Affine Alignment
 
Alignment between ABCA1 (top ENST00000374736.8 2261aa) and ABCA1 (bottom ENST00000374736.8 2261aa) score 224124

0001 MACWPQLRLLLWKNLTFRRRQTCQLLLEVAWPLFIFLILISVRLSYPPYEQHECHFPNKA 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MACWPQLRLLLWKNLTFRRRQTCQLLLEVAWPLFIFLILISVRLSYPPYEQHECHFPNKA 0060

0061 MPSAGTLPWVQGIICNANNPCFRYPTPGEAPGVVGNFNKSIVARLFSDARRLLLYSQKDT 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 MPSAGTLPWVQGIICNANNPCFRYPTPGEAPGVVGNFNKSIVARLFSDARRLLLYSQKDT 0120

0121 SMKDMRKVLRTLQQIKKSSSNLKLQDFLVDNETFSGFLYHNLSLPKSTVDKMLRADVILH 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 SMKDMRKVLRTLQQIKKSSSNLKLQDFLVDNETFSGFLYHNLSLPKSTVDKMLRADVILH 0180

0181 KVFLQGYQLHLTSLCNGSKSEEMIQLGDQEVSELCGLPREKLAAAERVLRSNMDILKPIL 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 KVFLQGYQLHLTSLCNGSKSEEMIQLGDQEVSELCGLPREKLAAAERVLRSNMDILKPIL 0240

0241 RTLNSTSPFPSKELAEATKTLLHSLGTLAQELFSMRSWSDMRQEVMFLTNVNSSSSSTQI 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 RTLNSTSPFPSKELAEATKTLLHSLGTLAQELFSMRSWSDMRQEVMFLTNVNSSSSSTQI 0300

0301 YQAVSRIVCGHPEGGGLKIKSLNWYEDNNYKALFGGNGTEEDAETFYDNSTTPYCNDLMK 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 YQAVSRIVCGHPEGGGLKIKSLNWYEDNNYKALFGGNGTEEDAETFYDNSTTPYCNDLMK 0360

0361 NLESSPLSRIIWKALKPLLVGKILYTPDTPATRQVMAEVNKTFQELAVFHDLEGMWEELS 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 NLESSPLSRIIWKALKPLLVGKILYTPDTPATRQVMAEVNKTFQELAVFHDLEGMWEELS 0420

0421 PKIWTFMENSQEMDLVRMLLDSRDNDHFWEQQLDGLDWTAQDIVAFLAKHPEDVQSSNGS 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 PKIWTFMENSQEMDLVRMLLDSRDNDHFWEQQLDGLDWTAQDIVAFLAKHPEDVQSSNGS 0480

0481 VYTWREAFNETNQAIRTISRFMECVNLNKLEPIATEVWLINKSMELLDERKFWAGIVFTG 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 VYTWREAFNETNQAIRTISRFMECVNLNKLEPIATEVWLINKSMELLDERKFWAGIVFTG 0540

0541 ITPGSIELPHHVKYKIRMDIDNVERTNKIKDGYWDPGPRADPFEDMRYVWGGFAYLQDVV 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 ITPGSIELPHHVKYKIRMDIDNVERTNKIKDGYWDPGPRADPFEDMRYVWGGFAYLQDVV 0600

0601 EQAIIRVLTGTEKKTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIV 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 EQAIIRVLTGTEKKTGVYMQQMPYPCYVDDIFLRVMSRSMPLFMTLAWIYSVAVIIKGIV 0660

0661 YEKEARLKETMRIMGLDNSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKLGNLLPYSDPSVVFV 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 YEKEARLKETMRIMGLDNSILWFSWFISSLIPLLVSAGLLVVILKLGNLLPYSDPSVVFV 0720

0721 FLSVFAVVTILQCFLISTLFSRANLAAACGGIIYFTLYLPYVLCVAWQDYVGFTLKIFAS 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 FLSVFAVVTILQCFLISTLFSRANLAAACGGIIYFTLYLPYVLCVAWQDYVGFTLKIFAS 0780

0781 LLSPVAFGFGCEYFALFEEQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLFDTFLYGVMTW 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 LLSPVAFGFGCEYFALFEEQGIGVQWDNLFESPVEEDGFNLTTSVSMMLFDTFLYGVMTW 0840

0841 YIEAVFPGQYGIPRPWYFPCTKSYWFGEESDEKSHPGSNQKRISEICMEEEPTHLKLGVS 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 YIEAVFPGQYGIPRPWYFPCTKSYWFGEESDEKSHPGSNQKRISEICMEEEPTHLKLGVS 0900

0901 IQNLVKVYRDGMKVAVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGTAYIL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 IQNLVKVYRDGMKVAVDGLALNFYEGQITSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGTAYIL 0960

0961 GKDIRSEMSTIRQNLGVCPQHNVLFDMLTVEEHIWFYARLKGLSEKHVKAEMEQMALDVG 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 GKDIRSEMSTIRQNLGVCPQHNVLFDMLTVEEHIWFYARLKGLSEKHVKAEMEQMALDVG 1020

1021 LPSSKLKSKTSQLSGGMQRKLSVALAFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQ 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 LPSSKLKSKTSQLSGGMQRKLSVALAFVGGSKVVILDEPTAGVDPYSRRGIWELLLKYRQ 1080

1081 GRTIILSTHHMDEADVLGDRIAIISHGKLCCVGSSLFLKNQLGTGYYLTLVKKDVESSLS 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 GRTIILSTHHMDEADVLGDRIAIISHGKLCCVGSSLFLKNQLGTGYYLTLVKKDVESSLS 1140

1141 SCRNSSSTVSYLKKEDSVSQSSSDAGLGSDHESDTLTIDVSAISNLIRKHVSEARLVEDI 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 SCRNSSSTVSYLKKEDSVSQSSSDAGLGSDHESDTLTIDVSAISNLIRKHVSEARLVEDI 1200

1201 GHELTYVLPYEAAKEGAFVELFHEIDDRLSDLGISSYGISETTLEEIFLKVAEESGVDAE 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 GHELTYVLPYEAAKEGAFVELFHEIDDRLSDLGISSYGISETTLEEIFLKVAEESGVDAE 1260

1261 TSDGTLPARRNRRAFGDKQSCLRPFTEDDAADPNDSDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVK 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 TSDGTLPARRNRRAFGDKQSCLRPFTEDDAADPNDSDIDPESRETDLLSGMDGKGSYQVK 1320

1321 GWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPSLELQ 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 GWKLTQQQFVALLWKRLLIARRSRKGFFAQIVLPAVFVCIALVFSLIVPPFGKYPSLELQ 1380

1381 PWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKDPGFGTRCMEGNPIPDTPCQAGEEEWTTAP 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 PWMYNEQYTFVSNDAPEDTGTLELLNALTKDPGFGTRCMEGNPIPDTPCQAGEEEWTTAP 1440

1441 VPQTIMDLFQNGNWTMQNPSPACQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGLPPPQRKQNTADILQDL 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 VPQTIMDLFQNGNWTMQNPSPACQCSSDKIKKMLPVCPPGAGGLPPPQRKQNTADILQDL 1500

1501 TGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQEVNDAIKQMKK 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 TGRNISDYLVKTYVQIIAKSLKNKIWVNEFRYGGFSLGVSNTQALPPSQEVNDAIKQMKK 1560

1561 HLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAILRANLQK 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 HLKLAKDSSADRFLNSLGRFMTGLDTKNNVKVWFNNKGWHAISSFLNVINNAILRANLQK 1620

1621 GENPSHYGITAFNHPLNLTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFVPASFVVFLIQER 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 GENPSHYGITAFNHPLNLTKQQLSEVALMTTSVDVLVSICVIFAMSFVPASFVVFLIQER 1680

1681 VSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLAL 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 VSKAKHLQFISGVKPVIYWLSNFVWDMCNYVVPATLVIIIFICFQQKSYVSSTNLPVLAL 1740

1741 LLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLTSVNLFIGINGSVATFVLELFTDNKLNNIN 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 LLLLYGWSITPLMYPASFVFKIPSTAYVVLTSVNLFIGINGSVATFVLELFTDNKLNNIN 1800

1801 DILKSVFLIFPHFCLGRGLIDMVKNQAMADALERFGENRFVSPLSWDLVGRNLFAMAVEG 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 DILKSVFLIFPHFCLGRGLIDMVKNQAMADALERFGENRFVSPLSWDLVGRNLFAMAVEG 1860

1861 VVFFLITVLIQYRFFIRPRPVNAKLSPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEIKELTKI 1920
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 VVFFLITVLIQYRFFIRPRPVNAKLSPLNDEDEDVRRERQRILDGGGQNDILEIKELTKI 1920

1921 YRRKRKPAVDRICVGIPPGECFGLLGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSN 1980
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1921 YRRKRKPAVDRICVGIPPGECFGLLGVNGAGKSSTFKMLTGDTTVTRGDAFLNKNSILSN 1980

1981 IHEVHQNMGYCPQFDAITELLTGREHVEFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLVKYGEK 2040
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1981 IHEVHQNMGYCPQFDAITELLTGREHVEFFALLRGVPEKEVGKVGEWAIRKLGLVKYGEK 2040

2041 YAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPTTGMDPKARRFLWNCALSVVKEGRSVVLT 2100
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2041 YAGNYSGGNKRKLSTAMALIGGPPVVFLDEPTTGMDPKARRFLWNCALSVVKEGRSVVLT 2100

2101 SHSMEECEALCTRMAIMVNGRFRCLGSVQHLKNRFGDGYTIVVRIAGSNPDLKPVQDFFG 2160
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101 SHSMEECEALCTRMAIMVNGRFRCLGSVQHLKNRFGDGYTIVVRIAGSNPDLKPVQDFFG 2160

2161 LAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSSLSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNF 2220
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2161 LAFPGSVLKEKHRNMLQYQLPSSLSSLARIFSILSQSKKRLHIEDYSVSQTTLDQVFVNF 2220

2221 AKDQSDDDHLKDLSLHKNQTVVDVAVLTSFLQDEKVKESYV 2261
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2221 AKDQSDDDHLKDLSLHKNQTVVDVAVLTSFLQDEKVKESYV 2261