Affine Alignment
 
Alignment between STON1-GTF2A1L (top ENST00000405008.5 1182aa) and GTF2A1L (bottom ENST00000403751.8 478aa) score 46455

0706 ACYNIQPKLYRSVIEDVIEGVRNLFAEEGIEEQVLKDLKQLWETKVLQSKATEDFFRNSI 0765
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0002 ACLNPVPKLYRSVIEDVIEGVRNLFAEEGIEEQVLKDLKQLWETKVLQSKATEDFFRNSI 0061

0766 QSPLFTLQLPHSLHQTLQSSTASLVIPAGRTLPSFTTAELGTSNSSANFTFPGYPIHVPA 0825
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0062 QSPLFTLQLPHSLHQTLQSSTASLVIPAGRTLPSFTTAELGTSNSSANFTFPGYPIHVPA 0121

0826 GVTLQTVSGHLYKVNVPIMVTETSGRAGILQHPIQQVFQQLGQPSVIQTSVPQLNPWSLQ 0885
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0122 GVTLQTVSGHLYKVNVPIMVTETSGRAGILQHPIQQVFQQLGQPSVIQTSVPQLNPWSLQ 0181

0886 ATTEKSQRIETVLQQPAILPSGPVDRKHLENATSDILVSPGNEHKIVPEALLCHQESSHY 0945
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0182 ATTEKSQRIETVLQQPAILPSGPVDRKHLENATSDILVSPGNEHKIVPEALLCHQESSHY 0241

0946 ISLPGVVFSPQVSQTNSNVESVLSGSASMAQNLHDESLSTSPHGALHQHVTDIQLHILKN 1005
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0242 ISLPGVVFSPQVSQTNSNVESVLSGSASMAQNLHDESLSTSPHGALHQHVTDIQLHILKN 0301

1006 RMYGCDSVKQPRNIEEPSNIPVSEKDSNSQVDLSIRVTDDDIGEIIQVDGSGDTSSNEEI 1065
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0302 RMYGCDSVKQPRNIEEPSNIPVSEKDSNSQVDLSIRVTDDDIGEIIQVDGSGDTSSNEEI 0361

1066 GSTRDADENEFLGNIDGGDLKVPEEEADSISNEDSATNSSDNEDPQVNIVEEDPLNSGDD 1125
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0362 GSTRDADENEFLGNIDGGDLKVPEEEADSISNEDSATNSSDNEDPQVNIVEEDPLNSGDD 0421

1126 VSEQDVPDLFDTDNVIVCQYDKIHRSKNKWKFYLKDGVMCFGGRDYVFAKAIGDAEW 1182
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0422 VSEQDVPDLFDTDNVIVCQYDKIHRSKNKWKFYLKDGVMCFGGRDYVFAKAIGDAEW 0478