Affine Alignment
 
Alignment between PLXNA3 (top ENST00000369682.4 1871aa) and PLXNA3 (bottom ENST00000369682.4 1871aa) score 186561

0001 MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPFRAFVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAPNL 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPFRAFVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAPNL 0060

0061 TELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQGIC 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 TELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQGIC 0120

0121 QFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSGAQEPDSMAGVIVEQGQGPSKLFVGTAVDGKSEYFPT 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 QFLRLDDLFKLGEPHHRKEHYLSGAQEPDSMAGVIVEQGQGPSKLFVGTAVDGKSEYFPT 0180

0181 LSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLT 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 LSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLT 0240

0241 LQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQSAHLAKP 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 LQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQSAHLAKP 0300

0301 GLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGE 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 GLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQSCYRGE 0360

0361 GTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNFCGLVLNQPLGGLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAY 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 GTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNFCGLVLNQPLGGLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAY 0420

0421 TYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSE 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 TYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSE 0480

0481 KQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGASAPHGFAEELSKCV 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 KQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGASAPHGFAEELSKCV 0540

0541 QVRVRPNNVSVTSPGVQLTVTLHNVPDLSAGVSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQ 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 QVRVRPNNVSVTSPGVQLTVTLHNVPDLSAGVSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQ 0600

0601 ELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQSCMSCVGSPYPCHWCKYR 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 ELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQSCMSCVGSPYPCHWCKYR 0660

0661 HTCTSRPHECSFQEGRVHSPEGCPEILPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYE 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 HTCTSRPHECSFQEGRVHSPEGCPEILPSGDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYE 0720

0721 CVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQNASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFR 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 CVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQNASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFR 0780

0781 ALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCGWCISEHRCQLRTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHP 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 ALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCGWCISEHRCQLRTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHP 0840

0841 RITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLGLLSREVGLRVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEE 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 RITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLGLLSREVGLRVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEE 0900

0901 SLVPSPPPGPVELCVGDCSADFRTQSEQVYSFVTPTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 SLVPSPPPGPVELCVGDCSADFRTQSEQVYSFVTPTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSL 0960

0961 DAGSRVTVTVRDSECQFVRRDAKAIVCISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYT 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 DAGSRVTVTVRDSECQFVRRDAKAIVCISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYT 1020

1021 QDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVSGTHLLTVQEPRVRAKYRGIETTNTCQVINDTAMLCK 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 QDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVSGTHLLTVQEPRVRAKYRGIETTNTCQVINDTAMLCK 1080

1081 APGIFLGRPQPRAQGEHPDEFGFLLDHVQTARSLNRSSFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKP 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 APGIFLGRPQPRAQGEHPDEFGFLLDHVQTARSLNRSSFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKP 1140

1141 GSHVVLKGKNLIPAAAGSSRLNYTVLIGGQPCSLTVSDTQLLCDSPSQTGRQPVMVLVGG 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 GSHVVLKGKNLIPAAAGSSRLNYTVLIGGQPCSLTVSDTQLLCDSPSQTGRQPVMVLVGG 1200

1201 LEFWLGTLHISAERALTLPAMMGLAAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQM 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 LEFWLGTLHISAERALTLPAMMGLAAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQM 1260

1261 DNLESRVALECKEAFAELQTDINELTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFPGIEAHPVLKEL 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 DNLESRVALECKEAFAELQTDINELTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFPGIEAHPVLKEL 1320

1321 DTPPNVEKALRLFGQLLHSRAFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYAT 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 DTPPNVEKALRLFGQLLHSRAFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYAT 1380

1381 GLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEPLFLLY 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 GLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEPLFLLY 1440

1441 CAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNC 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 CAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNC 1500

1501 DSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLN 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 DSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLN 1560

1561 SLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRAPMITP 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 SLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRAPMITP 1620

1621 DQETGTKLWHLVKNHDHADHREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTA 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 DQETGTKLWHLVKNHDHADHREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTA 1680

1681 HRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHK 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 HRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHK 1740

1741 NSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMAS 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 NSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMAS 1800

1801 ISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKL 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 ISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKL 1860

1861 EQIISLVSSDS 1871
     |||||||||||
1861 EQIISLVSSDS 1871