Affine Alignment
 
Alignment between CCDC88B (top ENST00000356786.10 1476aa) and CCDC88B (bottom ENST00000356786.10 1476aa) score 140562

0001 MEGGKGPRLRDFLSGSLATWALGLAGLVGEAEDSEGEEEEEEEEPPLWLEKRFLRLSDGA 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MEGGKGPRLRDFLSGSLATWALGLAGLVGEAEDSEGEEEEEEEEPPLWLEKRFLRLSDGA 0060

0061 LLLRVLGIIAPSSRGGPRMLRGLDGPAAWRVWNLNHLWGRLRDFYQEELQLLILSPPPDL 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 LLLRVLGIIAPSSRGGPRMLRGLDGPAAWRVWNLNHLWGRLRDFYQEELQLLILSPPPDL 0120

0121 QTLGFDPLSEEAVEQLEGVLRLLLGASVQCEHRELFIRHIQGLSLEVQSELAAAIQEVTQ 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 QTLGFDPLSEEAVEQLEGVLRLLLGASVQCEHRELFIRHIQGLSLEVQSELAAAIQEVTQ 0180

0181 PGAGVVLALSGPDPGELAPAELEMLSRSLMGTLSKLARERDLGAQRLAELLLEREPLCLR 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 PGAGVVLALSGPDPGELAPAELEMLSRSLMGTLSKLARERDLGAQRLAELLLEREPLCLR 0240

0241 PEAPSRAPAEGPSHHLALQLANAKAQLRRLRQELEEKAELLLDSQAEVQGLEAEIRRLRQ 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 PEAPSRAPAEGPSHHLALQLANAKAQLRRLRQELEEKAELLLDSQAEVQGLEAEIRRLRQ 0300

0301 EAQALSGQAKRAELYREEAEALRERAGRLPRLQEELRRCRERLQAAEAYKSQLEEERVLS 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 EAQALSGQAKRAELYREEAEALRERAGRLPRLQEELRRCRERLQAAEAYKSQLEEERVLS 0360

0361 GVLEASKALLEEQLEAARERCARLHETQRENLLLRTRLGEAHAELDSLRHQVDQLAEENV 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 GVLEASKALLEEQLEAARERCARLHETQRENLLLRTRLGEAHAELDSLRHQVDQLAEENV 0420

0421 ELELELQRSLEPPPGSPGEAPLAGAAPSLQDEVREAEAGRLRTLERENRELRGLLQVLQG 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 ELELELQRSLEPPPGSPGEAPLAGAAPSLQDEVREAEAGRLRTLERENRELRGLLQVLQG 0480

0481 QPGGQHPLLEAPREDPVLPVLEEAPQTPVAFDHSPQGLVQKARDGGPQALDLAPPALDSV 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 QPGGQHPLLEAPREDPVLPVLEEAPQTPVAFDHSPQGLVQKARDGGPQALDLAPPALDSV 0540

0541 LEASAECPQAPDSDPQEAESPLQAAAMDPQASDWSPQESGSPVETQESPEKAGRRSSLQS 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 LEASAECPQAPDSDPQEAESPLQAAAMDPQASDWSPQESGSPVETQESPEKAGRRSSLQS 0600

0601 PASVAPPQGPGTKIQAPQLLGGETEGREAPQGELVPEAWGLRQEGPEHKPGPSEPSSVQL 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 PASVAPPQGPGTKIQAPQLLGGETEGREAPQGELVPEAWGLRQEGPEHKPGPSEPSSVQL 0660

0661 EEQEGPNQGLDLATGQAEAREHDQRLEGTVRDPAWQKPQQKSEGALEVQVWEGPIPGESL 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 EEQEGPNQGLDLATGQAEAREHDQRLEGTVRDPAWQKPQQKSEGALEVQVWEGPIPGESL 0720

0721 ASGVAEQEALREEVAQLRRKAEALGDELEAQARKLEAQNTEAARLSKELAQARRAEAEAH 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 ASGVAEQEALREEVAQLRRKAEALGDELEAQARKLEAQNTEAARLSKELAQARRAEAEAH 0780

0781 REAEAQAWEQARLREAVEAAGQELESASQEREALVEALAAAGRERRQWEREGSRLRAQSE 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 REAEAQAWEQARLREAVEAAGQELESASQEREALVEALAAAGRERRQWEREGSRLRAQSE 0840

0841 AAEERMQVLESEGRQHLEEAERERREKEALQAELEKAVVRGKELGDRLEHLQRELEQAAL 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 AAEERMQVLESEGRQHLEEAERERREKEALQAELEKAVVRGKELGDRLEHLQRELEQAAL 0900

0901 ERQEFLREKESQHQRYQGLEQRLEAELQAAATSKEEALMELKTRALQLEEELFQLRQGPA 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 ERQEFLREKESQHQRYQGLEQRLEAELQAAATSKEEALMELKTRALQLEEELFQLRQGPA 0960

0961 GLGPKKRAEPQLVETQNVRLIEVERSNAMLVAEKAALQGQLQHLEGQLGSLQGRAQELLL 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 GLGPKKRAEPQLVETQNVRLIEVERSNAMLVAEKAALQGQLQHLEGQLGSLQGRAQELLL 1020

1021 QSQRAQEHSSRLQAEKSVLEIQGQELHRKLEVLEEEVRAARQSQEETRGQQQALLRDHKA 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 QSQRAQEHSSRLQAEKSVLEIQGQELHRKLEVLEEEVRAARQSQEETRGQQQALLRDHKA 1080

1081 LAQLQRRQEAELEGLLVRHRDLKANMRALELAHRELQGRHEQLQAQRASVEAQEVALLAE 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 LAQLQRRQEAELEGLLVRHRDLKANMRALELAHRELQGRHEQLQAQRASVEAQEVALLAE 1140

1141 RERLMQDGHRQRGLEEELRRLQSEHDRAQMLLAELSRERGELQGERGELRGRLARLELER 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 RERLMQDGHRQRGLEEELRRLQSEHDRAQMLLAELSRERGELQGERGELRGRLARLELER 1200

1201 AQLEMQSQQLRESNQQLDLSACRLTTQCELLTQLRSAQEEENRQLLAEVQALSRENRELL 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 AQLEMQSQQLRESNQQLDLSACRLTTQCELLTQLRSAQEEENRQLLAEVQALSRENRELL 1260

1261 ERSLESRDHLHREQREYLDQLNALRREKQKLVEKIMDQYRVLEPVPLPRTKKGSWLADKV 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 ERSLESRDHLHREQREYLDQLNALRREKQKLVEKIMDQYRVLEPVPLPRTKKGSWLADKV 1320

1321 KRLMRPRREGGPPGGLRLGADGAGSTESLGGPPETELPEGREADGTGSPSPAPMRRAQSS 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 KRLMRPRREGGPPGGLRLGADGAGSTESLGGPPETELPEGREADGTGSPSPAPMRRAQSS 1380

1381 LCLRDETLAGGQRRKLSSRFPVGRSSESFSPGDTPRQRFRQRHPGPLGAPVSHSKGPGVG 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 LCLRDETLAGGQRRKLSSRFPVGRSSESFSPGDTPRQRFRQRHPGPLGAPVSHSKGPGVG 1440

1441 WENSAETLQEHETDANREGPEVQEPEKRPLTPSLSQ 1476
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 WENSAETLQEHETDANREGPEVQEPEKRPLTPSLSQ 1476