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Alignment between USH2A (top ENST00000307340.8 5202aa) and USH2A (bottom ENST00000307340.8 5202aa) score 533824 0001 MNCPVLSLGSGFLFQVIEMLIFAYFASISLTESRGLFPRLENVGAFKKVSIVPTQAVCGL 0060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0001 MNCPVLSLGSGFLFQVIEMLIFAYFASISLTESRGLFPRLENVGAFKKVSIVPTQAVCGL 0060 0061 PDRSTFCHSSAAAESIQFCTQRFCIQDCPYRSSHPTYTALFSAGLSSCITPDKNDLHPNA 0120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0061 PDRSTFCHSSAAAESIQFCTQRFCIQDCPYRSSHPTYTALFSAGLSSCITPDKNDLHPNA 0120 0121 HSNSASFIFGNHKSCFSSPPSPKLMASFTLAVWLKPEQQGVMCVIEKTVDGQIVFKLTIS 0180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0121 HSNSASFIFGNHKSCFSSPPSPKLMASFTLAVWLKPEQQGVMCVIEKTVDGQIVFKLTIS 0180 0181 EKETMFYYRTVNGLQPPIKVMTLGRILVKKWIHLSVQVHQTKISFFINGVEKDHTPFNAR 0240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0181 EKETMFYYRTVNGLQPPIKVMTLGRILVKKWIHLSVQVHQTKISFFINGVEKDHTPFNAR 0240 0241 TLSGSITDFASGTVQIGQSLNGLEQFVGRMQDFRLYQVALTNREILEVFSGDLLRLHAQS 0300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0241 TLSGSITDFASGTVQIGQSLNGLEQFVGRMQDFRLYQVALTNREILEVFSGDLLRLHAQS 0300 0301 HCRCPGSHPRVHPLAQRYCIPNDAGDTADNRVSRLNPEAHPLSFVNDNDVGTSWVSNVFT 0360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0301 HCRCPGSHPRVHPLAQRYCIPNDAGDTADNRVSRLNPEAHPLSFVNDNDVGTSWVSNVFT 0360 0361 NITQLNQGVTISVDLENGQYQVFYIIIQFFSPQPTEIRIQRKKENSLDWEDWQYFARNCG 0420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0361 NITQLNQGVTISVDLENGQYQVFYIIIQFFSPQPTEIRIQRKKENSLDWEDWQYFARNCG 0420 0421 AFGMKNNGDLEKPDSVNCLQLSNFTPYSRGNVTFSILTPGPNYRPGYNNFYNTPSLQEFV 0480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0421 AFGMKNNGDLEKPDSVNCLQLSNFTPYSRGNVTFSILTPGPNYRPGYNNFYNTPSLQEFV 0480 0481 KATQIRFHFHGQYYTTETAVNLRHRYYAVDEITISGRCQCHGHADNCDTTSQPYRCLCSQ 0540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0481 KATQIRFHFHGQYYTTETAVNLRHRYYAVDEITISGRCQCHGHADNCDTTSQPYRCLCSQ 0540 0541 ESFTEGLHCDRCLPLYNDKPFRQGDQVYAFNCKPCQCNSHSKSCHYNISVDPFPFEHFRG 0600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0541 ESFTEGLHCDRCLPLYNDKPFRQGDQVYAFNCKPCQCNSHSKSCHYNISVDPFPFEHFRG 0600 0601 GGGVCDDCEHNTTGRNCELCKDYFFRQVGADPSAIDVCKPCDCDTVGTRNGSILCDQIGG 0660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0601 GGGVCDDCEHNTTGRNCELCKDYFFRQVGADPSAIDVCKPCDCDTVGTRNGSILCDQIGG 0660 0661 QCNCKRHVSGRQCNQCQNGFYNLQELDPDGCSPCNCNTSGTVDGDITCHQNSGQCKCKAN 0720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0661 QCNCKRHVSGRQCNQCQNGFYNLQELDPDGCSPCNCNTSGTVDGDITCHQNSGQCKCKAN 0720 0721 VIGLRCDHCNFGFKFLRSFNDVGCEPCQCNLHGSVNKFCNPHSGQCECKKEAKGLQCDTC 0780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0721 VIGLRCDHCNFGFKFLRSFNDVGCEPCQCNLHGSVNKFCNPHSGQCECKKEAKGLQCDTC 0780 0781 RENFYGLDVTNCKACDCDTAGSLPGTVCNAKTGQCICKPNVEGRQCNKCLEGNFYLRQNN 0840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0781 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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1081 NAHWLTYSLLRDGFEIYTTEDQYPYSIQYFLDTDLLPYTKYSYYIETTNVHGSTRSVAVT 1140 1141 YKTKPGVPEGNLTLSYIIPIGSDSVTLTWTTLSNQSGPIEKYILSCAPLAGGQPCVSYEG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1141 YKTKPGVPEGNLTLSYIIPIGSDSVTLTWTTLSNQSGPIEKYILSCAPLAGGQPCVSYEG 1200 1201 HETSATIWNLVPFAKYDFSVQACTSGGCLHSLPITVTTAQAPPQRLSPPKMQKISSTELH 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1201 HETSATIWNLVPFAKYDFSVQACTSGGCLHSLPITVTTAQAPPQRLSPPKMQKISSTELH 1260 1261 VEWSPPAELNGIIIRYELYMRRLRSTKETTSEESRVFQSSGWLSPHSFVESANENALKPP 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1261 VEWSPPAELNGIIIRYELYMRRLRSTKETTSEESRVFQSSGWLSPHSFVESANENALKPP 1320 1321 QTMTTITGLEPYTKYEFRVLAVNMAGSVSSAWVSERTGESAPVFMIPPSVFPLSSYSLNI 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1321 QTMTTITGLEPYTKYEFRVLAVNMAGSVSSAWVSERTGESAPVFMIPPSVFPLSSYSLNI 1380 1381 SWEKPADNVTRGKVVGYDINMLSEQSPQQSIPMAFSQLLHTAKSQELSYTVEGLKPYRIY 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1381 SWEKPADNVTRGKVVGYDINMLSEQSPQQSIPMAFSQLLHTAKSQELSYTVEGLKPYRIY 1440 1441 EFTITLCNSVGCVTSASGAGQTLAAAPAQLRPPLVKGINSTTIHLRWFPPEELNGPSPIY 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1441 EFTITLCNSVGCVTSASGAGQTLAAAPAQLRPPLVKGINSTTIHLRWFPPEELNGPSPIY 1500 1501 QLERRESSLPALMTTMMKGIRFIGNGYCKFPSSTHPVNTDFTGIKASFRTKVPEGLIVFA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1501 QLERRESSLPALMTTMMKGIRFIGNGYCKFPSSTHPVNTDFTGIKASFRTKVPEGLIVFA 1560 1561 ASPGNQEEYFALQLKKGRLYFLFDPQGSPVEVTTTNDHGKQYSDGKWHEIIAIRHQAFGQ 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1561 ASPGNQEEYFALQLKKGRLYFLFDPQGSPVEVTTTNDHGKQYSDGKWHEIIAIRHQAFGQ 1620 1621 ITLDGIYTGSSAILNGSTVIGDNTGVFLGGLPRSYTILRKDPEIIQKGFVGCLKDVHFMK 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1621 ITLDGIYTGSSAILNGSTVIGDNTGVFLGGLPRSYTILRKDPEIIQKGFVGCLKDVHFMK 1680 1681 NYNPSAIWEPLDWQSSEEQINVYNSWEGCPASLNEGAQFLGAGFLELHPYMFHGGMNFEI 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1681 NYNPSAIWEPLDWQSSEEQINVYNSWEGCPASLNEGAQFLGAGFLELHPYMFHGGMNFEI 1740 1741 SFKFRTDQLNGLLLFVYNKDGPDFLAMELKSGILTFRLNTSLAFTQVDLLLGLSYCNGKW 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1741 SFKFRTDQLNGLLLFVYNKDGPDFLAMELKSGILTFRLNTSLAFTQVDLLLGLSYCNGKW 1800 1801 NKVIIKKEGSFISASVNGLMKHASESGDQPLVVNSPVYVGGIPQELLNSYQHLCLEQGFG 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1801 NKVIIKKEGSFISASVNGLMKHASESGDQPLVVNSPVYVGGIPQELLNSYQHLCLEQGFG 1860 1861 GCMKDVKFTRGAVVNLASVSSGAVRVNLDGCLSTDSAVNCRGNDSILVYQGKEQSVYEGG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1861 GCMKDVKFTRGAVVNLASVSSGAVRVNLDGCLSTDSAVNCRGNDSILVYQGKEQSVYEGG 1920 1921 LQPFTEYLYRVIASHEGGSVYSDWSRGRTTGAAPQSVPTPSRVRSLNGYSIEVTWDEPVV 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1921 LQPFTEYLYRVIASHEGGSVYSDWSRGRTTGAAPQSVPTPSRVRSLNGYSIEVTWDEPVV 1980 1981 RGVIEKYILKAYSEDSTRPPRMPSASAEFVNTSNLTGILTGLLPFKNYAVTLTACTLAGC 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1981 RGVIEKYILKAYSEDSTRPPRMPSASAEFVNTSNLTGILTGLLPFKNYAVTLTACTLAGC 2040 2041 TESSHALNISTPQEAPQEVQPPVAKSLPSSLLLSWNPPKKANGIITQYCLYMDGRLIYSG 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2041 TESSHALNISTPQEAPQEVQPPVAKSLPSSLLLSWNPPKKANGIITQYCLYMDGRLIYSG 2100 2101 SEENYIVTDLAVFTPHQFLLSACTHVGCTNSSWVLLYTAQLPPEHVDSPVLTVLDSRTIH 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2101 SEENYIVTDLAVFTPHQFLLSACTHVGCTNSSWVLLYTAQLPPEHVDSPVLTVLDSRTIH 2160 2161 IQWKQPRKISGILERYVLYMSNHTHDFTIWSVIYNSTELFQDHMLQYVLPGNKYLIKLGA 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2161 IQWKQPRKISGILERYVLYMSNHTHDFTIWSVIYNSTELFQDHMLQYVLPGNKYLIKLGA 2220 2221 CTGGGCTVSEASEALTDEDIPEGVPAPKAHSYSPDSFNVSWTEPEYPNGVITSYGLYLDG 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2221 CTGGGCTVSEASEALTDEDIPEGVPAPKAHSYSPDSFNVSWTEPEYPNGVITSYGLYLDG 2280 2281 ILIHNSSELSYRAYGFAPWSLHSFRVQACTAKGCALGPLVENRTLEAPPEGTVNVFVKTQ 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2281 ILIHNSSELSYRAYGFAPWSLHSFRVQACTAKGCALGPLVENRTLEAPPEGTVNVFVKTQ 2340 2341 GSRKAHVRWEAPFRPNGLLTHSVLFTGIFYVDPVGNNYTLLNVTKVMYSGEETNLWVLID 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2341 GSRKAHVRWEAPFRPNGLLTHSVLFTGIFYVDPVGNNYTLLNVTKVMYSGEETNLWVLID 2400 2401 GLVPFTNYTVQVNISNSQGSLITDPITIAMPPGAPDGVLPPRLSSATPTSLQVVWSTPAR 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2401 GLVPFTNYTVQVNISNSQGSLITDPITIAMPPGAPDGVLPPRLSSATPTSLQVVWSTPAR 2460 2461 NNAPGSPRYQLQMRSGDSTHGFLELFSNPSASLSYEVSDLQPYTEYMFRLVASNGFGSAH 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2461 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SNDLECCGGEEGVVYNRLPGMFCCGQDYVNMSDTICCSASSGESKAHIKKNDPVPVKCCE 3360 3361 TELIPKSQKCCNGVGYNPLKYVCSDKISTGMMMKETKECRILCPASMEATEHCGRCDFNF 3420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3361 TELIPKSQKCCNGVGYNPLKYVCSDKISTGMMMKETKECRILCPASMEATEHCGRCDFNF 3420 3421 TSHICTVIRGSHNSTGKASIEEMCSSAEETIHTGSVNTYSYTDVNLKPYMTYEYRISAWN 3480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3421 TSHICTVIRGSHNSTGKASIEEMCSSAEETIHTGSVNTYSYTDVNLKPYMTYEYRISAWN 3480 3481 SYGRGLSKAVRARTKEDVPQGVSPPTWTKIDNLEDTIVLNWRKPIQSNGPIIYYILLRNG 3540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3481 SYGRGLSKAVRARTKEDVPQGVSPPTWTKIDNLEDTIVLNWRKPIQSNGPIIYYILLRNG 3540 3541 IERFRGTSLSFSDKEGIQPFQEYSYQLKACTVAGCATSSKVVAATTQGVPESILPPSITA 3600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3541 IERFRGTSLSFSDKEGIQPFQEYSYQLKACTVAGCATSSKVVAATTQGVPESILPPSITA 3600 3601 LSAVALHLSWSVPEKSNGVIKEYQIRQVGKGLIHTDTTDRRQHTVTGLQPYTNYSFTLTA 3660 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