Affine Alignment
 
Alignment between AQP4 (top ENST00000383168.9 323aa) and AQP4 (bottom ENST00000383168.9 323aa) score 32015

001 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG 060

061 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA 120

121 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS 180

181 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWENHWIYWVGPIIG 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWENHWIYWVGPIIG 240

241 AVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVH 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 AVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVH 300

301 VIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV 323
    |||||||||||||||||||||||
301 VIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV 323