Affine Alignment
 
Alignment between CACNA1C (top ENST00000399655.6 2138aa) and CACNA1C (bottom ENST00000399655.6 2138aa) score 210938

0001 MVNENTRMYIPEENHQGSNYGSPRPAHANMNANAAAGLAPEHIPTPGAALSWQAAIDAAR 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MVNENTRMYIPEENHQGSNYGSPRPAHANMNANAAAGLAPEHIPTPGAALSWQAAIDAAR 0060

0061 QAKLMGSAGNATISTVSSTQRKRQQYGKPKKQGSTTATRPPRALLCLTLKNPIRRACISI 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 QAKLMGSAGNATISTVSSTQRKRQQYGKPKKQGSTTATRPPRALLCLTLKNPIRRACISI 0120

0121 VEWKPFEIIILLTIFANCVALAIYIPFPEDDSNATNSNLERVEYLFLIIFTVEAFLKVIA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 VEWKPFEIIILLTIFANCVALAIYIPFPEDDSNATNSNLERVEYLFLIIFTVEAFLKVIA 0180

0181 YGLLFHPNAYLRNGWNLLDFIIVVVGLFSAILEQATKADGANALGGKGAGFDVKALRAFR 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 YGLLFHPNAYLRNGWNLLDFIIVVVGLFSAILEQATKADGANALGGKGAGFDVKALRAFR 0240

0241 VLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVIIIYAIIGLELFMGKMHKTCYN 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 VLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVIIIYAIIGLELFMGKMHKTCYN 0300

0301 QEGIADVPAEDDPSPCALETGHGRQCQNGTVCKPGWDGPKHGITNFDNFAFAMLTVFQCI 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 QEGIADVPAEDDPSPCALETGHGRQCQNGTVCKPGWDGPKHGITNFDNFAFAMLTVFQCI 0360

0361 TMEGWTDVLYWVNDAVGRDWPWIYFVTLIIIGSFFVLNLVLGVLSGEFSKEREKAKARGD 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 TMEGWTDVLYWVNDAVGRDWPWIYFVTLIIIGSFFVLNLVLGVLSGEFSKEREKAKARGD 0420

0421 FQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEDEGMDEEKPRNMSMPTSETESVNTENVA 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 FQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEDEGMDEEKPRNMSMPTSETESVNTENVA 0480

0481 GGDIEGENCGARLAHRISKSKFSRYWRRWNRFCRRKCRAAVKSNVFYWLVIFLVFLNTLT 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 GGDIEGENCGARLAHRISKSKFSRYWRRWNRFCRRKCRAAVKSNVFYWLVIFLVFLNTLT 0540

0541 IASEHYNQPNWLTEVQDTANKALLALFTAEMLLKMYSLGLQAYFVSLFNRFDCFVVCGGI 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 IASEHYNQPNWLTEVQDTANKALLALFTAEMLLKMYSLGLQAYFVSLFNRFDCFVVCGGI 0600

0601 LETILVETKIMSPLGISVLRCVRLLRIFKITRYWNSLSNLVASLLNSVRSIASLLLLLFL 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 LETILVETKIMSPLGISVLRCVRLLRIFKITRYWNSLSNLVASLLNSVRSIASLLLLLFL 0660

0661 FIIIFSLLGMQLFGGKFNFDEMQTRRSTFDNFPQSLLTVFQILTGEDWNSVMYDGIMAYG 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 FIIIFSLLGMQLFGGKFNFDEMQTRRSTFDNFPQSLLTVFQILTGEDWNSVMYDGIMAYG 0720

0721 GPSFPGMLVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLTSAQKEEEEEKERKKLAR 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 GPSFPGMLVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLTSAQKEEEEEKERKKLAR 0780

0781 TASPEKKQELVEKPAVGESKEEKIELKSITADGESPPATKINMDDLQPNENEDKSPYPNP 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 TASPEKKQELVEKPAVGESKEEKIELKSITADGESPPATKINMDDLQPNENEDKSPYPNP 0840

0841 ETTGEEDEEEPEMPVGPRPRPLSELHLKEKAVPMPEASAFFIFSSNNRFRLQCHRIVNDT 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 ETTGEEDEEEPEMPVGPRPRPLSELHLKEKAVPMPEASAFFIFSSNNRFRLQCHRIVNDT 0900

0901 IFTNLILFFILLSSISLAAEDPVQHTSFRNHILFYFDIVFTTIFTIEIALKMTAYGAFLH 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 IFTNLILFFILLSSISLAAEDPVQHTSFRNHILFYFDIVFTTIFTIEIALKMTAYGAFLH 0960

0961 KGSFCRNYFNILDLLVVSVSLISFGIQSSAINVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQ 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 KGSFCRNYFNILDLLVVSVSLISFGIQSSAINVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQ 1020

1021 CVFVAIRTIGNIVIVTTLLQFMFACIGVQLFKGKLYTCSDSSKQTEAECKGNYITYKDGE 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 CVFVAIRTIGNIVIVTTLLQFMFACIGVQLFKGKLYTCSDSSKQTEAECKGNYITYKDGE 1080

1081 VDHPIIQPRSWENSKFDFDNVLAAMMALFTVSTFEGWPELLYRSIDSHTEDKGPIYNYRV 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 VDHPIIQPRSWENSKFDFDNVLAAMMALFTVSTFEGWPELLYRSIDSHTEDKGPIYNYRV 1140

1141 EISIFFIIYIIIIAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEQEYKNCELDKNQRQCVEYALKARPLR 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 EISIFFIIYIIIIAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEQEYKNCELDKNQRQCVEYALKARPLR 1200

1201 RYIPKNQHQYKVWYVVNSTYFEYLMFVLILLNTICLAMQHYGQSCLFKIAMNILNMLFTG 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 RYIPKNQHQYKVWYVVNSTYFEYLMFVLILLNTICLAMQHYGQSCLFKIAMNILNMLFTG 1260

1261 LFTVEMILKLIAFKPKHYFCDAWNTFDALIVVGSIVDIAITEVNPAEHTQCSPSMNAEEN 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 LFTVEMILKLIAFKPKHYFCDAWNTFDALIVVGSIVDIAITEVNPAEHTQCSPSMNAEEN 1320

1321 SRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTLLWTFIKSFQALPYVALLIVMLFFIYAVIGMQ 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 SRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTLLWTFIKSFQALPYVALLIVMLFFIYAVIGMQ 1380

1381 VFGKIALNDTTEINRNNNFQTFPQAVLLLFRCATGEAWQDIMLACMPGKKCAPESEPSNS 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 VFGKIALNDTTEINRNNNFQTFPQAVLLLFRCATGEAWQDIMLACMPGKKCAPESEPSNS 1440

1441 TEGETPCGSSFAVFYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILGPHHLDEFKRI 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 TEGETPCGSSFAVFYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILGPHHLDEFKRI 1500

1501 WAEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKLCPHRVACKRLVSMNMPLNSDGTVMFNA 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 WAEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKLCPHRVACKRLVSMNMPLNSDGTVMFNA 1560

1561 TLFALVRTALRIKTEGNLEQANEELRAIIKKIWKRTSMKLLDQVVPPAGDDEVTVGKFYA 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 TLFALVRTALRIKTEGNLEQANEELRAIIKKIWKRTSMKLLDQVVPPAGDDEVTVGKFYA 1620

1621 TFLIQEYFRKFKKRKEQGLVGKPSQRNALSLQAGLRTLHDIGPEIRRAISGDLTAEEELD 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 TFLIQEYFRKFKKRKEQGLVGKPSQRNALSLQAGLRTLHDIGPEIRRAISGDLTAEEELD 1680

1681 KAMKEAVSAASEDDIFRRAGGLFGNHVSYYQSDGRSAFPQTFTTQRPLHINKAGSSQGDT 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 KAMKEAVSAASEDDIFRRAGGLFGNHVSYYQSDGRSAFPQTFTTQRPLHINKAGSSQGDT 1740

1741 ESPSHEKLVDSTFTPSSYSSTGSNANINNANNTALGRLPRPAGYPSTVSTVEGHGPPLSP 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 ESPSHEKLVDSTFTPSSYSSTGSNANINNANNTALGRLPRPAGYPSTVSTVEGHGPPLSP 1800

1801 AIRVQEVAWKLSSNRCHSRESQAAMAGQEETSQDETYEVKMNHDTEACSEPSLLSTEMLS 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 AIRVQEVAWKLSSNRCHSRESQAAMAGQEETSQDETYEVKMNHDTEACSEPSLLSTEMLS 1860

1861 YQDDENRQLTLPEEDKRDIRQSPKRGFLRSASLGRRASFHLECLKRQKDRGGDISQKTVL 1920
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 YQDDENRQLTLPEEDKRDIRQSPKRGFLRSASLGRRASFHLECLKRQKDRGGDISQKTVL 1920

1921 PLHLVHHQALAVAGLSPLLQRSHSPASFPRPFATPPATPGSRGWPPQPVPTLRLEGVESS 1980
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1921 PLHLVHHQALAVAGLSPLLQRSHSPASFPRPFATPPATPGSRGWPPQPVPTLRLEGVESS 1980

1981 EKLNSSFPSIHCGSWAETTPGGGGSSAARRVRPVSLMVPSQAGAPGRQFHGSASSLVEAV 2040
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1981 EKLNSSFPSIHCGSWAETTPGGGGSSAARRVRPVSLMVPSQAGAPGRQFHGSASSLVEAV 2040

2041 LISEGLGQFAQDPKFIEVTTQELADACDMTIEEMESAADNILSGGAPQSPNGALLPFVNC 2100
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2041 LISEGLGQFAQDPKFIEVTTQELADACDMTIEEMESAADNILSGGAPQSPNGALLPFVNC 2100

2101 RDAGQDRAGGEEDAGCVRARGRPSEEELQDSRVYVSSL 2138
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101 RDAGQDRAGGEEDAGCVRARGRPSEEELQDSRVYVSSL 2138