPTAEEGR 1704
     ||||||||||||||||||||||||
1681 SQISLEQVFLSFAHLQPPTAEEGR 1704