Affine Alignment
 
Alignment between PER1 (top ENST00000317276.9 1290aa) and PER1 (bottom ENST00000317276.9 1290aa) score 128915

0001 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPCPGPSLADDTDANSNGSSGNESNGH 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPCPGPSLADDTDANSNGSSGNESNGH 0060

0061 ESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPS 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 ESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPS 0120

0121 TSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANQE 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 TSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANQE 0180

0181 YYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAV 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 YYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAV 0240

0241 LLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCR 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 LLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCR 0300

0301 IRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIF 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 IRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIF 0360

0361 TTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQPF 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 TTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQPF 0420

0421 DHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAP 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 DHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAP 0480

0481 SLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGP 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 SLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGP 0540

0541 PAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPELEAG 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 PAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPELEAG 0600

0601 SAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTS 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 SAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTS 0660

0661 SASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVVSVTS 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 SASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVVSVTS 0720

0721 QCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTK 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 QCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTK 0780

0781 AVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAK 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 AVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAK 0840

0841 RSRHHQNPRAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 RSRHHQNPRAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP 0900

0901 APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPA 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPA 0960

0961 LAPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSSAGPPPPSAEAAEP 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 LAPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSSAGPPPPSAEAAEP 1020

1021 EARLAEVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGS 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 EARLAEVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGS 1080

1081 TSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQR 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 TSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQR 1140

1141 VMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVM 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 VMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVM 1200

1201 ACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKA 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 ACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKA 1260

1261 SSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS 1290
     ||||||||||||||||||||||||||||||
1261 SSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS 1290