Affine Alignment
 
Alignment between ABCA9 (top ENST00000340001.9 1624aa) and ABCA9 (bottom ENST00000340001.9 1624aa) score 159600

0001 MSKRRMSVGQQTWALLCKNCLKKWRMKRQTLLEWLFSFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQM 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MSKRRMSVGQQTWALLCKNCLKKWRMKRQTLLEWLFSFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQM 0060

0061 SSMDLGRVDSFNDTNYVIAFAPESKTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDEKSMDELDLN 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SSMDLGRVDSFNDTNYVIAFAPESKTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDEKSMDELDLN 0120

0121 YSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPMMKEHRDHSAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 YSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPMMKEHRDHSAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVA 0180

0181 FQAAINAAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYY 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 FQAAINAAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYY 0240

0241 VSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGF 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 VSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGF 0300

0301 VMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEW 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 VMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEW 0360

0361 TLCLLSPFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYF 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 TLCLLSPFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYF 0420

0421 DKILPAEYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEA 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 DKILPAEYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEA 0480

0481 IRIKNLKKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGS 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 IRIKNLKKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGS 0540

0541 VTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQR 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 VTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQR 0600

0601 VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLL 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLL 0660

0661 KEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNER 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 KEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNER 0720

0721 CDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVS 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 CDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVS 0780

0781 ITTLNEVFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVA 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 ITTLNEVFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVA 0840

0841 LWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNT 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 LWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNT 0900

0901 YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI 0960

0961 IVSGDEKDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQTDRSTFFEEHMDYEY 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 IVSGDEKDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQTDRSTFFEEHMDYEY 1020

1021 GYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFL 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 GYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFL 1080

1081 ILLLMQIMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWS 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 ILLLMQIMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWS 1140

1141 FFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESE 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 FFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESE 1200

1201 IVYLALLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEED 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 IVYLALLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEED 1260

1261 IQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKGE 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 IQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKGE 1320

1321 VIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTVR 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 VIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTVR 1380

1381 QHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPS 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 QHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPS 1440

1441 VVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLR 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 VVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLR 1500

1501 CIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVED 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 CIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVED 1560

1561 VRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDLEEDFDPSVKWKLLL 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 VRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDLEEDFDPSVKWKLLL 1620

1621 QEEP 1624
     ||||
1621 QEEP 1624