Affine Alignment
 
Alignment between PCDH17 (top ENST00000377918.8 1159aa) and PCDH17 (bottom ENST00000377918.8 1159aa) score 114798

0001 MYLSICCCFLLWAPALTLKNLNYSVPEEQGAGTVIGNIGRDARLQPGLPPAERGGGGRSK 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MYLSICCCFLLWAPALTLKNLNYSVPEEQGAGTVIGNIGRDARLQPGLPPAERGGGGRSK 0060

0061 SGSYRVLENSAPHLLDVDADSGLLYTKQRIDRESLCRHNAKCQLSLEVFANDKEICMIKV 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SGSYRVLENSAPHLLDVDADSGLLYTKQRIDRESLCRHNAKCQLSLEVFANDKEICMIKV 0120

0121 EIQDINDNAPSFSSDQIEMDISENAAPGTRFPLTSAHDPDAGENGLRTYLLTRDDHGLFG 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 EIQDINDNAPSFSSDQIEMDISENAAPGTRFPLTSAHDPDAGENGLRTYLLTRDDHGLFG 0180

0181 LDVKSRGDGTKFPELVIQKALDREQQNHHTLVLTALDGGEPPRSATVQINVKVIDSNDNS 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 LDVKSRGDGTKFPELVIQKALDREQQNHHTLVLTALDGGEPPRSATVQINVKVIDSNDNS 0240

0241 PVFEAPSYLVELPENAPLGTVVIDLNATDADEGPNGEVLYSFSSYVPDRVRELFSIDPKT 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 PVFEAPSYLVELPENAPLGTVVIDLNATDADEGPNGEVLYSFSSYVPDRVRELFSIDPKT 0300

0301 GLIRVKGNLDYEENGMLEIDVQARDLGPNPIPAHCKVTVKLIDRNDNAPSIGFVSVRQGA 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 GLIRVKGNLDYEENGMLEIDVQARDLGPNPIPAHCKVTVKLIDRNDNAPSIGFVSVRQGA 0360

0361 LSEAAPPGTVIALVRVTDRDSGKNGQLQCRVLGGGGTGGGGGLGGPGGSVPFKLEENYDN 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 LSEAAPPGTVIALVRVTDRDSGKNGQLQCRVLGGGGTGGGGGLGGPGGSVPFKLEENYDN 0420

0421 FYTVVTDRPLDRETQDEYNVTIVARDGGSPPLNSTKSFAIKILDENDNPPRFTKGLYVLQ 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 FYTVVTDRPLDRETQDEYNVTIVARDGGSPPLNSTKSFAIKILDENDNPPRFTKGLYVLQ 0480

0481 VHENNIPGEYLGSVLAQDPDLGQNGTVSYSILPSHIGDVSIYTYVSVNPTNGAIYALRSF 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 VHENNIPGEYLGSVLAQDPDLGQNGTVSYSILPSHIGDVSIYTYVSVNPTNGAIYALRSF 0540

0541 NFEQTKAFEFKVLAKDSGAPAHLESNATVRVTVLDVNDNAPVIVLPTLQNDTAELQVPRN 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 NFEQTKAFEFKVLAKDSGAPAHLESNATVRVTVLDVNDNAPVIVLPTLQNDTAELQVPRN 0600

0601 AGLGYLVSTVRALDSDFGESGRLTYEIVDGNDDHLFEIDPSSGEIRTLHPFWEDVTPVVE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 AGLGYLVSTVRALDSDFGESGRLTYEIVDGNDDHLFEIDPSSGEIRTLHPFWEDVTPVVE 0660

0661 LVVKVTDHGKPTLSAVAKLIIRSVSGSLPEGVPRVNGEQHHWDMSLPLIVTLSTISIILL 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 LVVKVTDHGKPTLSAVAKLIIRSVSGSLPEGVPRVNGEQHHWDMSLPLIVTLSTISIILL 0720

0721 AAMITIAVKCKRENKEIRTYNCRIAEYSHPQLGGGKGKKKKINKNDIMLVQSEVEERNAM 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 AAMITIAVKCKRENKEIRTYNCRIAEYSHPQLGGGKGKKKKINKNDIMLVQSEVEERNAM 0780

0781 NVMNVVSSPSLATSPMYFDYQTRLPLSSPRSEVMYLKPASNNLTVPQGHAGCHTSFTGQG 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 NVMNVVSSPSLATSPMYFDYQTRLPLSSPRSEVMYLKPASNNLTVPQGHAGCHTSFTGQG 0840

0841 TNASETPATRMSIIQTDNFPAEPNYMGSRQQFVQSSSTFKDPERASLRDSGHGDSDQADS 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 TNASETPATRMSIIQTDNFPAEPNYMGSRQQFVQSSSTFKDPERASLRDSGHGDSDQADS 0900

0901 DQDTNKGSCCDMSVREALKMKTTSTKSQPLEQEPEECVNCTDECRVLGHSDRCWMPQFPA 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 DQDTNKGSCCDMSVREALKMKTTSTKSQPLEQEPEECVNCTDECRVLGHSDRCWMPQFPA 0960

0961 ANQAENADYRTNLFVPTVEANVETETYETVNPTGKKTFCTFGKDKREHTILIANVKPYLK 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 ANQAENADYRTNLFVPTVEANVETETYETVNPTGKKTFCTFGKDKREHTILIANVKPYLK 1020

1021 AKRALSPLLQEVPSASSSPTKACIEPCTSTKGSLDGCEAKPGALAEASSQYLPTDSQYLS 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 AKRALSPLLQEVPSASSSPTKACIEPCTSTKGSLDGCEAKPGALAEASSQYLPTDSQYLS 1080

1081 PSKQPRDPPFMASDQMARVFADVHSRASRDSSEMGAVLEQLDHPNRDLGRESVDAEEVVR 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 PSKQPRDPPFMASDQMARVFADVHSRASRDSSEMGAVLEQLDHPNRDLGRESVDAEEVVR 1140

1141 EIDKLLQDCRGNDPVAVRK 1159
     |||||||||||||||||||
1141 EIDKLLQDCRGNDPVAVRK 1159