Affine Alignment
 
Alignment between PCDHA6 (top ENST00000529310.6 950aa) and PCDHA10 (bottom ENST00000307360.6 948aa) score 74803

009 LGKQCLLLPLLLLAAWKVGSGQLHYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRMAS 068
    || ||||| |||||||+|||||||||| |||+|||||||||||||||||||| ||||+||
008 LGVQCLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEARHGTFVGRIAQDLGLELAELVQRLFRVAS 067

069 KDREDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVRDIND 128
    |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||+||||
068 KRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSVECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDIND 127

129 NPPLFPVEEQRVLIYESRLPDSVFPLEGASDADVGSNSILTYKLSSSEYFGLDVKINSDD 188
    ||| | | ||++ | |||| || |||||||||||| |++|||||| +||| ||+    | 
128 NPPRFSVTEQKLSIPESRLLDSRFPLEGASDADVGENALLTYKLSPNEYFVLDIINKKDK 187

189 NKQIGLLLKKSLDREEAPAHNLFLTATDGGKPELTGTVQLLVTVLDVNDNAPTFEQSEYE 248
    +|   |+|+| ||||| |   | |||||||||| ||+| ||+ ||| ||||| |++  ||
188 DKFPVLVLRKLLDREENPQLKLLLTATDGGKPEFTGSVSLLILVLDANDNAPIFDRPVYE 247

249 VRIFENADNGTTVIRLNASDRDEGANGAISYSFNSLVAAMVIDHFSIDRNTGEIVIRGNL 308
    |+++||  | | |||||||| ||| |  + |||+|||   +   | |+  |||| +   +
248 VKMYENQVNQTLVIRLNASDSDEGINKEMMYSFSSLVPPTIRRKFWINERTGEIKVNDAI 307

309 DFEQENLYKILIDATDKGHPPMAGHCTVLVRILDKNDNVPEIALTSLSLPVREDAQFGTV 368
    |||  | |+| +| ||||+||| ||||||| +||+||| ||+ +|||||||+|||| |||
308 DFEDSNTYEIHVDVTDKGNPPMVGHCTVLVELLDENDNSPEVIVTSLSLPVKEDAQVGTV 367

369 IALISVNDLDSGANGQVNCSLTPHVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTAR 428
    ||||||+| |||||||| ||||||||||||||+||||||||||||||| |||||||||||
368 IALISVSDHDSGANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRERVSAYELVVTAR 427

429 DGGSPSLWATASLSVEVADMNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSARDADAQENA 488
    ||||| ||||||+||||||+||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
428 DGGSPPLWATASVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQENA 487

489 LVSYSLVERRVGERALSSYISVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSN 548
    ||||||||||+|||+||||+||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
488 LVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDGGVPPLGSN 547

549 VTLQVFVLDENDNAPALLAPRVGGTGGAVSELVPRSLGAGQVVAKVRAVDADSGYNAWLS 608
    +||||||||||||||||||   |  |||||||| ||+ || |||||||||||||||||||
548 LTLQVFVLDENDNAPALLASPAGSAGGAVSELVLRSVVAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLS 607

609 YELQPPASSARFPFRVGLYTGEISTTRVLDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALTATATVLVS 668
    ||||  |  || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||+||||||||||
608 YELQSAAVGARIPFRVGLYTGEISTTRALDETDSPRQRLLVLVKDHGEPSLTATATVLVS 667

669 LVESGQAPKASSRASVGAAGPEAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPT 728
    |||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
668 LVEGSQAPKASSRASVGVA-PEVALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAAPT 726

729 EGACTADKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGPPKMDLMAFSPSLSPCPIMMGKAEN 788
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||++    |+
727 EGACGPVKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGLPKADLMAFSPSLPPCPMVDVDGED 786

789 QDLNEDHDAKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPE 848
    | +  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
787 QSIGGDHSRKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPE 846

849 PEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQI 908
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
847 PEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQI 906

909 DKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ 950
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907 DKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ 948