Affine Alignment
 
Alignment between HOXD13 (top ENST00000392539.4 343aa) and HOXD13 (bottom ENST00000392539.4 343aa) score 33991

001 MSRAGSWDMDGLRADGGGAGGAPASSSSSSVAAAAASGQCRGFLSAPVFAGTHSGRAAAA 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSRAGSWDMDGLRADGGGAGGAPASSSSSSVAAAAASGQCRGFLSAPVFAGTHSGRAAAA 060

061 AAAAAAAAAAASGFAYPGTSERTGSSSSSSSSAVVAARPEAPPAKECPAPTPAAAAAAPP 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AAAAAAAAAAASGFAYPGTSERTGSSSSSSSSAVVAARPEAPPAKECPAPTPAAAAAAPP 120

121 SAPALGYGYHFGNGYYSCRMSHGVGLQQNALKSSPHASLGGFPVEKYMDVSGLASSSVPA 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 SAPALGYGYHFGNGYYSCRMSHGVGLQQNALKSSPHASLGGFPVEKYMDVSGLASSSVPA 180

181 NEVPARAKEVSFYQGYTSPYQHVPGYIDMVSTFGSGEPRHEAYISMEGYQSWTLANGWNS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 NEVPARAKEVSFYQGYTSPYQHVPGYIDMVSTFGSGEPRHEAYISMEGYQSWTLANGWNS 240

241 QVYCTKDQPQGSHFWKSSFPGDVALNQPDMCVYRRGRKKRVPYTKLQLKELENEYAINKF 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 QVYCTKDQPQGSHFWKSSFPGDVALNQPDMCVYRRGRKKRVPYTKLQLKELENEYAINKF 300

301 INKDKRRRISAATNLSERQVTIWFQNRRVKDKKIVSKLKDTVS 343
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 INKDKRRRISAATNLSERQVTIWFQNRRVKDKKIVSKLKDTVS 343