Affine Alignment
 
Alignment between HOMER1 (top ENST00000334082.11 354aa) and HOMER1 (bottom ENST00000334082.11 354aa) score 34143

001 MGEQPIFSTRAHVFQIDPNTKKNWVPTSKHAVTVSYFYDSTRNVYRIISLDGSKAIINST 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MGEQPIFSTRAHVFQIDPNTKKNWVPTSKHAVTVSYFYDSTRNVYRIISLDGSKAIINST 060

061 ITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVYGLGFSSEHHLSKFAEKFQEFKEAARLAKEKSQEK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 ITPNMTFTKTSQKFGQWADSRANTVYGLGFSSEHHLSKFAEKFQEFKEAARLAKEKSQEK 120

121 MELTSTPSQESAGGDLQSPLTPESINGTDDERTPDVTQNSEPRAEPTQNALPFSHSSAIS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 MELTSTPSQESAGGDLQSPLTPESINGTDDERTPDVTQNSEPRAEPTQNALPFSHSSAIS 180

181 KHWEAELATLKGNNAKLTAALLESTANVKQWKQQLAAYQEEAERLHKRVTELECVSSQAN 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KHWEAELATLKGNNAKLTAALLESTANVKQWKQQLAAYQEEAERLHKRVTELECVSSQAN 240

241 AVHTHKTELNQTIQELEETLKLKEEEIERLKQEIDNARELQEQRDSLTQKLQEVEIRNKD 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 AVHTHKTELNQTIQELEETLKLKEEEIERLKQEIDNARELQEQRDSLTQKLQEVEIRNKD 300

301 LEGQLSDLEQRLEKSQNEQEAFRNNLKTLLEILDGKIFELTELRDNLAKLLECS 354
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 LEGQLSDLEQRLEKSQNEQEAFRNNLKTLLEILDGKIFELTELRDNLAKLLECS 354