Affine Alignment
 
Alignment between FNDC3B (top ENST00000415807.7 1204aa) and FNDC3B (bottom ENST00000415807.7 1204aa) score 123101

0001 MYVTMMMTDQIPLELPPLLNGEVAMMPHLVNGDAAQQVILVQVNPGETFTIRAEDGTLQC 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MYVTMMMTDQIPLELPPLLNGEVAMMPHLVNGDAAQQVILVQVNPGETFTIRAEDGTLQC 0060

0061 IQGPAEVPMMSPNGSIPPIHVPPGYISQVIEDSTGVRRVVVTPQSPECYPPSYPSAMSPT 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 IQGPAEVPMMSPNGSIPPIHVPPGYISQVIEDSTGVRRVVVTPQSPECYPPSYPSAMSPT 0120

0121 HHLPPYLTHHPHFIHNSHTAYYPPVTGPGDMPPQFFPQHHLPHTIYGEQEIIPFYGMSTY 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 HHLPPYLTHHPHFIHNSHTAYYPPVTGPGDMPPQFFPQHHLPHTIYGEQEIIPFYGMSTY 0180

0181 ITREDQYSKPPHKKLKDRQIDRQNRLNSPPSSIYKSSCTTVYNGYGKGHSGGSGGGGSGS 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 ITREDQYSKPPHKKLKDRQIDRQNRLNSPPSSIYKSSCTTVYNGYGKGHSGGSGGGGSGS 0240

0241 GPGIKKTERRARSSPKSNDSDLQEYELEVKRVQDILSGIEKPQVSNIQARAVVLSWAPPV 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 GPGIKKTERRARSSPKSNDSDLQEYELEVKRVQDILSGIEKPQVSNIQARAVVLSWAPPV 0300

0301 GLSCGPHSGLSFPYSYEVALSDKGRDGKYKIIYSGEELECNLKDLRPATDYHVRVYAMYN 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 GLSCGPHSGLSFPYSYEVALSDKGRDGKYKIIYSGEELECNLKDLRPATDYHVRVYAMYN 0360

0361 SVKGSCSEPVSFTTHSCAPECPFPPKLAHRSKSSLTLQWKAPIDNGSKITNYLLEWDEGK 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 SVKGSCSEPVSFTTHSCAPECPFPPKLAHRSKSSLTLQWKAPIDNGSKITNYLLEWDEGK 0420

0421 RNSGFRQCFFGSQKHCKLTKLCPAMGYTFRLAARNDIGTSGYSQEVVCYTLGNIPQMPSA 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 RNSGFRQCFFGSQKHCKLTKLCPAMGYTFRLAARNDIGTSGYSQEVVCYTLGNIPQMPSA 0480

0481 PRLVRAGITWVTLQWSKPEGCSPEEVITYTLEIQEDENDNLFHPKYTGEDLTCTVKNLKR 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 PRLVRAGITWVTLQWSKPEGCSPEEVITYTLEIQEDENDNLFHPKYTGEDLTCTVKNLKR 0540

0541 STQYKFRLTASNTEGKSCPSEVLVCTTSPDRPGPPTRPLVKGPVTSHGFSVKWDPPKDNG 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 STQYKFRLTASNTEGKSCPSEVLVCTTSPDRPGPPTRPLVKGPVTSHGFSVKWDPPKDNG 0600

0601 GSEILKYLLEITDGNSEANQWEVAYSGSATEYTFTHLKPGTLYKLRACCISTGGHSQCSE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 GSEILKYLLEITDGNSEANQWEVAYSGSATEYTFTHLKPGTLYKLRACCISTGGHSQCSE 0660

0661 SLPVRTLSIAPGQCRPPRVLGRPKHKEVHLEWDVPASESGCEVSEYSVEMTEPEDVASEV 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 SLPVRTLSIAPGQCRPPRVLGRPKHKEVHLEWDVPASESGCEVSEYSVEMTEPEDVASEV 0720

0721 YHGPELECTVGNLLPGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCKAPCISCTPD 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 YHGPELECTVGNLLPGTVYRFRVRALNDGGYGPYSDVSEITTAAGPPGQCKAPCISCTPD 0780

0781 GCVLVGWESPDSSGADISEYRLEWGEDEESLELIYHGTDTRFEIRDLLPAAQYCCRLQAF 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 GCVLVGWESPDSSGADISEYRLEWGEDEESLELIYHGTDTRFEIRDLLPAAQYCCRLQAF 0840

0841 NQAGAGPYSELVLCQTPASAPDPVSTLCVLEEEPLDAYPDSPSACLVLNWEEPCNNGSEI 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 NQAGAGPYSELVLCQTPASAPDPVSTLCVLEEEPLDAYPDSPSACLVLNWEEPCNNGSEI 0900

0901 LAYTIDLGDTSITVGNTTMHVMKDLLPETTYRIRIQAINEIGAGPFSQFIKAKTRPLPPL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 LAYTIDLGDTSITVGNTTMHVMKDLLPETTYRIRIQAINEIGAGPFSQFIKAKTRPLPPL 0960

0961 PPRLECAAAGPQSLKLKWGDSNSKTHAAEDIVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRL 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 PPRLECAAAGPQSLKLKWGDSNSKTHAAEDIVYTLQLEDRNKRFISIYRGPSHTYKVQRL 1020

1021 TEFTCYSFRIQAASEAGEGPFSETYTFSTTKSVPPTIKAPRVTQLEGNSCEILWETVPSM 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 TEFTCYSFRIQAASEAGEGPFSETYTFSTTKSVPPTIKAPRVTQLEGNSCEILWETVPSM 1080

1081 KGDPVNYILQVLVGRESEYKQVYKGEEATFQISGLQTNTDYRFRVCACRRCLDTSQELSG 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 KGDPVNYILQVLVGRESEYKQVYKGEEATFQISGLQTNTDYRFRVCACRRCLDTSQELSG 1140

1141 AFSPSAAFVLQRSEVMLTGDMGSLDDPKMKSMMPTDEQFAAIIVLGFATLSILFAFILQY 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 AFSPSAAFVLQRSEVMLTGDMGSLDDPKMKSMMPTDEQFAAIIVLGFATLSILFAFILQY 1200

1201 FLMK 1204
     ||||
1201 FLMK 1204