Affine Alignment
 
Alignment between PCDHGC3 (top ENST00000308177.5 934aa) and PCDHGC3 (bottom ENST00000308177.5 934aa) score 90972

001 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS 060
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001 MVPEAWRSGLVSTGRVVGVLLLLGALNKASTVIHYEIPEEREKGFAVGNVVANLGLDLGS 060

061 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS 120
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061 LSARRFRVVSGASRRFFEVNRETGEMFVNDRLDREELCGTLPSCTVTLELVVENPLELFS 120

121 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF 180
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121 VEVVIQDINDNNPAFPTQEMKLEISEAVAPGTRFPLESAHDPDVGSNSLQTYELSRNEYF 180

181 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN 240
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181 ALRVQTREDSTKYAELVLERALDREREPSLQLVLTALDGGTPALSASLPIHIKVLDANDN 240

241 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV 300
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241 APVFNQSLYRARVLEDAPSGTRVVQVLATDLDEGPNGEIIYSFGSHNRAGVRQLFALDLV 300

301 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP 360
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301 TGMLTIKGRLDFEDTKLHEIYIQAKDKGANPEGAHCKVLVEVVDVNDNAPEITVTSVYSP 360

361 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV 420
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361 VPEDAPLGTVIALLSVTDLDAGENGLVTCEVPPGLPFSLTSSLKNYFTLKTSADLDRETV 420

421 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS 480
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421 PEYNLSITARDAGTPSLSALTIVRVQVSDINDNPPQSSQSSYDVYIEENNLPGAPILNLS 480

481 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS 540
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481 VWDPDAPQNARLSFFLLEQGAETGLVGRYFTINRDNGIVSSLVPLDYEDRREFELTAHIS 540

541 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA 600
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541 DGGTPVLATNISVNIFVTDRNDNAPQVLYPRPGGSSVEMLPRGTSAGHLVSRVVGWDADA 600

601 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA 660
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601 GHNAWLSYSLLGSPNQSLFAIGLHTGQISTARPVQDTDSPRQTLTVLIKDNGEPSLSTTA 660

661 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW 720
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661 TLTVSVTEDSPEARAEFPSGSAPREQKKNLTFYLLLSLILVSVGFVVTVFGVIIFKVYKW 720

721 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS 780
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721 KQSRDLYRAPVSSLYRTPGPSLHADAVRGGLMSPHLYHQVYLTTDSRRSDPLLKKPGAAS 780

781 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTW 840
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781 PLASRQNTLRSCDPVFYRQVLGAESAPPGQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTW 840

841 PNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIP 900
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841 PNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIP 900

901 GSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 934
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901 GSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 934