Alignment between PCDHGA11 (top ENST00000398587.7 935aa) and PCDHGA11 (bottom ENST00000398587.7 935aa) score 90611

001 MANRLQRGDRSRLLLLLCIFLGTLRGFRARQIRYSVPEETEKGSFVGNISKDLGLEPREL 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MANRLQRGDRSRLLLLLCIFLGTLRGFRARQIRYSVPEETEKGSFVGNISKDLGLEPREL 060

061 AKRGVRIVSRGKTQLFAVNPRSGSLITAGRIDREELCETVSSCFLNMELLVEDTLKIYGV 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AKRGVRIVSRGKTQLFAVNPRSGSLITAGRIDREELCETVSSCFLNMELLVEDTLKIYGV 120

121 EVEIIDINDNAPSFQEDEVEIKVSEHAIPGARFALPNARDPDVGVNSLQSYQLSPNNYFS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 EVEIIDINDNAPSFQEDEVEIKVSEHAIPGARFALPNARDPDVGVNSLQSYQLSPNNYFS 180

181 LQLRGRTDGAKNPELVLEGSLDREKEAAHLLLLTALDGGDPIRKGAVPIRVVVLDVNDHI 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LQLRGRTDGAKNPELVLEGSLDREKEAAHLLLLTALDGGDPIRKGAVPIRVVVLDVNDHI 240

241 PMFTQSVYRVSVPENISSGTRVLMVNATDPDEGINGEVMYSFRNMESKASEIFQLDSQTG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 PMFTQSVYRVSVPENISSGTRVLMVNATDPDEGINGEVMYSFRNMESKASEIFQLDSQTG 300

301 EVQVRGSLDFEKYRFYEMEIQGQDGGGLFTTTTMLITVVDVNDNAPEITITSSINSILEN 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EVQVRGSLDFEKYRFYEMEIQGQDGGGLFTTTTMLITVVDVNDNAPEITITSSINSILEN 360

361 SPPGTVIALLNVQDQDSGENGQVSCFIPNHLPFKLEKTYGNYYKLITSRVLDRELVQSYN 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 SPPGTVIALLNVQDQDSGENGQVSCFIPNHLPFKLEKTYGNYYKLITSRVLDRELVQSYN 420

421 ITLTATDQGSPPLSAETHVWLNVADDNDNPPVFPHSSYSAYIPENNPRGASIFSVTALDP 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 ITLTATDQGSPPLSAETHVWLNVADDNDNPPVFPHSSYSAYIPENNPRGASIFSVTALDP 480

481 DSKQNALVTYSLTDDTVQGVPLSSYVSINSNTGVLYALQSFDYEQFRDLELRVIARDSGD 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 DSKQNALVTYSLTDDTVQGVPLSSYVSINSNTGVLYALQSFDYEQFRDLELRVIARDSGD 540

541 PPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDKDSG 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 PPLSSNVSLSLFVLDQNDNAPEILYPALPTDGSTGVELAPRSAEPGYLVTKVVAVDKDSG 600

601 QNAWLSYRLLKASEPGLFAVGEHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPLSATVT 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 QNAWLSYRLLKASEPGLFAVGEHTGEVRTARALLDRDALKQSLVVAVQDHGQPPLSATVT 660

661 LTVAVADSIPEVLADLGSLESLANSETSDLSLYLVVAVAAVSCIFLVFVIVLLALRLWRW 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 LTVAVADSIPEVLADLGSLESLANSETSDLSLYLVVAVAAVSCIFLVFVIVLLALRLWRW 720

721 HKSRLLQASEGGLAGMPTSHFVGVDGVQAFLQTYSHEVSLIADSQKSHLIFPQPNYGDTL 780
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 HKSRLLQASEGGLAGMPTSHFVGVDGVQAFLQTYSHEVSLIADSQKSHLIFPQPNYGDTL 780

781 ISQESCEKSEPLLIAEDSAIILGKCDPTSNQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGT 840
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
781 ISQESCEKSEPLLIAEDSAIILGKCDPTSNQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGT 840

841 WPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYI 900
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
841 WPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYI 900

901 PGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 935
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
901 PGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK 935