Affine Alignment
 
Alignment between HLA-DOB (top ENST00000438763.7 273aa) and HLA-DOB (bottom ENST00000438763.7 273aa) score 27341

001 MGSGWVPWVVALLVNLTRLDSSMTQGTDSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNL 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MGSGWVPWVVALLVNLTRLDSSMTQGTDSPEDFVIQAKADCYFTNGTEKVQFVVRFIFNL 060

061 EEYVRFDSDVGMFVALTKLGQPDAEQWNSRLDLLERSRQAVDGVCRHNYRLGAPFTVGRK 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 EEYVRFDSDVGMFVALTKLGQPDAEQWNSRLDLLERSRQAVDGVCRHNYRLGAPFTVGRK 120

121 VQPEVTVYPERTPLLHQHNLLHCSVTGFYPGDIKIKWFLNGQEERAGVMSTGPIRNGDWT 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 VQPEVTVYPERTPLLHQHNLLHCSVTGFYPGDIKIKWFLNGQEERAGVMSTGPIRNGDWT 180

181 FQTVVMLEMTPELGHVYTCLVDHSSLLSPVSVEWRAQSEYSWRKMLSGIAAFLLGLIFLL 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 FQTVVMLEMTPELGHVYTCLVDHSSLLSPVSVEWRAQSEYSWRKMLSGIAAFLLGLIFLL 240

241 VGIVIQLRAQKGYVRTQMSGNEVSRAVLLPQSC 273
    |||||||||||||||||||||||||||||||||
241 VGIVIQLRAQKGYVRTQMSGNEVSRAVLLPQSC 273