Affine Alignment
 
Alignment between NOTCH4 (top ENST00000375023.3 2003aa) and NOTCH4 (bottom ENST00000375023.3 2003aa) score 219792

0001 MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGE 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFLGE 0060

0061 TCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLED 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 TCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKLED 0120

0121 PCPPSFCSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQC 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 PCPPSFCSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQIQC 0180

0181 HCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPP 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 HCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGPCPP 0240

0241 RGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTC 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 RGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDTYTC 0300

0301 LCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDCI 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 LCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLDDCI 0360

0361 AATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLC 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 AATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTLCLC 0420

0421 QPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECL 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 QPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHNECL 0480

0481 SQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICL 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 SQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQCICL 0540

0541 PGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPV 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 PGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCLPGFEGPRCQTEVDECLSDPCPV 0600

0601 GASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGCAP 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 GASCLDLPGAFFCLCPSGFTGQLCEVPLCAPNLCQPKQICKDQKDKANCLCPDGSPGCAP 0660

0661 PEDNCTCHHGHCQRSSCVCDVGWTGPECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTG 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 PEDNCTCHHGHCQRSSCVCDVGWTGPECEAELGGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTG 0720

0721 YTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGG 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 YTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSCNPSPGGYYCTCPPSHTGPQCQTSTDYCVSAPCFNGG 0780

0781 TCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGS 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 TCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTGGS 0840

0841 CQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSL 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 CQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVSSL 0900

0901 CHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGY 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 CHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAPGY 0960

0961 DGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGT 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 DGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCTPKPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGT 1020

1021 AACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFE 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 AACHSLANAFYCQCLPGHTGQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFE 1080

1081 GPTCSHRAPSCGFHHCHHGGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPC 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 GPTCSHRAPSCGFHHCHHGGLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPC 1140

1141 LYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPHSSPGPRCQKPGAKGCEGRSGDGACDAGCSGPGGNWDG 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 LYNGSCSETTGLGGPGFRCSCPHSSPGPRCQKPGAKGCEGRSGDGACDAGCSGPGGNWDG 1200

1201 GDCSLGVPDPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCETPPACTPAYDQYCH 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 GDCSLGVPDPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCETPPACTPAYDQYCH 1260

1261 DHFHNGHCEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLFALARVLS 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 DHFHNGHCEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLFALARVLS 1320

1321 LTLRVGLWVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKETDSLSAG 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 LTLRVGLWVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKETDSLSAG 1380

1381 FVVVMGVDLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAP 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 FVVVMGVDLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAP 1440

1441 PANQLPWPVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRR 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 PANQLPWPVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRR 1500

1501 RPPLGEDSIGLKALKPKAEVDEDGVVMCSGPEEGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSGGCGA 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 RPPLGEDSIGLKALKPKAEVDEDGVVMCSGPEEGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSGGCGA 1560

1561 LPQAAMLTPPQESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQSGTFQGAWLGCPEPWEPLL 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 LPQAAMLTPPQESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQSGTFQGAWLGCPEPWEPLL 1620

1621 DGGACPQAHTVGTGETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHAAVAADAR 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 DGGACPQAHTVGTGETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRTPLHAAVAADAR 1680

1681 EVCQLLLRSRQTAVDARTEDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGARDKWGKTALHW 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 EVCQLLLRSRQTAVDARTEDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGARDKWGKTALHW 1740

1741 AAAVNNARAARSLLQAGADKDAQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGLGAARELRDQAG 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 AAAVNNARAARSLLQAGADKDAQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGLGAARELRDQAG 1800

1801 LAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVSVPPHGGGALPR 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 LAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVSVPPHGGGALPR 1860

1861 CRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAARGGGAYSHCRSLSGVGAGGGPTPRGRRFSAGM 1920
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 CRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAARGGGAYSHCRSLSGVGAGGGPTPRGRRFSAGM 1920

1921 RGPRPNPAIMRGRYGVAAGRGGRVSTDDWPCDWVALGACGSASNIPIPPPCLTPSPERGS 1980
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1921 RGPRPNPAIMRGRYGVAAGRGGRVSTDDWPCDWVALGACGSASNIPIPPPCLTPSPERGS 1980

1981 PQLDCGPPALQEMPINQGGEGKK 2003
     |||||||||||||||||||||||
1981 PQLDCGPPALQEMPINQGGEGKK 2003