Affine Alignment
 
Alignment between HLA-A (top ENST00000376809.10 365aa) and HLA-A (bottom ENST00000376809.10 365aa) score 36841

001 MAVMAPRTLLLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MAVMAPRTLLLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF 060

061 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEAGSHTIQ 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEAGSHTIQ 120

121 IMYGCDVGSDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHEAEQL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 IMYGCDVGSDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHEAEQL 180

181 RAYLDGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 RAYLDGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT 240

241 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEL 300

301 SSQPTIPIVGIIAGLVLLGAVITGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYTQAASSDSAQGSDVSL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 SSQPTIPIVGIIAGLVLLGAVITGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYTQAASSDSAQGSDVSL 360

361 TACKV 365
    |||||
361 TACKV 365