Affine Alignment
 
Alignment between JAG2 (top ENST00000331782.8 1238aa) and JAG2 (bottom ENST00000331782.8 1238aa) score 136629

0001 MRAQGRGRLPRRLLLLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAG 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MRAQGRGRLPRRLLLLLALWVQAARPMGYFELQLSALRNVNGELLSGACCDGDGRTTRAG 0060

0061 GCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARAR 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 GCGHDECDTYVRVCLKEYQAKVTPTGPCSYGHGATPVLGGNSFYLPPAGAAGDRARARAR 0120

0121 AGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKS 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 AGGDQDPGLVVIPFQFAWPRSFTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKS 0180

0181 LHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWMGKEC 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 LHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKFCRPRNDFFGHYTCDQYGNKACMDGWMGKEC 0240

0241 KEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNCETNWG 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 KEAVCKQGCNLLHGGCTVPGECRCSYGWQGRFCDECVPYPGCVHGSCVEPWQCNCETNWG 0300

0301 GLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGG 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 GLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGG 0360

0361 SCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATC 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 SCHEVPSGFECHCPSGWSGPTCALDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATC 0420

0421 QLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQCQHGGTCKDLVN 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 QLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQCQHGGTCKDLVN 0480

0481 GYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVDLC 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 GYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVDLC 0540

0541 EPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGT 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 EPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGACRVIDGCGSDAGPGMPGT 0600

0601 AASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRC 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 AASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENIDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRC 0660

0661 FCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYT 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 FCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYT 0720

0721 CSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDG 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 CSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDG 0780

0781 WEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGA 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 WEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGA 0840

0841 TCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRD 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 TCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTPFPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRD 0900

0901 CSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 CSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCL 0960

0961 PRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSG 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 PRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSG 1020

1021 ASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSST 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 ASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSST 1080

1081 GLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWTRKRRKERERSRLPREESANNQWAPLNPIRNPIER 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 GLLVPVLCGAFSVLWLACVVLCVWWTRKRRKERERSRLPREESANNQWAPLNPIRNPIER 1140

1141 PGGHKDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDEDLGRGEEDSLEAEKFLSHK 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 PGGHKDVLYQCKNFTPPPRRADEALPGPAGHAAVREDEEDEDLGRGEEDSLEAEKFLSHK 1200

1201 FTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNRAVRSINEARYAGKE 1238
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 FTKDPGRSPGRPAHWASGPKVDNRAVRSINEARYAGKE 1238