Affine Alignment
 
Alignment between GLI3 (top ENST00000395925.8 1580aa) and GLI3 (bottom ENST00000395925.8 1580aa) score 158650

0001 MEAQSHSSTTTEKKKVENSIVKCSTRTDVSEKAVASSTTSNEDESPGQTYHRERRNAITM 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MEAQSHSSTTTEKKKVENSIVKCSTRTDVSEKAVASSTTSNEDESPGQTYHRERRNAITM 0060

0061 QPQNVQGLSKVSEEPSTSSDERASLIKKEIHGSLPHVAEPSVPYRGTVFAMDPRNGYMEP 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 QPQNVQGLSKVSEEPSTSSDERASLIKKEIHGSLPHVAEPSVPYRGTVFAMDPRNGYMEP 0120

0121 HYHPPHLFPAFHPPVPIDARHHEGRYHYDPSPIPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHR 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 HYHPPHLFPAFHPPVPIDARHHEGRYHYDPSPIPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHR 0180

0181 NPTAASESPFSPPHPYINPYMDYIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDAPHAGVSPAEYYHQ 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 NPTAASESPFSPPHPYINPYMDYIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDAPHAGVSPAEYYHQ 0240

0241 MALLTGQRSPYADIIPSAATAGTGAIHMEYLHAMDSTRFSSPRLSARPSRKRTLSISPLS 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 MALLTGQRSPYADIIPSAATAGTGAIHMEYLHAMDSTRFSSPRLSARPSRKRTLSISPLS 0300

0301 DHSFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMH 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 DHSFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMH 0360

0361 QQILSRQQSLGSAFGHSPPLIHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSE 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 QQILSRQQSLGSAFGHSPPLIHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSE 0420

0421 SAVSSTGDPMHNKRSKIKPDEDLPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYET 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 SAVSSTGDPMHNKRSKIKPDEDLPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYET 0480

0481 NCHWEGCAREFDTQEQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRH 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 NCHWEGCAREFDTQEQLVHHINNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRH 0540

0541 TGEKPHKCTFEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRT 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 TGEKPHKCTFEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRT 0600

0601 HSNEKPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHS 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 HSNEKPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGSHS 0660

0661 QSRSPGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPI 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 QSRSPGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPI 0720

0721 SNYSNSGLELPLTDGGSIGDLSAIDETPIMDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKL 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 SNYSNSGLELPLTDGGSIGDLSAIDETPIMDSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKL 0780

0781 ERLKQVNGMFPRLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGPMTLLPGRSDLSGVDVTM 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 ERLKQVNGMFPRLNPILPPKAPAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGPMTLLPGRSDLSGVDVTM 0840

0841 LNMLNRRDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPIST 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 LNMLNRRDSSASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPIST 0900

0901 DASRRSSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGGPPPTPLPNMERMSLKTRLALL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 DASRRSSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGGPPPTPLPNMERMSLKTRLALL 0960

0961 GDALEPGVALPPVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQPHDAPGHGVRRASDPVRTGSEGLALPR 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 GDALEPGVALPPVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQPHDAPGHGVRRASDPVRTGSEGLALPR 1020

1021 VPRFSSLSSCNPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENVTLESLTM 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 VPRFSSLSSCNPPAMATSAEKRSLVLQNYTRPEGGQSRNFHSSPCPPSITENVTLESLTM 1080

1081 DADANLNDEDFLPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSALPDDSKVPHGPGDFDAPGLPDSHAG 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 DADANLNDEDFLPDDVVQYLNSQNQAGYEQHFPSALPDDSKVPHGPGDFDAPGLPDSHAG 1140

1141 QQFHALEQPCPEGSKTDLPIQWNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVPQTRAFGFCNGMVVH 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 QQFHALEQPCPEGSKTDLPIQWNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVPQTRAFGFCNGMVVH 1200

1201 PQNPLRSGPAGGYQTLGENSNPYGGPEHLMLHNSPGSGTSGNAFHEQPCKAPQYGNCLNR 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 PQNPLRSGPAGGYQTLGENSNPYGGPEHLMLHNSPGSGTSGNAFHEQPCKAPQYGNCLNR 1260

1261 QPVAPGALDGACGAGIQASKLKSTPMQGSGGQLNFGLPVAPNESAGSMVNGMQNQDPVGQ 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 QPVAPGALDGACGAGIQASKLKSTPMQGSGGQLNFGLPVAPNESAGSMVNGMQNQDPVGQ 1320

1321 GYLAHQLLGDSMQHPGAGRPGQQMLGQISATSHINIYQGPESCLPGAHGMGSQPSSLAVV 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 GYLAHQLLGDSMQHPGAGRPGQQMLGQISATSHINIYQGPESCLPGAHGMGSQPSSLAVV 1380

1381 RGYQPCASFGGSRRQAMPRDSLALQSGQLSDTSQTCRVNGIKMEMKGQPHPLCSNLQNYS 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 RGYQPCASFGGSRRQAMPRDSLALQSGQLSDTSQTCRVNGIKMEMKGQPHPLCSNLQNYS 1440

1441 GQFYDQTVGFSQQDTKAGSFSISDASCLLQGTSAKNSELLSPGANQVTSTVDSLDSHDLE 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 GQFYDQTVGFSQQDTKAGSFSISDASCLLQGTSAKNSELLSPGANQVTSTVDSLDSHDLE 1500

1501 GVQIDFDAIIDDGDHSSLMSGALSPSIIQNLSHSSSRLTTPRASLPFPALSMSTTNMAIG 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 GVQIDFDAIIDDGDHSSLMSGALSPSIIQNLSHSSSRLTTPRASLPFPALSMSTTNMAIG 1560

1561 DMSSLLTSLAEESKFLAVMQ 1580
     ||||||||||||||||||||
1561 DMSSLLTSLAEESKFLAVMQ 1580