Affine Alignment
 
Alignment between CNTN4 (top ENST00000418658.6 1026aa) and CNTN4 (bottom ENST00000418658.6 1026aa) score 102505

0001 MRLPWELLVLQSFILCLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCEVKGNPKPHI 0060
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0061 RWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVSREAKLQFAY 0120
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0121 LDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSYQDNRRFVSQETGNLY 0180
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0181 IAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKIEVQFPETVPTAKG 0240
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0241 ATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHKSNGILEIPNFQQEDAGLYECVAENS 0300
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0301 RGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLLTRD 0360
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0361 RIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPDFSRTLLKRVTLVK 0420
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0421 VGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTCIAT 0480
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0481 NHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWSFNGHLI 0540
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0541 DFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGPPGPP 0600
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0601 EAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVSTVPELIDGKTFTAT 0660
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0661 VVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVITW 0720
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0721 ETVPEELQNGRGFGYVVAFRPYGKMIWMLTVLASADASRYVFRNESVHPFSPFEVKVGVF 0780
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0781 NNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWASPLEKNRGRIQGYEVKY 0840
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0841 WRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVTTRKPP 0900
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0901 PSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSSTSVIETNKTSVEL 0960
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0961 SLPFDEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIMISL 1020
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0961 SLPFDEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIMISL 1020

1021 TARSSL 1026
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