Affine Alignment
 
Alignment between HOXC11 (top ENST00000546378.1 304aa) and HOXC11 (bottom ENST00000546378.1 304aa) score 31046

001 MFNSVNLGNFCSPSRKERGADFGERGSCASNLYLPSCTYYMPEFSTVSSFLPQAPSRQIS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MFNSVNLGNFCSPSRKERGADFGERGSCASNLYLPSCTYYMPEFSTVSSFLPQAPSRQIS 060

061 YPYSAQVPPVREVSYGLEPSGKWHHRNSYSSCYAAADELMHRECLPPSTVTEILMKNEGS 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 YPYSAQVPPVREVSYGLEPSGKWHHRNSYSSCYAAADELMHRECLPPSTVTEILMKNEGS 120

121 YGGHHHPSAPHATPAGFYSSVNKNSVLPQAFDRFFDNAYCGGGDPPAEPPCSGKGEAKGE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 YGGHHHPSAPHATPAGFYSSVNKNSVLPQAFDRFFDNAYCGGGDPPAEPPCSGKGEAKGE 180

181 PEAPPASGLASRAEAGAEAEAEEENTNPSSSGSAHSVAKEPAKGAAPNAPRTRKKRCPYS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 PEAPPASGLASRAEAGAEAEAEEENTNPSSSGSAHSVAKEPAKGAAPNAPRTRKKRCPYS 240

241 KFQIRELEREFFFNVYINKEKRLQLSRMLNLTDRQVKIWFQNRRMKEKKLSRDRLQYFSG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 KFQIRELEREFFFNVYINKEKRLQLSRMLNLTDRQVKIWFQNRRMKEKKLSRDRLQYFSG 300

301 NPLL 304
    ||||
301 NPLL 304