Affine Alignment
 
Alignment between CCDC39 (top ENST00000476379.6 941aa) and CCDC39 (bottom ENST00000476379.6 941aa) score 88863

001 MSSEFLAELHWEDGFAIPVANEENKLLEDQLSKLKDERASLQDELREYEERINSMTSHFK 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSSEFLAELHWEDGFAIPVANEENKLLEDQLSKLKDERASLQDELREYEERINSMTSHFK 060

061 NVKQELSITQSLCKARERETESEEHFKAIAQRELGRVKDEIQRLENEMASILEKKSDKEN 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 NVKQELSITQSLCKARERETESEEHFKAIAQRELGRVKDEIQRLENEMASILEKKSDKEN 120

121 GIFKATQKLDGLKCQMNWDQQALEAWLEESAHKDSDALTLQKYAQQDDNKIRALTLQLER 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 GIFKATQKLDGLKCQMNWDQQALEAWLEESAHKDSDALTLQKYAQQDDNKIRALTLQLER 180

181 LTLECNQKRKILDNELTETISAQLELDKAAQDFRKIHNERQELIKQWENTIEQMQKRDGD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LTLECNQKRKILDNELTETISAQLELDKAAQDFRKIHNERQELIKQWENTIEQMQKRDGD 240

241 IDNCALELARIKQETREKENLVKEKIKFLESEIGNNTEFEKRISVADRKLLKCRTAYQDH 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 IDNCALELARIKQETREKENLVKEKIKFLESEIGNNTEFEKRISVADRKLLKCRTAYQDH 300

301 ETSRIQLKGELDSLKATVNRTSSDLEALRKNISKIKKDIHEETARLQKTKNHNEIIQTKL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 ETSRIQLKGELDSLKATVNRTSSDLEALRKNISKIKKDIHEETARLQKTKNHNEIIQTKL 360

361 KEITEKTMSVEEKATNLEDMLKEEEKDVKEVDVQLNLIKGVLFKKAQELQTETMKEKAVL 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 KEITEKTMSVEEKATNLEDMLKEEEKDVKEVDVQLNLIKGVLFKKAQELQTETMKEKAVL 420

421 SEIEGTRSSLKHLNHQLQKLDFETLKQQEIMYSQDFHIQQVERRMSRLKGEINSEEKQAL 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 SEIEGTRSSLKHLNHQLQKLDFETLKQQEIMYSQDFHIQQVERRMSRLKGEINSEEKQAL 480

481 EAKIVELRKSLEEKKSTCGLLETQIKKLHNDLYFIKKAHSKNSDEKQSLMTKINELNLFI 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 EAKIVELRKSLEEKKSTCGLLETQIKKLHNDLYFIKKAHSKNSDEKQSLMTKINELNLFI 540

541 DRSEKELDKAKGFKQDLMIEDNLLKLEVKRTREMLHSKAEEVLSLEKRKQQLYTAMEERT 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 DRSEKELDKAKGFKQDLMIEDNLLKLEVKRTREMLHSKAEEVLSLEKRKQQLYTAMEERT 600

601 EEIKVHKTMLASQIRYVDQERENISTEFRERLSKIEKLKNRYEILTVVMLPPEGEEEKTQ 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 EEIKVHKTMLASQIRYVDQERENISTEFRERLSKIEKLKNRYEILTVVMLPPEGEEEKTQ 660

661 AYYVIKAAQEKEELQREGDCLDAKINKAEKEIYALENTLQVLNSCNNNYKQSFKKVTPSS 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 AYYVIKAAQEKEELQREGDCLDAKINKAEKEIYALENTLQVLNSCNNNYKQSFKKVTPSS 720

721 DEYELKIQLEEQKRAVDEKYRYKQRQIRELQEDIQSMENTLDVIEHLANNVKEKLSEKQA 780
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 DEYELKIQLEEQKRAVDEKYRYKQRQIRELQEDIQSMENTLDVIEHLANNVKEKLSEKQA 780

781 YSFQLSKETEEQKPKLERVTKQCAKLTKEIRLLKDTKDETMEEQDIKLREMKQFHKVIDE 840
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
781 YSFQLSKETEEQKPKLERVTKQCAKLTKEIRLLKDTKDETMEEQDIKLREMKQFHKVIDE 840

841 MLVDIIEENTEIRIILQTYFQQSGLELPTASTKGSRQSSRSPSHTSLSARSSRSTSTSTS 900
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
841 MLVDIIEENTEIRIILQTYFQQSGLELPTASTKGSRQSSRSPSHTSLSARSSRSTSTSTS 900

901 QSSIKVLELKFPASSSLVGSPSRPSSASSSSSNVKSKKSSK 941
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901 QSSIKVLELKFPASSSLVGSPSRPSSASSSSSNVKSKKSSK 941