Affine Alignment
 
Alignment between CHRNA1 (top ENST00000348749.9 457aa) and CHRNA1 (bottom ENST00000348749.9 457aa) score 45638

001 MEPWPLLLLFSLCSAGLVLGSEHETRLVAKLFKDYSSVVRPVEDHRQVVEVTVGLQLIQL 060
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001 MEPWPLLLLFSLCSAGLVLGSEHETRLVAKLFKDYSSVVRPVEDHRQVVEVTVGLQLIQL 060

061 INVDEVNQIVTTNVRLKQQWVDYNLKWNPDDYGGVKKIHIPSEKIWRPDLVLYNNADGDF 120
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061 INVDEVNQIVTTNVRLKQQWVDYNLKWNPDDYGGVKKIHIPSEKIWRPDLVLYNNADGDF 120

121 AIVKFTKVLLQYTGHITWTPPAIFKSYCEIIVTHFPFDEQNCSMKLGTWTYDGSVVAINP 180
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121 AIVKFTKVLLQYTGHITWTPPAIFKSYCEIIVTHFPFDEQNCSMKLGTWTYDGSVVAINP 180

181 ESDQPDLSNFMESGEWVIKESRGWKHSVTYSCCPDTPYLDITYHFVMQRLPLYFIVNVII 240
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181 ESDQPDLSNFMESGEWVIKESRGWKHSVTYSCCPDTPYLDITYHFVMQRLPLYFIVNVII 240

241 PCLLFSFLTGLVFYLPTDSGEKMTLSISVLLSLTVFLLVIVELIPSTSSAVPLIGKYMLF 300
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241 PCLLFSFLTGLVFYLPTDSGEKMTLSISVLLSLTVFLLVIVELIPSTSSAVPLIGKYMLF 300

301 TMVFVIASIIITVIVINTHHRSPSTHVMPNWVRKVFIDTIPNIMFFSTMKRPSREKQDKK 360
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301 TMVFVIASIIITVIVINTHHRSPSTHVMPNWVRKVFIDTIPNIMFFSTMKRPSREKQDKK 360

361 IFTEDIDISDISGKPGPPPMGFHSPLIKHPEVKSAIEGIKYIAETMKSDQESNNAAAEWK 420
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361 IFTEDIDISDISGKPGPPPMGFHSPLIKHPEVKSAIEGIKYIAETMKSDQESNNAAAEWK 420

421 YVAMVMDHILLGVFMLVCIIGTLAVFAGRLIELNQQG 457
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421 YVAMVMDHILLGVFMLVCIIGTLAVFAGRLIELNQQG 457