Affine Alignment
  
Alignment between NKX6-3 (top ENST00000518699.4 265aa) and NKX6-3 (bottom ENST00000518699.4 265aa) score 26961

001 MESNLQGTFLLNNTPLAQFPEMKAPVCQYSVQNSFYKLSPPGLGPQLAAGTPHGITDILS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MESNLQGTFLLNNTPLAQFPEMKAPVCQYSVQNSFYKLSPPGLGPQLAAGTPHGITDILS 060

061 RPVAAPNNSLLSGYPHVAGFGGLSSQGVYYSPQVGNFSKAGNEYPTRTRNCWADTGQDWR 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 RPVAAPNNSLLSGYPHVAGFGGLSSQGVYYSPQVGNFSKAGNEYPTRTRNCWADTGQDWR 120

121 GGRQCSNTPDPLSDSIHKKKHTRPTFTGHQIFALEKTFEQTKYLAGPERARLAYSLGMTE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 GGRQCSNTPDPLSDSIHKKKHTRPTFTGHQIFALEKTFEQTKYLAGPERARLAYSLGMTE 180

181 SQVKVWFQNRRTKWRKKSALEPSSSTPRAPGGAGAGAGGDRAPSENEDDEYNKPLDPDSD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 SQVKVWFQNRRTKWRKKSALEPSSSTPRAPGGAGAGAGGDRAPSENEDDEYNKPLDPDSD 240

241 DEKIRLLLRKHRAAFSVLSLGAHSV 265
    |||||||||||||||||||||||||
241 DEKIRLLLRKHRAAFSVLSLGAHSV 265